More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0912 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  100 
 
 
465 aa  924    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  98.71 
 
 
465 aa  915    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  83.37 
 
 
467 aa  780    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  100 
 
 
465 aa  924    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  43.34 
 
 
453 aa  322  9.999999999999999e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  39 
 
 
456 aa  317  4e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  42.66 
 
 
448 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3262  peptidase M20  42.76 
 
 
472 aa  302  9e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4319  hypothetical protein  41.36 
 
 
445 aa  301  2e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.899733  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  37.04 
 
 
453 aa  300  3e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  40 
 
 
458 aa  298  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1518  peptidase M20  41.55 
 
 
448 aa  293  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0128232  decreased coverage  0.000123266 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  40.35 
 
 
484 aa  293  3e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14090  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  41.92 
 
 
469 aa  293  4e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0820  peptidase M20  39.32 
 
 
446 aa  292  8e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193713  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  38.65 
 
 
453 aa  292  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  38.65 
 
 
453 aa  292  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12240  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  42.34 
 
 
488 aa  291  1e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  38.65 
 
 
453 aa  292  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4666  Beta-Ala-His dipeptidase  39.6 
 
 
455 aa  291  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  hitchhiker  0.00791318 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  37.3 
 
 
462 aa  291  2e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2156  hypothetical protein  43.05 
 
 
460 aa  290  4e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366159  normal  0.0201539 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16280  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  41.27 
 
 
456 aa  290  5.0000000000000004e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.78366 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  42.76 
 
 
460 aa  288  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  41.18 
 
 
470 aa  286  5e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  39.18 
 
 
445 aa  283  6.000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2219  peptidase M20  39.72 
 
 
476 aa  283  6.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342655  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  37.5 
 
 
463 aa  280  6e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  36.24 
 
 
456 aa  278  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  41.22 
 
 
452 aa  278  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1881  peptidase M20  41.49 
 
 
464 aa  277  2e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676993 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  36.34 
 
 
456 aa  277  3e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  38.55 
 
 
455 aa  275  2.0000000000000002e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  34.44 
 
 
460 aa  273  4.0000000000000004e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  34.67 
 
 
453 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  36.55 
 
 
451 aa  273  5.000000000000001e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  34.8 
 
 
463 aa  273  5.000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  38.67 
 
 
440 aa  272  1e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15560  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  40.32 
 
 
447 aa  271  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471223  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  36.2 
 
 
455 aa  266  8e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  35.31 
 
 
459 aa  263  4e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  34.8 
 
 
465 aa  263  4.999999999999999e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2021  peptidase M20  39.78 
 
 
469 aa  257  3e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.89722  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2089  peptidase M20  39.77 
 
 
464 aa  257  4e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0261  peptidase M20  37.47 
 
 
467 aa  252  9.000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1438  peptidase M20  36.87 
 
 
457 aa  252  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368913  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  35.18 
 
 
485 aa  250  5e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0408  peptidase dimerization domain protein  34.47 
 
 
455 aa  248  1e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  32.81 
 
 
459 aa  246  6.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  35.41 
 
 
475 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0824  hypothetical protein  33.79 
 
 
455 aa  244  3e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  34.21 
 
 
467 aa  243  7e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  34.97 
 
 
456 aa  241  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  35.54 
 
 
460 aa  241  2e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  34.53 
 
 
469 aa  240  5e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  35.73 
 
 
458 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1926  peptidase M20  35.37 
 
 
447 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.21832  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  31.82 
 
 
458 aa  233  4.0000000000000004e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  33.63 
 
 
452 aa  232  1e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  35.14 
 
 
472 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  35.95 
 
 
464 aa  229  7e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6602  hypothetical protein  34.98 
 
 
449 aa  227  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  32.46 
 
 
474 aa  223  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  31.54 
 
 
465 aa  222  9.999999999999999e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3301  hypothetical protein  39.49 
 
 
449 aa  219  7e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653299  normal  0.0124999 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  34.76 
 
 
460 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  33.26 
 
 
457 aa  217  4e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  34.84 
 
 
451 aa  216  5e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  34.36 
 
 
461 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  34.05 
 
 
461 aa  211  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3030  hypothetical protein  32.7 
 
 
467 aa  211  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0480  Beta-Ala-His dipeptidase  33.74 
 
 
453 aa  210  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  34.33 
 
 
460 aa  210  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  35.52 
 
 
496 aa  209  8e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  34.4 
 
 
468 aa  208  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  34.33 
 
 
461 aa  207  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  34.62 
 
 
462 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  31.6 
 
 
465 aa  207  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  31.55 
 
 
468 aa  206  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  32.14 
 
 
468 aa  206  8e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  34.12 
 
 
461 aa  206  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  35.96 
 
 
481 aa  205  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  33.41 
 
 
461 aa  205  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  32.54 
 
 
470 aa  205  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  33.41 
 
 
462 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  34.41 
 
 
462 aa  205  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  30.2 
 
 
457 aa  204  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  33.85 
 
 
479 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  32.68 
 
 
456 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  35.23 
 
 
462 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  32.33 
 
 
471 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  33.55 
 
 
468 aa  201  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3528  hypothetical protein  35.66 
 
 
468 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  34.11 
 
 
464 aa  200  5e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  33.56 
 
 
461 aa  199  6e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  33.11 
 
 
469 aa  199  7e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  32.98 
 
 
468 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  33.62 
 
 
463 aa  199  9e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  33.33 
 
 
468 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  33.12 
 
 
460 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>