More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_18404 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  100 
 
 
512 aa  1061    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03459  glutamate carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05450)  52.13 
 
 
535 aa  479  1e-134  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00014033 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78234  Glutamate carboxypeptidase-like protein  49.59 
 
 
481 aa  459  9.999999999999999e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01640  glutamate carboxypeptidase protein, putative  49.58 
 
 
476 aa  435  1e-120  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.182836  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  34.8 
 
 
456 aa  277  3e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  34.32 
 
 
458 aa  263  6e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  34.87 
 
 
463 aa  263  6e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04170  conserved hypothetical protein  33.85 
 
 
988 aa  257  4e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  36.12 
 
 
455 aa  256  8e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  35.48 
 
 
440 aa  255  1.0000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  34.33 
 
 
462 aa  247  3e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  32.26 
 
 
475 aa  247  4e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66365  Metalloexopeptidase  34.65 
 
 
977 aa  245  9.999999999999999e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.203014  normal  0.591866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  32.33 
 
 
456 aa  244  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  33.12 
 
 
453 aa  241  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  33.97 
 
 
460 aa  241  2.9999999999999997e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  34.04 
 
 
456 aa  237  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  34.17 
 
 
456 aa  236  6e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  34.59 
 
 
485 aa  229  8e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  33.47 
 
 
459 aa  229  9e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  30.64 
 
 
453 aa  228  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  34.52 
 
 
465 aa  228  2e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  31.45 
 
 
451 aa  226  6e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  31.11 
 
 
459 aa  224  2e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  30.26 
 
 
455 aa  222  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  32.48 
 
 
463 aa  220  3.9999999999999997e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  30.98 
 
 
467 aa  219  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  33.12 
 
 
460 aa  219  1e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  30.93 
 
 
458 aa  214  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  30.69 
 
 
458 aa  213  7e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  30.77 
 
 
452 aa  213  9e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  30.95 
 
 
460 aa  210  6e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  29.96 
 
 
468 aa  206  9e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  29.68 
 
 
484 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  29.17 
 
 
465 aa  205  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  30.11 
 
 
468 aa  203  7e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  29.94 
 
 
461 aa  202  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  28.78 
 
 
470 aa  200  3.9999999999999996e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  30.59 
 
 
469 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  28.31 
 
 
474 aa  200  6e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  29.68 
 
 
460 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  30.3 
 
 
464 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  29.58 
 
 
461 aa  198  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  29.55 
 
 
461 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  29.72 
 
 
456 aa  196  9e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  29.66 
 
 
457 aa  192  8e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  29.49 
 
 
467 aa  192  8e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  30.15 
 
 
464 aa  189  7e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  29.74 
 
 
462 aa  189  9e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  30.11 
 
 
461 aa  189  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  29.55 
 
 
461 aa  188  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  29.2 
 
 
452 aa  188  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  29.34 
 
 
461 aa  187  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  28.94 
 
 
462 aa  186  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  30.5 
 
 
470 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  28.57 
 
 
462 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  29.24 
 
 
462 aa  184  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  30.5 
 
 
457 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0859  hypothetical protein  27.86 
 
 
463 aa  183  8.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  28.7 
 
 
463 aa  182  9.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  29.48 
 
 
460 aa  182  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  27.39 
 
 
465 aa  182  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  29.36 
 
 
457 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3030  hypothetical protein  29.49 
 
 
467 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  31.25 
 
 
468 aa  181  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  28.36 
 
 
468 aa  179  8e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  31.98 
 
 
457 aa  179  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  28.54 
 
 
488 aa  178  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01879  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_2G04360)  29.95 
 
 
980 aa  177  3e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.747659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  28.13 
 
 
472 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1931  hypothetical protein  29.15 
 
 
458 aa  176  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  27.59 
 
 
468 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  29.85 
 
 
471 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  27.94 
 
 
469 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  28.61 
 
 
465 aa  173  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  28.61 
 
 
465 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  28.61 
 
 
465 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  27.4 
 
 
471 aa  170  7e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  27.4 
 
 
471 aa  170  7e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12240  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  28.63 
 
 
488 aa  169  7e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  30.27 
 
 
437 aa  169  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  30.94 
 
 
448 aa  169  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  30.37 
 
 
468 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1719  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  27.68 
 
 
448 aa  168  2e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0692  peptidase M20  30.02 
 
 
450 aa  168  2e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  29.47 
 
 
468 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  28.63 
 
 
479 aa  167  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  29.91 
 
 
453 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  29.62 
 
 
484 aa  163  6e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3528  hypothetical protein  28.97 
 
 
468 aa  163  9e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1937  hypothetical protein  28.79 
 
 
468 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.293644  normal  0.311555 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  28.99 
 
 
453 aa  159  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1840  peptidase M20  27.81 
 
 
448 aa  159  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0824  hypothetical protein  29.28 
 
 
455 aa  155  1e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0408  peptidase dimerization domain protein  31.91 
 
 
455 aa  154  4e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  31.73 
 
 
496 aa  153  8.999999999999999e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  27.33 
 
 
448 aa  152  8.999999999999999e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2219  peptidase M20  30 
 
 
476 aa  152  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342655  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  29.41 
 
 
481 aa  151  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0429  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.97 
 
 
445 aa  151  3e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>