More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3262 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3262  peptidase M20  100 
 
 		 472 aa  921    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15560  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  67.2 
 
 		 447 aa  526  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471223  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2089  peptidase M20  67.87 
 
 		 464 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  60.17 
 
 		 484 aa  509  1e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1881  peptidase M20  64.48 
 
 		 464 aa  504  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676993 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  62.04 
 
 		 445 aa  500  1e-140  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14090  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  62.67 
 
 		 469 aa  498  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2021  peptidase M20  61.77 
 
 		 469 aa  484  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.89722  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2219  peptidase M20  59.1 
 
 		 476 aa  481  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342655  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  58.28 
 
 		 453 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  58.28 
 
 		 453 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  58.28 
 
 		 453 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  56.92 
 
 		 453 aa  457  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  56.86 
 
 		 448 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16280  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  58.13 
 
 		 456 aa  450  1e-125  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.78366 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4319  hypothetical protein  56.6 
 
 		 445 aa  449  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.899733  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  58.16 
 
 		 460 aa  444  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  57.11 
 
 		 470 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12240  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  55.58 
 
 		 488 aa  437  1e-121  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4666  Beta-Ala-His dipeptidase  54.22 
 
 		 455 aa  425  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  hitchhiker  0.00791318 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  55.79 
 
 		 452 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2156  hypothetical protein  56.2 
 
 		 460 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366159  normal  0.0201539 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0824  hypothetical protein  46.31 
 
 		 455 aa  364  2e-99  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0820  peptidase M20  47.33 
 
 		 446 aa  352  8.999999999999999e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0408  peptidase dimerization domain protein  44.98 
 
 		 455 aa  351  1e-95  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0261  peptidase M20  43.64 
 
 		 467 aa  310  4e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6602  hypothetical protein  42.95 
 
 		 449 aa  306  8.000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  42 
 
 		 467 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  42.76 
 
 		 465 aa  303  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  42.76 
 
 		 465 aa  303  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  41.7 
 
 		 465 aa  302  7.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1518  peptidase M20  44.11 
 
 		 448 aa  291  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0128232  decreased coverage  0.000123266 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1926  peptidase M20  43.02 
 
 		 447 aa  280  3e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.21832  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0480  Beta-Ala-His dipeptidase  40.79 
 
 		 453 aa  270  2.9999999999999997e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1438  peptidase M20  40.05 
 
 		 457 aa  260  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3301  hypothetical protein  41.54 
 
 		 449 aa  250  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653299  normal  0.0124999 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3706  peptidase M20  42.21 
 
 		 455 aa  247  3e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.114919  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  34.73 
 
 		 465 aa  234  3e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  34.79 
 
 		 465 aa  228  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  37.17 
 
 		 455 aa  223  8e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  33.8 
 
 		 456 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  37.12 
 
 		 469 aa  218  2.9999999999999998e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  34.11 
 
 		 453 aa  213  7e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  35.11 
 
 		 463 aa  209  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  34.47 
 
 		 458 aa  207  5e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  35.35 
 
 		 440 aa  206  6e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  33.77 
 
 		 452 aa  206  8e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  33.25 
 
 		 462 aa  204  3e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  34.42 
 
 		 456 aa  203  5e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  32.96 
 
 		 456 aa  199  7e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  32.41 
 
 		 453 aa  197  5.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.9 
 
 		 463 aa  196  7e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  32.52 
 
 		 475 aa  195  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  35.4 
 
 		 460 aa  195  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  32.24 
 
 		 456 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  30.7 
 
 		 458 aa  191  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  33.33 
 
 		 461 aa  189  8e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  33.26 
 
 		 458 aa  187  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  32.74 
 
 		 462 aa  187  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  32.72 
 
 		 470 aa  186  8e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  33.18 
 
 		 485 aa  186  8e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  31.39 
 
 		 459 aa  186  8e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  31.92 
 
 		 468 aa  186  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  32.72 
 
 		 457 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  34.44 
 
 		 461 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  30.82 
 
 		 460 aa  185  2.0000000000000003e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  31.59 
 
 		 457 aa  184  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  31.13 
 
 		 455 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  32.22 
 
 		 472 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3030  hypothetical protein  32 
 
 		 467 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  33.05 
 
 		 468 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  33.94 
 
 		 460 aa  180  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  34.44 
 
 		 461 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  33.42 
 
 		 468 aa  179  8e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  33.77 
 
 		 460 aa  179  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  32.33 
 
 		 451 aa  179  1e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  34.76 
 
 		 479 aa  178  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  30.67 
 
 		 465 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  34.22 
 
 		 461 aa  178  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  34.09 
 
 		 464 aa  177  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  30.56 
 
 		 471 aa  177  3e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  32.91 
 
 		 461 aa  177  4e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  31.21 
 
 		 459 aa  177  4e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  32.92 
 
 		 468 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  32.35 
 
 		 470 aa  176  8e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  29.91 
 
 		 484 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3528  hypothetical protein  32.92 
 
 		 468 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  31.56 
 
 		 462 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1937  hypothetical protein  32.42 
 
 		 468 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.293644  normal  0.311555 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  31.78 
 
 		 462 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0859  hypothetical protein  30.46 
 
 		 463 aa  173  7.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  32.65 
 
 		 468 aa  172  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  32.82 
 
 		 464 aa  172  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  30.92 
 
 		 471 aa  172  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  31.57 
 
 		 457 aa  172  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  30.92 
 
 		 471 aa  172  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  31.19 
 
 		 468 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  31.94 
 
 		 462 aa  170  6e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  31.32 
 
 		 469 aa  169  7e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  29.62 
 
 		 460 aa  169  9e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>