More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6602 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6602  hypothetical protein  100 
 
 		 449 aa  890    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0480  Beta-Ala-His dipeptidase  62.9 
 
 		 453 aa  540  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3301  hypothetical protein  60.14 
 
 		 449 aa  493  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653299  normal  0.0124999 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0820  peptidase M20  48.54 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193713  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3706  peptidase M20  53.5 
 
 		 455 aa  372  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.114919  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1518  peptidase M20  48.98 
 
 		 448 aa  346  5e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0128232  decreased coverage  0.000123266 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  44.47 
 
 		 460 aa  323  3e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  41.83 
 
 		 445 aa  317  3e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3262  peptidase M20  42.95 
 
 		 472 aa  311  2e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  41.93 
 
 		 453 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  41.93 
 
 		 453 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  41.93 
 
 		 453 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  43.28 
 
 		 452 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14090  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  41.95 
 
 		 469 aa  306  7e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15560  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  42.76 
 
 		 447 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  42.13 
 
 		 470 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  41.43 
 
 		 453 aa  303  6.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0261  peptidase M20  42.41 
 
 		 467 aa  302  9e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  41.46 
 
 		 448 aa  300  4e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1881  peptidase M20  43.75 
 
 		 464 aa  298  1e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676993 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4319  hypothetical protein  40.04 
 
 		 445 aa  298  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.899733  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2089  peptidase M20  42.96 
 
 		 464 aa  290  3e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2156  hypothetical protein  42.47 
 
 		 460 aa  290  4e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366159  normal  0.0201539 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16280  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  41.27 
 
 		 456 aa  288  1e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.78366 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1926  peptidase M20  43.44 
 
 		 447 aa  286  5.999999999999999e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.21832  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12240  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  41.31 
 
 		 488 aa  285  2.0000000000000002e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1438  peptidase M20  42.3 
 
 		 457 aa  282  9e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  38.07 
 
 		 484 aa  280  3e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4666  Beta-Ala-His dipeptidase  39.11 
 
 		 455 aa  274  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  hitchhiker  0.00791318 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2219  peptidase M20  39.17 
 
 		 476 aa  264  3e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342655  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0824  hypothetical protein  35.92 
 
 		 455 aa  263  4e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0408  peptidase dimerization domain protein  36.72 
 
 		 455 aa  263  6e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2021  peptidase M20  40.5 
 
 		 469 aa  248  1e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.89722  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  36.04 
 
 		 467 aa  232  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  35.36 
 
 		 465 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  34.98 
 
 		 465 aa  230  4e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  34.98 
 
 		 465 aa  230  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  36.91 
 
 		 455 aa  224  2e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  34.17 
 
 		 456 aa  216  5e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  33.33 
 
 		 440 aa  197  4.0000000000000005e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  32.33 
 
 		 463 aa  189  9e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  32.61 
 
 		 458 aa  189  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  32.31 
 
 		 453 aa  187  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  31.86 
 
 		 465 aa  186  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  30.91 
 
 		 459 aa  182  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  30.53 
 
 		 465 aa  182  1e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  31.31 
 
 		 453 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  30.98 
 
 		 465 aa  177  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  31.86 
 
 		 470 aa  177  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  32.77 
 
 		 456 aa  176  8e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  30.28 
 
 		 455 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  29.32 
 
 		 459 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  32.97 
 
 		 470 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  31.07 
 
 		 456 aa  172  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  33.11 
 
 		 461 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  32.83 
 
 		 457 aa  170  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  31.27 
 
 		 462 aa  170  6e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  31.83 
 
 		 461 aa  169  7e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  32.96 
 
 		 456 aa  169  7e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  31.71 
 
 		 485 aa  169  7e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  35.02 
 
 		 488 aa  169  8e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.58 
 
 		 456 aa  167  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.81 
 
 		 475 aa  166  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  29.95 
 
 		 460 aa  166  6.9999999999999995e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.83 
 
 		 463 aa  165  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  30.16 
 
 		 452 aa  164  4.0000000000000004e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  33.48 
 
 		 464 aa  163  6e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  28.86 
 
 		 471 aa  163  7e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  31.84 
 
 		 458 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  31.83 
 
 		 472 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0859  hypothetical protein  29.93 
 
 		 463 aa  160  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  30.33 
 
 		 469 aa  158  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  30.75 
 
 		 460 aa  157  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  29.98 
 
 		 462 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  30.93 
 
 		 462 aa  157  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  30.45 
 
 		 463 aa  156  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  30.93 
 
 		 461 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  30.04 
 
 		 462 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  30.32 
 
 		 458 aa  155  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  28.54 
 
 		 468 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  29.43 
 
 		 484 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  31.88 
 
 		 451 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  31.83 
 
 		 457 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  32.11 
 
 		 479 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  30.39 
 
 		 460 aa  150  5e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  30.66 
 
 		 461 aa  149  7e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  30.15 
 
 		 461 aa  149  8e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  29.91 
 
 		 451 aa  149  1.0000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  30.66 
 
 		 461 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  29.02 
 
 		 469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  31.17 
 
 		 464 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  28.89 
 
 		 471 aa  146  9e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  28.89 
 
 		 471 aa  146  9e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  31.72 
 
 		 468 aa  146  9e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  31.34 
 
 		 460 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  26.24 
 
 		 512 aa  144  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  30.7 
 
 		 467 aa  143  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  32.19 
 
 		 460 aa  143  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  30.46 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  28.34 
 
 		 452 aa  140  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>