273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4034 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_3920  peptidase dimerisation domain protein  100 
 
 		 497 aa  1023    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.49046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4034  peptidase dimerisation domain protein  100 
 
 		 544 aa  1120    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.957672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1258  peptidase dimerisation domain-containing protein  55.83 
 
 		 513 aa  529  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2325  peptidase dimerisation domain protein  51.23 
 
 		 514 aa  513  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2605  peptidase dimerization domain protein  50.82 
 
 		 514 aa  510  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3993  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1728  peptidase dimerisation domain protein  42.83 
 
 		 530 aa  409  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189678  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1760  peptidase dimerisation domain protein  38.33 
 
 		 520 aa  382  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1868  peptidase M20  39.36 
 
 		 508 aa  305  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00940892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1520  peptidase M20  34.06 
 
 		 488 aa  270  5.9999999999999995e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.305754 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  27.98 
 
 		 456 aa  204  5e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  30.71 
 
 		 462 aa  194  5e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  27.75 
 
 		 469 aa  191  4e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  30.72 
 
 		 464 aa  190  5e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  26.58 
 
 		 452 aa  187  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.91 
 
 		 456 aa  187  5e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.94 
 
 		 475 aa  184  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  28.3 
 
 		 460 aa  183  8.000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  33.33 
 
 		 458 aa  182  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  27.79 
 
 		 455 aa  181  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  26.43 
 
 		 453 aa  177  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  27.08 
 
 		 453 aa  177  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  28.07 
 
 		 440 aa  176  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  27.07 
 
 		 456 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  29.84 
 
 		 452 aa  174  5e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  26.62 
 
 		 458 aa  173  5.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  28.6 
 
 		 496 aa  173  7.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  27.25 
 
 		 474 aa  172  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  27.03 
 
 		 463 aa  172  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  26.71 
 
 		 459 aa  171  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  27.29 
 
 		 463 aa  171  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  28.03 
 
 		 455 aa  171  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  30.54 
 
 		 481 aa  170  6e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  26.98 
 
 		 472 aa  169  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  27.37 
 
 		 456 aa  169  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  28.35 
 
 		 479 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  25.98 
 
 		 453 aa  167  5.9999999999999996e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  26.21 
 
 		 467 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  29.02 
 
 		 485 aa  165  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  25.83 
 
 		 470 aa  164  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  26.13 
 
 		 471 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  28.29 
 
 		 465 aa  163  6e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  26.94 
 
 		 484 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  26.46 
 
 		 465 aa  158  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  25.51 
 
 		 465 aa  157  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  27.27 
 
 		 463 aa  156  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  26.61 
 
 		 461 aa  155  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  26.63 
 
 		 462 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2697  peptidase M20  27.39 
 
 		 451 aa  155  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.922328 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  27.81 
 
 		 468 aa  154  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  27.6 
 
 		 462 aa  150  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  26.34 
 
 		 468 aa  149  9e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  25.26 
 
 		 451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  28.66 
 
 		 456 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0859  hypothetical protein  25.9 
 
 		 463 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  26.8 
 
 		 488 aa  149  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  27.25 
 
 		 457 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  26.69 
 
 		 471 aa  146  8.000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  26.69 
 
 		 471 aa  146  8.000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  25.26 
 
 		 460 aa  146  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  25.74 
 
 		 457 aa  146  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  26.27 
 
 		 469 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  26.72 
 
 		 462 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  27.33 
 
 		 464 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  26.29 
 
 		 459 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  26.29 
 
 		 470 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  26.61 
 
 		 462 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  27.55 
 
 		 468 aa  139  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  26.73 
 
 		 460 aa  139  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  26.15 
 
 		 457 aa  138  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1159  hypothetical protein  29.6 
 
 		 473 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  25.31 
 
 		 448 aa  136  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  24.48 
 
 		 460 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  24.41 
 
 		 451 aa  136  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  26.58 
 
 		 457 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78234  Glutamate carboxypeptidase-like protein  25.1 
 
 		 481 aa  134  5e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  25.32 
 
 		 458 aa  133  9e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03459  glutamate carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05450)  24.71 
 
 		 535 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00014033 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  25.43 
 
 		 437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  25.31 
 
 		 461 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  26.33 
 
 		 461 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1840  peptidase M20  25.77 
 
 		 448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  25.89 
 
 		 461 aa  132  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1931  hypothetical protein  29.08 
 
 		 458 aa  132  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  24.59 
 
 		 459 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1484  hypothetical protein  29.31 
 
 		 418 aa  132  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.555419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1590  hypothetical protein  29.28 
 
 		 473 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242767  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0692  peptidase M20  23.39 
 
 		 450 aa  131  3e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0429  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.57 
 
 		 445 aa  130  4.0000000000000003e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1567  hypothetical protein  29.08 
 
 		 473 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1506  hypothetical protein  29.15 
 
 		 473 aa  130  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2571  peptidase, M20/M25/M40 family  28.54 
 
 		 475 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2332  hypothetical protein  27.51 
 
 		 471 aa  129  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0625849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1110  hypothetical protein  29.08 
 
 		 473 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  25.92 
 
 		 461 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  26.06 
 
 		 467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  25.92 
 
 		 461 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  25.67 
 
 		 460 aa  128  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  24.71 
 
 		 512 aa  128  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1721  hypothetical protein  27.35 
 
 		 468 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1486  hypothetical protein  28.74 
 
 		 473 aa  126  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.664586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>