More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0429 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0429  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 
445 aa  919    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1719  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  52.5 
 
 
448 aa  462  1e-129  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1640  hypothetical protein  50.68 
 
 
458 aa  451  1e-125  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  38.19 
 
 
451 aa  323  3e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2697  peptidase M20  41.47 
 
 
451 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.922328 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  38.72 
 
 
448 aa  295  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  38.25 
 
 
453 aa  293  3e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1840  peptidase M20  38.13 
 
 
448 aa  288  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0692  peptidase M20  35.82 
 
 
450 aa  280  3e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  34.33 
 
 
437 aa  243  3e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  32.86 
 
 
452 aa  240  2.9999999999999997e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1484  hypothetical protein  34.7 
 
 
418 aa  227  3e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.555419  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  31.7 
 
 
459 aa  224  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  32.88 
 
 
455 aa  217  4e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  32.89 
 
 
440 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  33.19 
 
 
456 aa  207  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2833  peptidase M20  30.73 
 
 
443 aa  207  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.03601  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  30.33 
 
 
458 aa  206  7e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  30.68 
 
 
479 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  31.54 
 
 
464 aa  197  3e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  29.53 
 
 
458 aa  196  6e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0916  peptidase dimerisation domain-containing protein  33.18 
 
 
521 aa  195  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  30.45 
 
 
465 aa  195  2e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  31.53 
 
 
455 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  33.11 
 
 
475 aa  192  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  30.55 
 
 
463 aa  192  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  32.86 
 
 
462 aa  191  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  30.23 
 
 
452 aa  189  9e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  29.17 
 
 
458 aa  189  1e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.97 
 
 
456 aa  188  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  32.24 
 
 
465 aa  189  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2145  peptidase M20  31.59 
 
 
470 aa  187  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0790004  normal  0.0404303 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  32.03 
 
 
467 aa  187  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  31.88 
 
 
457 aa  187  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  29.28 
 
 
469 aa  187  5e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  31.95 
 
 
468 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  32.51 
 
 
406 aa  182  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  30.43 
 
 
453 aa  182  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  30.36 
 
 
459 aa  181  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  29.71 
 
 
453 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  30.49 
 
 
484 aa  179  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2415  peptidase M20  28.47 
 
 
443 aa  179  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  0.04859 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  30.11 
 
 
462 aa  178  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  32.28 
 
 
462 aa  177  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0937  peptidase M20  28.41 
 
 
450 aa  177  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0137436  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  32.35 
 
 
462 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0196  peptidase M20  29.07 
 
 
448 aa  176  9e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143617  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  27.93 
 
 
451 aa  176  9.999999999999999e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4109  peptidase M20  30.79 
 
 
450 aa  175  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.720688 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0094  peptidase M20  28.74 
 
 
448 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  28.95 
 
 
465 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  28.95 
 
 
465 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  33.43 
 
 
456 aa  172  7.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  28.28 
 
 
460 aa  172  1e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  30.13 
 
 
461 aa  172  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  30.02 
 
 
460 aa  172  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  29 
 
 
496 aa  171  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  28.38 
 
 
467 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  31.11 
 
 
474 aa  171  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  34.71 
 
 
462 aa  171  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  30.64 
 
 
468 aa  170  4e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  28.51 
 
 
465 aa  170  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  29.95 
 
 
461 aa  169  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  30.96 
 
 
469 aa  169  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  29.98 
 
 
488 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  30.66 
 
 
463 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  30.28 
 
 
456 aa  167  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  30.25 
 
 
471 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  29.95 
 
 
460 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  30.25 
 
 
471 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  27.56 
 
 
472 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  31.52 
 
 
457 aa  164  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  30.26 
 
 
481 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0372  twin-arginine translocation pathway signal  31.01 
 
 
514 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.424462 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  28.1 
 
 
459 aa  163  6e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  29.48 
 
 
460 aa  162  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  27.44 
 
 
465 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  30.72 
 
 
485 aa  161  3e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  29.48 
 
 
461 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  30.1 
 
 
461 aa  161  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.67 
 
 
463 aa  160  6e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  29.85 
 
 
461 aa  159  7e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  32.76 
 
 
464 aa  157  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  30.43 
 
 
470 aa  157  5.0000000000000005e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  29.36 
 
 
461 aa  156  8e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  27.75 
 
 
471 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  31.97 
 
 
512 aa  151  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  34.48 
 
 
468 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  28.6 
 
 
468 aa  151  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  31.05 
 
 
457 aa  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  29.74 
 
 
456 aa  150  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1868  peptidase M20  27.64 
 
 
508 aa  150  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00940892  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  29.72 
 
 
468 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1931  hypothetical protein  31.9 
 
 
458 aa  149  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  28.07 
 
 
460 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  32.76 
 
 
470 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0859  hypothetical protein  27.45 
 
 
463 aa  145  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  33.43 
 
 
457 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  33.45 
 
 
468 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3528  hypothetical protein  32.05 
 
 
468 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.551009 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>