More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_14090 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_14090  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  100 
 
 
469 aa  911    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  59.23 
 
 
484 aa  529  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  60.27 
 
 
445 aa  530  1e-149  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3262  peptidase M20  62.67 
 
 
472 aa  513  1e-144  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15560  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  61.94 
 
 
447 aa  509  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471223  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1881  peptidase M20  63.89 
 
 
464 aa  501  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676993 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2219  peptidase M20  59.82 
 
 
476 aa  501  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342655  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2021  peptidase M20  62.2 
 
 
469 aa  489  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.89722  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2089  peptidase M20  61.54 
 
 
464 aa  490  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  58.33 
 
 
453 aa  480  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  57.4 
 
 
448 aa  476  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4666  Beta-Ala-His dipeptidase  56.1 
 
 
455 aa  454  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  hitchhiker  0.00791318 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12240  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  56.03 
 
 
488 aa  451  1.0000000000000001e-126  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4319  hypothetical protein  54.44 
 
 
445 aa  441  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.899733  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  53.76 
 
 
453 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  53.76 
 
 
453 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16280  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  55.81 
 
 
456 aa  437  1e-121  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.78366 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  53.76 
 
 
453 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2156  hypothetical protein  56.47 
 
 
460 aa  430  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366159  normal  0.0201539 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  54.42 
 
 
460 aa  426  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  52.78 
 
 
470 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  52.73 
 
 
452 aa  410  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0820  peptidase M20  47.91 
 
 
446 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193713  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0824  hypothetical protein  44.84 
 
 
455 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0261  peptidase M20  45.45 
 
 
467 aa  347  2e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0408  peptidase dimerization domain protein  43.43 
 
 
455 aa  339  7e-92  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1518  peptidase M20  45.24 
 
 
448 aa  324  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0128232  decreased coverage  0.000123266 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  42.15 
 
 
467 aa  307  3e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6602  hypothetical protein  41.95 
 
 
449 aa  303  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  41.92 
 
 
465 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  41.92 
 
 
465 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  41.69 
 
 
465 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0480  Beta-Ala-His dipeptidase  40.45 
 
 
453 aa  301  2e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1926  peptidase M20  43.09 
 
 
447 aa  295  1e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.21832  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3301  hypothetical protein  42.89 
 
 
449 aa  289  7e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653299  normal  0.0124999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1438  peptidase M20  40.45 
 
 
457 aa  279  7e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368913  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3706  peptidase M20  44.92 
 
 
455 aa  270  5.9999999999999995e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.114919  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  35.17 
 
 
462 aa  233  4.0000000000000004e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  36.48 
 
 
469 aa  232  8.000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  34.43 
 
 
465 aa  231  1e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  36.05 
 
 
458 aa  223  8e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  33.41 
 
 
456 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  35.49 
 
 
452 aa  217  2.9999999999999998e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  32.81 
 
 
465 aa  217  4e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  33.1 
 
 
453 aa  216  7e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  32.22 
 
 
456 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  32.3 
 
 
475 aa  212  9e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  32.35 
 
 
440 aa  209  6e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  31.37 
 
 
468 aa  208  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  31.53 
 
 
455 aa  207  5e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  32.96 
 
 
455 aa  206  6e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  35.5 
 
 
458 aa  205  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  32.6 
 
 
469 aa  204  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  33.77 
 
 
461 aa  204  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  32.52 
 
 
462 aa  202  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  31.28 
 
 
465 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  31.53 
 
 
456 aa  202  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  32.84 
 
 
459 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  30.13 
 
 
471 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  32.59 
 
 
462 aa  201  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  31.04 
 
 
471 aa  200  5e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  31.04 
 
 
471 aa  200  5e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  32.42 
 
 
462 aa  199  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  31.02 
 
 
470 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  31.6 
 
 
463 aa  199  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  31.9 
 
 
456 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  32.59 
 
 
457 aa  198  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  30.05 
 
 
458 aa  197  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  31.47 
 
 
460 aa  197  3e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  31.86 
 
 
457 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.4 
 
 
463 aa  195  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  33.26 
 
 
472 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  31.56 
 
 
457 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  29.89 
 
 
453 aa  194  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  32.13 
 
 
463 aa  193  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  34.16 
 
 
460 aa  192  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  33.16 
 
 
468 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  31.66 
 
 
468 aa  190  4e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  31.93 
 
 
461 aa  189  7e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  32.27 
 
 
462 aa  189  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  32.4 
 
 
474 aa  189  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  32.11 
 
 
460 aa  187  3e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  32.95 
 
 
461 aa  187  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  32.65 
 
 
460 aa  186  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  30.48 
 
 
459 aa  186  7e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  33.62 
 
 
464 aa  186  9e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  29.56 
 
 
470 aa  186  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  31.7 
 
 
485 aa  184  2.0000000000000003e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  33.26 
 
 
479 aa  185  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  32.73 
 
 
461 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  33.48 
 
 
464 aa  183  6e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  31.35 
 
 
468 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  33.18 
 
 
468 aa  182  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3030  hypothetical protein  28.91 
 
 
467 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  30.31 
 
 
468 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  32.74 
 
 
461 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  32.74 
 
 
461 aa  179  8e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  33.41 
 
 
488 aa  179  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  32.86 
 
 
467 aa  178  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  31.7 
 
 
460 aa  177  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>