205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0372 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0372  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
514 aa  1044    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.424462 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0916  peptidase dimerisation domain-containing protein  41.15 
 
 
521 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3870  peptidase M20  33.4 
 
 
495 aa  246  8e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0529091  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2697  peptidase M20  36.79 
 
 
451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.922328 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  35.71 
 
 
451 aa  197  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  34.29 
 
 
453 aa  194  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  34.89 
 
 
448 aa  184  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0692  peptidase M20  30.3 
 
 
450 aa  179  9e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1484  hypothetical protein  31.88 
 
 
418 aa  172  1e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.555419  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  34.56 
 
 
437 aa  166  8e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0429  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.24 
 
 
445 aa  166  8e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1840  peptidase M20  33.02 
 
 
448 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4109  peptidase M20  31.59 
 
 
450 aa  165  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.720688 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1719  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  31.03 
 
 
448 aa  158  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  31.19 
 
 
459 aa  155  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  28.64 
 
 
456 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  30.84 
 
 
456 aa  153  8e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  29.75 
 
 
452 aa  152  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  28.73 
 
 
452 aa  152  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  28.51 
 
 
462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  28.98 
 
 
458 aa  147  6e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  31.03 
 
 
469 aa  143  9e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  30.99 
 
 
465 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  32.96 
 
 
475 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2145  peptidase M20  32.72 
 
 
470 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0790004  normal  0.0404303 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  29.95 
 
 
468 aa  139  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.55 
 
 
456 aa  139  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  30.79 
 
 
456 aa  137  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  30.79 
 
 
467 aa  137  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  30.79 
 
 
496 aa  137  5e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1640  hypothetical protein  29.09 
 
 
458 aa  136  7.000000000000001e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  28.41 
 
 
453 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  28.73 
 
 
463 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  30.09 
 
 
464 aa  131  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  30.47 
 
 
481 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  28.64 
 
 
455 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  27.54 
 
 
457 aa  130  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  28.04 
 
 
459 aa  129  9.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  30.91 
 
 
458 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  27.74 
 
 
453 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1868  peptidase M20  26.41 
 
 
508 aa  125  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00940892  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1186  peptidase M20  29.06 
 
 
466 aa  124  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.126219  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  30.56 
 
 
479 aa  123  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  27.96 
 
 
455 aa  122  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  27.29 
 
 
460 aa  123  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  32.4 
 
 
406 aa  123  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  29.92 
 
 
474 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  27.47 
 
 
458 aa  120  7e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0196  peptidase M20  28.23 
 
 
448 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143617  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  29.37 
 
 
457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  30.15 
 
 
470 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0094  peptidase M20  28.86 
 
 
448 aa  116  8.999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  30.79 
 
 
457 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  28.53 
 
 
461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  30.38 
 
 
465 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  30.5 
 
 
460 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0859  hypothetical protein  28.7 
 
 
463 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.11 
 
 
463 aa  113  9e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  28.46 
 
 
472 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2833  peptidase M20  27.17 
 
 
443 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.03601  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  27.69 
 
 
440 aa  109  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  27.56 
 
 
460 aa  108  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  28.27 
 
 
468 aa  108  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2415  peptidase M20  30.33 
 
 
443 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  0.04859 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  28.42 
 
 
456 aa  107  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  27.93 
 
 
468 aa  106  9e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  27.86 
 
 
460 aa  106  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2325  peptidase dimerisation domain protein  24.12 
 
 
514 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  24.49 
 
 
484 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  27.79 
 
 
485 aa  105  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  26.65 
 
 
462 aa  104  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  27.25 
 
 
462 aa  105  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  29.43 
 
 
468 aa  104  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4034  peptidase dimerisation domain protein  24.94 
 
 
544 aa  103  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.957672  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3920  peptidase dimerisation domain protein  24.94 
 
 
497 aa  103  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.49046  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  28.49 
 
 
468 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1937  hypothetical protein  27.59 
 
 
468 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.293644  normal  0.311555 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  29.08 
 
 
464 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  25.4 
 
 
470 aa  102  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3030  hypothetical protein  27.93 
 
 
467 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  28.26 
 
 
457 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  26.48 
 
 
461 aa  101  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66365  Metalloexopeptidase  25.82 
 
 
977 aa  101  4e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.203014  normal  0.591866 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2605  peptidase dimerization domain protein  23.89 
 
 
514 aa  100  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3993  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3528  hypothetical protein  28.53 
 
 
468 aa  100  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  26.79 
 
 
468 aa  99.4  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  26.74 
 
 
459 aa  99.8  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  29.47 
 
 
465 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  29.47 
 
 
465 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  27.37 
 
 
463 aa  98.2  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  25.67 
 
 
512 aa  97.8  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1520  peptidase M20  27.44 
 
 
488 aa  97.1  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.305754 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  28.76 
 
 
465 aa  96.7  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01640  glutamate carboxypeptidase protein, putative  27.17 
 
 
476 aa  96.3  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.182836  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  30.12 
 
 
460 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  27.62 
 
 
488 aa  95.5  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  29.37 
 
 
467 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  27.2 
 
 
451 aa  95.1  3e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1931  hypothetical protein  27.65 
 
 
458 aa  94.7  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  28.16 
 
 
461 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.47987 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>