More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3301 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3301  hypothetical protein  100 
 
 		 449 aa  895    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653299  normal  0.0124999 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0480  Beta-Ala-His dipeptidase  68.61 
 
 		 453 aa  616  1e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6602  hypothetical protein  60.14 
 
 		 449 aa  498  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3706  peptidase M20  53.01 
 
 		 455 aa  374  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.114919  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0820  peptidase M20  44.32 
 
 		 446 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  44.19 
 
 		 460 aa  317  2e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  44.32 
 
 		 452 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  46.09 
 
 		 453 aa  306  6e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  45.5 
 
 		 448 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  42.76 
 
 		 453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  42.76 
 
 		 453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  42.76 
 
 		 453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2156  hypothetical protein  44.2 
 
 		 460 aa  302  7.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366159  normal  0.0201539 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  42.23 
 
 		 470 aa  298  1e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14090  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  42.89 
 
 		 469 aa  295  1e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1881  peptidase M20  44.16 
 
 		 464 aa  292  1e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676993 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0261  peptidase M20  40.41 
 
 		 467 aa  290  3e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  40.18 
 
 		 445 aa  287  2e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12240  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  45.01 
 
 		 488 aa  285  1.0000000000000001e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1518  peptidase M20  43.15 
 
 		 448 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0128232  decreased coverage  0.000123266 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  42.6 
 
 		 484 aa  284  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4319  hypothetical protein  40.53 
 
 		 445 aa  282  8.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.899733  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4666  Beta-Ala-His dipeptidase  40.98 
 
 		 455 aa  280  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  hitchhiker  0.00791318 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15560  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  42.32 
 
 		 447 aa  277  2e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1438  peptidase M20  41.04 
 
 		 457 aa  271  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1926  peptidase M20  40.27 
 
 		 447 aa  270  5.9999999999999995e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.21832  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3262  peptidase M20  41.54 
 
 		 472 aa  264  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2021  peptidase M20  41.28 
 
 		 469 aa  262  1e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.89722  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2089  peptidase M20  41.03 
 
 		 464 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2219  peptidase M20  40.16 
 
 		 476 aa  259  7e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342655  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16280  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  41.97 
 
 		 456 aa  253  6e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.78366 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0408  peptidase dimerization domain protein  37.19 
 
 		 455 aa  248  1e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0824  hypothetical protein  38.32 
 
 		 455 aa  245  9.999999999999999e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  36.53 
 
 		 467 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  39.74 
 
 		 465 aa  233  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  39.49 
 
 		 465 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  39.49 
 
 		 465 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  34.1 
 
 		 455 aa  184  4.0000000000000006e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  31.43 
 
 		 453 aa  178  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  31.13 
 
 		 456 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  30.13 
 
 		 465 aa  174  1.9999999999999998e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  31.14 
 
 		 461 aa  173  6.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  31.4 
 
 		 459 aa  169  9e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  30.47 
 
 		 462 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  32.63 
 
 		 440 aa  166  9e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  36.17 
 
 		 464 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  34.53 
 
 		 488 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  30.36 
 
 		 462 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.97 
 
 		 475 aa  162  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  32.7 
 
 		 462 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.23 
 
 		 456 aa  160  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  30.32 
 
 		 471 aa  160  4e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  29.72 
 
 		 470 aa  160  5e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  27.23 
 
 		 453 aa  160  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  31.39 
 
 		 462 aa  159  8e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  26.42 
 
 		 512 aa  159  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  28.7 
 
 		 465 aa  159  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  29.44 
 
 		 451 aa  158  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  30.39 
 
 		 455 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  28.96 
 
 		 460 aa  157  4e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  29.56 
 
 		 456 aa  156  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  31.5 
 
 		 470 aa  156  6e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  31.5 
 
 		 457 aa  156  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  32.02 
 
 		 461 aa  156  8e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  35.77 
 
 		 468 aa  155  9e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  31.94 
 
 		 463 aa  156  9e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  31.48 
 
 		 457 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  31.78 
 
 		 468 aa  155  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  29.71 
 
 		 465 aa  154  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  32 
 
 		 468 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  29.2 
 
 		 460 aa  151  2e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.02 
 
 		 463 aa  151  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  30.25 
 
 		 457 aa  151  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  29.83 
 
 		 460 aa  151  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  32.75 
 
 		 469 aa  152  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  31.25 
 
 		 460 aa  150  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  29.1 
 
 		 463 aa  150  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  31.41 
 
 		 456 aa  150  7e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  32.75 
 
 		 458 aa  150  7e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  27.91 
 
 		 461 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  29.03 
 
 		 467 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  32.7 
 
 		 468 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  31.28 
 
 		 461 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  30.59 
 
 		 462 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1937  hypothetical protein  31.78 
 
 		 468 aa  146  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.293644  normal  0.311555 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  29.02 
 
 		 469 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  31.36 
 
 		 460 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  31.03 
 
 		 461 aa  145  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1931  hypothetical protein  30.08 
 
 		 458 aa  144  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  28.8 
 
 		 471 aa  144  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  28.8 
 
 		 471 aa  144  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3528  hypothetical protein  31.59 
 
 		 468 aa  144  5e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  29.51 
 
 		 461 aa  142  9e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  29.88 
 
 		 484 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  28.84 
 
 		 451 aa  142  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  30.14 
 
 		 468 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0782  peptidase M20  31.66 
 
 		 484 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14582  normal  0.0758417 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0859  hypothetical protein  29.02 
 
 		 463 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3030  hypothetical protein  31.59 
 
 		 467 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1719  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  28.76 
 
 		 448 aa  141  3e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>