More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1881 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1881  peptidase M20  100 
 
 
464 aa  885    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676993 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2089  peptidase M20  74.76 
 
 
464 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15560  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  71.85 
 
 
447 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471223  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  64.29 
 
 
445 aa  545  1e-154  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  61.44 
 
 
484 aa  533  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2021  peptidase M20  67.02 
 
 
469 aa  528  1e-149  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.89722  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3262  peptidase M20  64.76 
 
 
472 aa  517  1.0000000000000001e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2219  peptidase M20  60.84 
 
 
476 aa  513  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342655  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14090  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  63.27 
 
 
469 aa  511  1e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  57.7 
 
 
453 aa  472  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  57.85 
 
 
448 aa  467  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4319  hypothetical protein  56.85 
 
 
445 aa  460  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.899733  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12240  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  56.96 
 
 
488 aa  451  1e-125  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  55.13 
 
 
453 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  55.13 
 
 
453 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  55.13 
 
 
453 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  55.96 
 
 
460 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2156  hypothetical protein  57.52 
 
 
460 aa  433  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366159  normal  0.0201539 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16280  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  54.91 
 
 
456 aa  430  1e-119  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.78366 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  54.85 
 
 
470 aa  430  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4666  Beta-Ala-His dipeptidase  53.71 
 
 
455 aa  424  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  hitchhiker  0.00791318 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  54.4 
 
 
452 aa  420  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0408  peptidase dimerization domain protein  49.22 
 
 
455 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0824  hypothetical protein  47.38 
 
 
455 aa  392  1e-108  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0820  peptidase M20  47.48 
 
 
446 aa  349  7e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193713  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0261  peptidase M20  46.05 
 
 
467 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1518  peptidase M20  43.4 
 
 
448 aa  303  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0128232  decreased coverage  0.000123266 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0480  Beta-Ala-His dipeptidase  41.63 
 
 
453 aa  300  3e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6602  hypothetical protein  43.18 
 
 
449 aa  299  6e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  41.78 
 
 
467 aa  296  6e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3301  hypothetical protein  43.58 
 
 
449 aa  293  4e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653299  normal  0.0124999 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  40.95 
 
 
465 aa  289  8e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  40.95 
 
 
465 aa  289  8e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  40.95 
 
 
465 aa  287  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1926  peptidase M20  41.48 
 
 
447 aa  279  1e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.21832  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1438  peptidase M20  40.09 
 
 
457 aa  278  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368913  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3706  peptidase M20  46.09 
 
 
455 aa  276  4e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.114919  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  34.56 
 
 
465 aa  238  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  34.79 
 
 
456 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  34.4 
 
 
453 aa  234  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  36.57 
 
 
440 aa  231  3e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  36.77 
 
 
455 aa  223  6e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  33.73 
 
 
460 aa  215  9.999999999999999e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  35.43 
 
 
465 aa  213  4.9999999999999996e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  32.2 
 
 
456 aa  213  7.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  31.91 
 
 
471 aa  213  7.999999999999999e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  32.08 
 
 
463 aa  212  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  31.65 
 
 
453 aa  211  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  32.05 
 
 
469 aa  207  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  32.29 
 
 
465 aa  207  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  35.68 
 
 
469 aa  206  9e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  32.89 
 
 
455 aa  205  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  32.81 
 
 
475 aa  204  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  31.69 
 
 
456 aa  203  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  32.86 
 
 
462 aa  203  6e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  31.57 
 
 
471 aa  202  8e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  31.57 
 
 
471 aa  202  8e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  32.56 
 
 
462 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  31.33 
 
 
468 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  32.59 
 
 
456 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  32.82 
 
 
463 aa  201  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  34.27 
 
 
458 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  33.79 
 
 
485 aa  200  5e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  34.58 
 
 
468 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  31.57 
 
 
462 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  32.43 
 
 
458 aa  198  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  34.67 
 
 
460 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  32.34 
 
 
470 aa  196  6e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  32.05 
 
 
462 aa  196  6e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  33.04 
 
 
461 aa  195  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  32.56 
 
 
463 aa  195  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  33.03 
 
 
461 aa  194  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  32.32 
 
 
459 aa  192  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  32.24 
 
 
458 aa  190  4e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  31.75 
 
 
451 aa  190  5e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  33.03 
 
 
461 aa  188  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  35.35 
 
 
464 aa  188  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  29.08 
 
 
484 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  32.89 
 
 
460 aa  187  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  31.53 
 
 
462 aa  187  4e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  34.14 
 
 
460 aa  187  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  33.03 
 
 
461 aa  186  7e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  31.45 
 
 
457 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  33.42 
 
 
470 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  34.57 
 
 
468 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  30 
 
 
459 aa  183  5.0000000000000004e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  31.71 
 
 
461 aa  183  6e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  31.97 
 
 
452 aa  182  8.000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  32.83 
 
 
457 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  32.67 
 
 
468 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  32.75 
 
 
461 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  28.78 
 
 
460 aa  180  4.999999999999999e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  32.08 
 
 
468 aa  177  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  33.04 
 
 
468 aa  177  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  32.62 
 
 
472 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1937  hypothetical protein  33.25 
 
 
468 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.293644  normal  0.311555 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  31.67 
 
 
468 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3528  hypothetical protein  31.45 
 
 
468 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  30.26 
 
 
457 aa  171  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  32.02 
 
 
488 aa  170  6e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>