263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2571 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2571  peptidase, M20/M25/M40 family  100 
 
 		 475 aa  970    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2262  hypothetical protein  93.68 
 
 		 475 aa  910    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3656  hypothetical protein  62.34 
 
 		 490 aa  608  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.989996  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1110  hypothetical protein  62.93 
 
 		 473 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1590  hypothetical protein  63.15 
 
 		 473 aa  598  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242767  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1567  hypothetical protein  63.15 
 
 		 473 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1764  hypothetical protein  63.56 
 
 		 467 aa  592  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.278132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3819  hypothetical protein  61.67 
 
 		 471 aa  592  1e-168  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1647  hypothetical protein  63.54 
 
 		 477 aa  592  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4728  hypothetical protein  62.07 
 
 		 473 aa  590  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4729  hypothetical protein  59.83 
 
 		 476 aa  588  1e-167  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1506  hypothetical protein  62.72 
 
 		 473 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1486  hypothetical protein  62.28 
 
 		 473 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.664586  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4378  hypothetical protein  60.72 
 
 		 473 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5121  hypothetical protein  58.9 
 
 		 475 aa  578  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2971  hypothetical protein  62.09 
 
 		 478 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.65839  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1159  hypothetical protein  61.4 
 
 		 473 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3502  hypothetical protein  58.44 
 
 		 472 aa  552  1e-156  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.67786  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2519  hypothetical protein  58.3 
 
 		 472 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1265  hypothetical protein  58.3 
 
 		 472 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662381  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1341  hypothetical protein  58.84 
 
 		 472 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3119  hypothetical protein  56.65 
 
 		 475 aa  540  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1675  hypothetical protein  56.64 
 
 		 473 aa  533  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1721  hypothetical protein  56.93 
 
 		 468 aa  535  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2929  hypothetical protein  54.06 
 
 		 475 aa  526  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2529  hypothetical protein  55.82 
 
 		 468 aa  524  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2217  hypothetical protein  55.63 
 
 		 472 aa  522  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3123  hypothetical protein  57.46 
 
 		 475 aa  523  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3625  hypothetical protein  55.99 
 
 		 472 aa  510  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1646  hypothetical protein  50.98 
 
 		 460 aa  474  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3415  hypothetical protein  50.76 
 
 		 476 aa  467  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3597  hypothetical protein  50.22 
 
 		 463 aa  459  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5704  hypothetical protein  48.27 
 
 		 459 aa  436  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0680852  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4152  hypothetical protein  47.92 
 
 		 467 aa  430  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2332  hypothetical protein  44.84 
 
 		 471 aa  352  8.999999999999999e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0625849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  30.96 
 
 		 455 aa  162  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  28.11 
 
 		 452 aa  147  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  29.37 
 
 		 451 aa  147  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  28.14 
 
 		 451 aa  145  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  30.22 
 
 		 456 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.48 
 
 		 456 aa  137  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  31.19 
 
 		 440 aa  134  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  29.56 
 
 		 496 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  26.15 
 
 		 465 aa  130  6e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  27.75 
 
 		 469 aa  130  6e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.76 
 
 		 406 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4034  peptidase dimerisation domain protein  28.54 
 
 		 544 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.957672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  28.8 
 
 		 456 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3920  peptidase dimerisation domain protein  28.54 
 
 		 497 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.49046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  29.79 
 
 		 460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1868  peptidase M20  27.54 
 
 		 508 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00940892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  28.47 
 
 		 458 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  29 
 
 		 475 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  28.94 
 
 		 456 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  29.11 
 
 		 453 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  30.61 
 
 		 452 aa  124  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  28.23 
 
 		 465 aa  122  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  28.68 
 
 		 460 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  26.73 
 
 		 463 aa  121  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  27.08 
 
 		 462 aa  121  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  28.68 
 
 		 455 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2325  peptidase dimerisation domain protein  28.18 
 
 		 514 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  27.65 
 
 		 457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  29.06 
 
 		 467 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0429  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.54 
 
 		 445 aa  118  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  30.03 
 
 		 453 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  27.89 
 
 		 448 aa  116  8.999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  27.18 
 
 		 459 aa  116  8.999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  27.91 
 
 		 464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  28.87 
 
 		 453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2605  peptidase dimerization domain protein  28.18 
 
 		 514 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3993  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  27.69 
 
 		 479 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  29.52 
 
 		 457 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  26.86 
 
 		 465 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  29.09 
 
 		 462 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  29.52 
 
 		 470 aa  113  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  28.21 
 
 		 453 aa  113  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  27.89 
 
 		 468 aa  114  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  28.21 
 
 		 453 aa  113  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  28.21 
 
 		 453 aa  113  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  27.69 
 
 		 458 aa  113  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  29.17 
 
 		 485 aa  112  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  27.42 
 
 		 445 aa  111  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1840  peptidase M20  27.21 
 
 		 448 aa  111  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  26.19 
 
 		 465 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  26.19 
 
 		 465 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  27.86 
 
 		 437 aa  109  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  29.2 
 
 		 484 aa  109  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0480  Beta-Ala-His dipeptidase  28.97 
 
 		 453 aa  108  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  28.72 
 
 		 457 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  29.03 
 
 		 470 aa  107  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  27.68 
 
 		 463 aa  106  8e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  28.54 
 
 		 462 aa  106  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  27.34 
 
 		 461 aa  106  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  28.1 
 
 		 463 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  28.81 
 
 		 462 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  28.42 
 
 		 459 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2089  peptidase M20  29.52 
 
 		 464 aa  105  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  27.75 
 
 		 462 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  28.44 
 
 		 471 aa  104  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>