280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4729 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4729  hypothetical protein  100 
 
 
476 aa  977    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3819  hypothetical protein  62.85 
 
 
471 aa  624  1e-177  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4728  hypothetical protein  61.69 
 
 
473 aa  598  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515691  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1486  hypothetical protein  62.55 
 
 
473 aa  598  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.664586  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2262  hypothetical protein  60.47 
 
 
475 aa  596  1e-169  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5121  hypothetical protein  60.73 
 
 
475 aa  597  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1567  hypothetical protein  62.12 
 
 
473 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1110  hypothetical protein  62.12 
 
 
473 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1590  hypothetical protein  62.12 
 
 
473 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242767  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1506  hypothetical protein  62.12 
 
 
473 aa  595  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3656  hypothetical protein  61.67 
 
 
490 aa  592  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.989996  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2571  peptidase, M20/M25/M40 family  59.83 
 
 
475 aa  588  1e-167  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1647  hypothetical protein  61.35 
 
 
477 aa  589  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1764  hypothetical protein  59.62 
 
 
467 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.278132  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4378  hypothetical protein  60.08 
 
 
473 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2519  hypothetical protein  60.17 
 
 
472 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1265  hypothetical protein  60.17 
 
 
472 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662381  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3502  hypothetical protein  58.37 
 
 
472 aa  561  1.0000000000000001e-159  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.67786  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1341  hypothetical protein  60.26 
 
 
472 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1675  hypothetical protein  55.81 
 
 
473 aa  560  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2971  hypothetical protein  59.49 
 
 
478 aa  560  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.65839  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1159  hypothetical protein  57.08 
 
 
473 aa  555  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1721  hypothetical protein  58.39 
 
 
468 aa  551  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3119  hypothetical protein  56.39 
 
 
475 aa  547  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3123  hypothetical protein  54.97 
 
 
475 aa  541  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3625  hypothetical protein  58.37 
 
 
472 aa  535  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2529  hypothetical protein  56.99 
 
 
468 aa  536  1e-151  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2217  hypothetical protein  57.02 
 
 
472 aa  531  1e-150  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2929  hypothetical protein  54.83 
 
 
475 aa  526  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1646  hypothetical protein  51.86 
 
 
460 aa  485  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3597  hypothetical protein  53.46 
 
 
463 aa  487  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3415  hypothetical protein  50 
 
 
476 aa  452  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4152  hypothetical protein  48.8 
 
 
467 aa  449  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5704  hypothetical protein  49.24 
 
 
459 aa  444  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0680852  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2332  hypothetical protein  45.18 
 
 
471 aa  375  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0625849  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  31.44 
 
 
455 aa  145  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  29.93 
 
 
451 aa  142  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  25.88 
 
 
452 aa  139  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.95 
 
 
475 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  30.77 
 
 
455 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.53 
 
 
456 aa  130  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  28.25 
 
 
456 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  29.3 
 
 
456 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  28.08 
 
 
465 aa  127  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1868  peptidase M20  28.18 
 
 
508 aa  126  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00940892  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  28.25 
 
 
462 aa  126  7e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  26.48 
 
 
451 aa  126  8.000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  29.44 
 
 
465 aa  126  8.000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  30.55 
 
 
496 aa  126  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  29.02 
 
 
465 aa  125  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  27.63 
 
 
465 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  27.63 
 
 
465 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  28.77 
 
 
452 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  28.6 
 
 
472 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  29.84 
 
 
453 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  27.66 
 
 
448 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  28.42 
 
 
453 aa  117  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  27.84 
 
 
467 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  28.54 
 
 
463 aa  117  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  29.47 
 
 
453 aa  117  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  28.07 
 
 
456 aa  116  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  29.32 
 
 
440 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  26 
 
 
459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  28.94 
 
 
467 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2325  peptidase dimerisation domain protein  24.3 
 
 
514 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.17 
 
 
406 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  26.71 
 
 
460 aa  111  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1840  peptidase M20  27.42 
 
 
448 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  26.15 
 
 
469 aa  110  5e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  29.22 
 
 
464 aa  110  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  27.97 
 
 
458 aa  109  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2605  peptidase dimerization domain protein  24.94 
 
 
514 aa  109  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3993  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2089  peptidase M20  30.59 
 
 
464 aa  107  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  28.76 
 
 
474 aa  106  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  29.76 
 
 
457 aa  106  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  30.55 
 
 
456 aa  105  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  25.57 
 
 
459 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  27.61 
 
 
459 aa  104  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  28.57 
 
 
457 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  28.35 
 
 
468 aa  104  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1520  peptidase M20  26.04 
 
 
488 aa  103  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.305754 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  27.18 
 
 
479 aa  103  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0429  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.25 
 
 
445 aa  102  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4034  peptidase dimerisation domain protein  26.21 
 
 
544 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.957672  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  25.8 
 
 
437 aa  102  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  27.71 
 
 
481 aa  102  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1258  peptidase dimerisation domain-containing protein  25.11 
 
 
513 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3920  peptidase dimerisation domain protein  26.21 
 
 
497 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.49046  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  28.93 
 
 
468 aa  100  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  27.23 
 
 
485 aa  99.4  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  30.64 
 
 
448 aa  99.4  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  28.04 
 
 
461 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  26.68 
 
 
461 aa  99  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  27.25 
 
 
470 aa  98.2  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  27.25 
 
 
457 aa  98.2  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0408  peptidase dimerization domain protein  25.61 
 
 
455 aa  97.1  6e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  27.74 
 
 
460 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  28.57 
 
 
452 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  30.67 
 
 
453 aa  95.5  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  28.15 
 
 
469 aa  94.7  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>