More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0820 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0820  peptidase M20  100 
 
 
446 aa  876    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193713  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1518  peptidase M20  73.36 
 
 
448 aa  631  1e-180  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0128232  decreased coverage  0.000123266 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0261  peptidase M20  49.22 
 
 
467 aa  398  1e-109  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4666  Beta-Ala-His dipeptidase  47.02 
 
 
455 aa  365  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  hitchhiker  0.00791318 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1926  peptidase M20  49.66 
 
 
447 aa  367  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.21832  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6602  hypothetical protein  48.54 
 
 
449 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1438  peptidase M20  49.77 
 
 
457 aa  365  1e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368913  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  47.09 
 
 
448 aa  363  5.0000000000000005e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  46.97 
 
 
453 aa  361  2e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  45.2 
 
 
445 aa  353  5e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3262  peptidase M20  47.84 
 
 
472 aa  352  7e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12240  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  47.89 
 
 
488 aa  351  2e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16280  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  47.61 
 
 
456 aa  350  3e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.78366 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  45.23 
 
 
484 aa  349  5e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14090  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  47.91 
 
 
469 aa  346  4e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4319  hypothetical protein  44.55 
 
 
445 aa  344  2e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.899733  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  47.61 
 
 
470 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  45.79 
 
 
453 aa  342  5.999999999999999e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  45.79 
 
 
453 aa  342  5.999999999999999e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  45.79 
 
 
453 aa  342  5.999999999999999e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0480  Beta-Ala-His dipeptidase  44.97 
 
 
453 aa  340  2e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15560  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  46.65 
 
 
447 aa  340  4e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471223  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  47.73 
 
 
460 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2089  peptidase M20  48.23 
 
 
464 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  47.79 
 
 
452 aa  333  3e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2156  hypothetical protein  47.3 
 
 
460 aa  331  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366159  normal  0.0201539 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2219  peptidase M20  43.18 
 
 
476 aa  330  3e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342655  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1881  peptidase M20  47.64 
 
 
464 aa  329  5.0000000000000004e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676993 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2021  peptidase M20  46.33 
 
 
469 aa  327  3e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.89722  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3301  hypothetical protein  44.32 
 
 
449 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653299  normal  0.0124999 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0824  hypothetical protein  40.84 
 
 
455 aa  296  6e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0408  peptidase dimerization domain protein  40.22 
 
 
455 aa  295  1e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  39.32 
 
 
465 aa  292  7e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  39.32 
 
 
465 aa  292  7e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  39.09 
 
 
465 aa  292  9e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3706  peptidase M20  45.8 
 
 
455 aa  288  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.114919  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  39.32 
 
 
467 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  36.12 
 
 
455 aa  228  1e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.21 
 
 
463 aa  225  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  32.89 
 
 
456 aa  218  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  31.29 
 
 
453 aa  217  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  31.03 
 
 
456 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  30.39 
 
 
460 aa  216  7e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  34.81 
 
 
465 aa  213  5.999999999999999e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  33.41 
 
 
462 aa  213  5.999999999999999e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  30.32 
 
 
453 aa  212  9e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  31.86 
 
 
463 aa  212  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  33.26 
 
 
458 aa  211  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  33.03 
 
 
459 aa  207  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  30.28 
 
 
458 aa  206  6e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  30.48 
 
 
456 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  31.79 
 
 
460 aa  199  6e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  33.18 
 
 
440 aa  197  4.0000000000000005e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  29.44 
 
 
459 aa  194  3e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  33.55 
 
 
461 aa  192  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  33.04 
 
 
460 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  30.33 
 
 
451 aa  191  2e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  30.43 
 
 
485 aa  191  2e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  30.77 
 
 
452 aa  191  2.9999999999999997e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.99 
 
 
475 aa  190  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  34.61 
 
 
468 aa  188  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.94 
 
 
456 aa  187  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  31.15 
 
 
465 aa  187  3e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  35.07 
 
 
456 aa  187  5e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  34.14 
 
 
460 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  29.63 
 
 
455 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  32.32 
 
 
461 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  32.32 
 
 
461 aa  182  7e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  30.75 
 
 
461 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3030  hypothetical protein  32.33 
 
 
467 aa  180  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  29.39 
 
 
457 aa  179  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1937  hypothetical protein  31.33 
 
 
468 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.293644  normal  0.311555 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  33.41 
 
 
474 aa  174  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  30.65 
 
 
468 aa  173  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  30.82 
 
 
470 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  30.82 
 
 
457 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  30.06 
 
 
468 aa  172  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3528  hypothetical protein  30.45 
 
 
468 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  31.45 
 
 
458 aa  171  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  31 
 
 
468 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  31.22 
 
 
462 aa  167  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  29.89 
 
 
461 aa  167  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  30.04 
 
 
460 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  28.85 
 
 
461 aa  167  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  33.33 
 
 
488 aa  167  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  30.73 
 
 
470 aa  166  5e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  27.86 
 
 
471 aa  166  5e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  30.13 
 
 
457 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  29.78 
 
 
465 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  31.26 
 
 
472 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  30.65 
 
 
457 aa  164  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  29.08 
 
 
468 aa  164  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  29.72 
 
 
469 aa  163  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  28.69 
 
 
468 aa  162  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  31.65 
 
 
469 aa  161  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  28.78 
 
 
471 aa  159  7e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  28.78 
 
 
471 aa  159  7e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  28.98 
 
 
462 aa  159  8e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  30.44 
 
 
464 aa  157  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  32.61 
 
 
464 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>