More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_15560 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_15560  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  100 
 
 		 447 aa  866    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  71.4 
 
 		 445 aa  613  9.999999999999999e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2089  peptidase M20  73.29 
 
 		 464 aa  588  1e-167  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1881  peptidase M20  71.89 
 
 		 464 aa  572  1.0000000000000001e-162  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676993 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2021  peptidase M20  72.44 
 
 		 469 aa  549  1e-155  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.89722  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3262  peptidase M20  67.2 
 
 		 472 aa  551  1e-155  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  62.53 
 
 		 484 aa  527  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14090  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  61.94 
 
 		 469 aa  512  1e-144  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2219  peptidase M20  62.5 
 
 		 476 aa  508  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342655  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  60.18 
 
 		 448 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  59.87 
 
 		 453 aa  489  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4319  hypothetical protein  58.2 
 
 		 445 aa  477  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.899733  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  56.07 
 
 		 470 aa  457  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4666  Beta-Ala-His dipeptidase  56.12 
 
 		 455 aa  455  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  hitchhiker  0.00791318 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12240  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  57.74 
 
 		 488 aa  454  1.0000000000000001e-126  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  55.18 
 
 		 453 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  55.18 
 
 		 453 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  56.94 
 
 		 460 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  55.18 
 
 		 453 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16280  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  58.86 
 
 		 456 aa  447  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.78366 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  56.14 
 
 		 452 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2156  hypothetical protein  57.47 
 
 		 460 aa  435  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366159  normal  0.0201539 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0408  peptidase dimerization domain protein  48.34 
 
 		 455 aa  389  1e-107  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0824  hypothetical protein  48.68 
 
 		 455 aa  386  1e-106  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0820  peptidase M20  46.65 
 
 		 446 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0261  peptidase M20  45.6 
 
 		 467 aa  351  2e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1518  peptidase M20  45.79 
 
 		 448 aa  325  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0128232  decreased coverage  0.000123266 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6602  hypothetical protein  42.76 
 
 		 449 aa  317  4e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0480  Beta-Ala-His dipeptidase  41.26 
 
 		 453 aa  298  2e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  39.95 
 
 		 467 aa  289  7e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1926  peptidase M20  40.09 
 
 		 447 aa  284  2.0000000000000002e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.21832  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  40.32 
 
 		 465 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  40.32 
 
 		 465 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  40.09 
 
 		 465 aa  283  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3301  hypothetical protein  42.32 
 
 		 449 aa  283  6.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653299  normal  0.0124999 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3706  peptidase M20  44.44 
 
 		 455 aa  274  3e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.114919  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1438  peptidase M20  38.95 
 
 		 457 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  36.74 
 
 		 453 aa  243  6e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  35.65 
 
 		 465 aa  233  7.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  35.7 
 
 		 456 aa  223  6e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  36.3 
 
 		 440 aa  219  5e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  34.76 
 
 		 463 aa  219  8.999999999999998e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  37.09 
 
 		 455 aa  217  2.9999999999999998e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  33.79 
 
 		 465 aa  217  2.9999999999999998e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  36.54 
 
 		 469 aa  217  4e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  33.26 
 
 		 456 aa  210  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  33.58 
 
 		 456 aa  208  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  32.73 
 
 		 458 aa  208  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  32.39 
 
 		 453 aa  208  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  32.69 
 
 		 468 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  34.32 
 
 		 452 aa  207  3e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  32.94 
 
 		 462 aa  205  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  32.17 
 
 		 475 aa  205  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  32.95 
 
 		 465 aa  205  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  32.7 
 
 		 456 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  32.58 
 
 		 471 aa  202  7e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  33.1 
 
 		 459 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  32.87 
 
 		 484 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.46 
 
 		 463 aa  194  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  30.05 
 
 		 460 aa  194  3e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  34.93 
 
 		 464 aa  192  8e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  33.56 
 
 		 470 aa  192  9e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  32.54 
 
 		 460 aa  191  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  31.9 
 
 		 462 aa  191  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  31.02 
 
 		 455 aa  190  5e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  34.08 
 
 		 458 aa  190  5e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  32.47 
 
 		 462 aa  189  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  32.73 
 
 		 469 aa  189  7e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  32.96 
 
 		 461 aa  189  7e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  34.3 
 
 		 461 aa  188  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  33.94 
 
 		 460 aa  188  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  34.15 
 
 		 460 aa  188  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  32.21 
 
 		 471 aa  187  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  32.21 
 
 		 471 aa  187  3e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  31.47 
 
 		 462 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  32.47 
 
 		 458 aa  186  9e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  32.72 
 
 		 485 aa  185  2.0000000000000003e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  32.83 
 
 		 461 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  31.9 
 
 		 463 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  33.69 
 
 		 468 aa  183  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  31.36 
 
 		 470 aa  183  6e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  32.96 
 
 		 461 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  32.96 
 
 		 461 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  31.84 
 
 		 462 aa  181  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  34.07 
 
 		 472 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  31.86 
 
 		 468 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  31.14 
 
 		 457 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  32.57 
 
 		 451 aa  180  5.999999999999999e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  32.2 
 
 		 468 aa  179  7e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  30.93 
 
 		 460 aa  178  2e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  37.28 
 
 		 481 aa  178  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  34.6 
 
 		 479 aa  176  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  30.48 
 
 		 457 aa  176  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  32.06 
 
 		 468 aa  176  7e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  33.17 
 
 		 457 aa  176  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  30.07 
 
 		 459 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  31.93 
 
 		 468 aa  173  6.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1931  hypothetical protein  31.93 
 
 		 458 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  34.68 
 
 		 496 aa  170  6e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1937  hypothetical protein  31.46 
 
 		 468 aa  169  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.293644  normal  0.311555 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>