More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12543 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  100 
 
 
470 aa  925    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  84.55 
 
 
453 aa  727    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  84.55 
 
 
453 aa  727    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  80.69 
 
 
452 aa  674    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  84.55 
 
 
453 aa  727    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  80.41 
 
 
460 aa  690    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4319  hypothetical protein  61.7 
 
 
445 aa  506  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.899733  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  59.38 
 
 
453 aa  490  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  59.72 
 
 
448 aa  484  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  55.71 
 
 
445 aa  463  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3262  peptidase M20  56.59 
 
 
472 aa  448  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4666  Beta-Ala-His dipeptidase  56.39 
 
 
455 aa  448  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  hitchhiker  0.00791318 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15560  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  56.24 
 
 
447 aa  444  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471223  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16280  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  55.21 
 
 
456 aa  436  1e-121  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.78366 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2089  peptidase M20  56.97 
 
 
464 aa  431  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  52.55 
 
 
484 aa  424  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1881  peptidase M20  54.74 
 
 
464 aa  417  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676993 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2156  hypothetical protein  56.46 
 
 
460 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366159  normal  0.0201539 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2021  peptidase M20  54.29 
 
 
469 aa  414  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.89722  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14090  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  52.58 
 
 
469 aa  413  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12240  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  51.66 
 
 
488 aa  406  1.0000000000000001e-112  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2219  peptidase M20  47.99 
 
 
476 aa  392  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342655  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0820  peptidase M20  47.8 
 
 
446 aa  354  2e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193713  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0261  peptidase M20  43.72 
 
 
467 aa  347  4e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0824  hypothetical protein  44.54 
 
 
455 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0480  Beta-Ala-His dipeptidase  41.35 
 
 
453 aa  323  4e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0408  peptidase dimerization domain protein  40.86 
 
 
455 aa  310  2.9999999999999997e-83  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1518  peptidase M20  45.45 
 
 
448 aa  310  4e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0128232  decreased coverage  0.000123266 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6602  hypothetical protein  42.4 
 
 
449 aa  304  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  42.14 
 
 
467 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1926  peptidase M20  43.65 
 
 
447 aa  291  2e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.21832  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  40.87 
 
 
465 aa  289  6e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  40.87 
 
 
465 aa  289  6e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  40.64 
 
 
465 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3301  hypothetical protein  41.37 
 
 
449 aa  286  5e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653299  normal  0.0124999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1438  peptidase M20  40.27 
 
 
457 aa  276  6e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368913  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3706  peptidase M20  44.39 
 
 
455 aa  268  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.114919  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  34.85 
 
 
453 aa  239  5.999999999999999e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  36.93 
 
 
469 aa  236  8e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  35.55 
 
 
462 aa  236  9e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  36.22 
 
 
455 aa  231  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  34.2 
 
 
465 aa  226  5.0000000000000005e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  35.51 
 
 
458 aa  226  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  34.09 
 
 
455 aa  220  3e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  32.5 
 
 
458 aa  219  8.999999999999998e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  33.94 
 
 
440 aa  218  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  32.14 
 
 
456 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  32.88 
 
 
465 aa  217  4e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  32.88 
 
 
458 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  32.18 
 
 
453 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  34.1 
 
 
456 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  33.71 
 
 
463 aa  215  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  32.13 
 
 
475 aa  212  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  33.25 
 
 
456 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.64 
 
 
456 aa  210  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  35.67 
 
 
464 aa  209  7e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  32.34 
 
 
460 aa  208  2e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  34.4 
 
 
485 aa  207  3e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  32.27 
 
 
452 aa  207  4e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  32.12 
 
 
463 aa  206  8e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  31.36 
 
 
459 aa  205  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  34.86 
 
 
468 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  33.63 
 
 
460 aa  199  7e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  32.17 
 
 
461 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  31.6 
 
 
461 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  31 
 
 
471 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  32.47 
 
 
460 aa  197  3e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  33.02 
 
 
457 aa  196  7e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  33.26 
 
 
472 aa  196  9e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  31.67 
 
 
465 aa  195  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  32.33 
 
 
461 aa  194  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  33.91 
 
 
462 aa  194  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  32.96 
 
 
469 aa  193  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  34.01 
 
 
467 aa  193  5e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  33.26 
 
 
471 aa  192  8e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  33.26 
 
 
471 aa  192  8e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  34.59 
 
 
479 aa  192  8e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  32.58 
 
 
470 aa  192  8e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  30.46 
 
 
459 aa  192  9e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  32.16 
 
 
462 aa  190  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  32.77 
 
 
462 aa  191  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  32.73 
 
 
461 aa  189  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  30.89 
 
 
484 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  32.03 
 
 
470 aa  186  8e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  33.26 
 
 
460 aa  186  9e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  31.84 
 
 
451 aa  185  1.0000000000000001e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  32.03 
 
 
457 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  32.4 
 
 
474 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  31.66 
 
 
468 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  31.98 
 
 
462 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  31 
 
 
468 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  30.75 
 
 
457 aa  182  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  29.6 
 
 
460 aa  182  1e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  31.74 
 
 
461 aa  181  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  31.74 
 
 
461 aa  180  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  35.73 
 
 
481 aa  179  7e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  30.84 
 
 
468 aa  179  8e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1931  hypothetical protein  31.38 
 
 
458 aa  178  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  32.06 
 
 
468 aa  178  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  31.71 
 
 
468 aa  176  9e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>