248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3123 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_1675  hypothetical protein  77.85 
 
 
473 aa  714    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3123  hypothetical protein  100 
 
 
475 aa  946    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1721  hypothetical protein  66.03 
 
 
468 aa  617  1e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1647  hypothetical protein  64.63 
 
 
477 aa  585  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1110  hypothetical protein  63.54 
 
 
473 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1590  hypothetical protein  63.76 
 
 
473 aa  581  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242767  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1567  hypothetical protein  63.54 
 
 
473 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1506  hypothetical protein  63.76 
 
 
473 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1486  hypothetical protein  63.54 
 
 
473 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.664586  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4728  hypothetical protein  62.01 
 
 
473 aa  570  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515691  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5121  hypothetical protein  59.52 
 
 
475 aa  557  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1159  hypothetical protein  59.2 
 
 
473 aa  558  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1764  hypothetical protein  60.04 
 
 
467 aa  555  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.278132  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3119  hypothetical protein  59.65 
 
 
475 aa  553  1e-156  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4729  hypothetical protein  54.97 
 
 
476 aa  541  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2929  hypothetical protein  57.02 
 
 
475 aa  542  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3656  hypothetical protein  60.13 
 
 
490 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.989996  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3819  hypothetical protein  55.89 
 
 
471 aa  538  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2519  hypothetical protein  58.71 
 
 
472 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1341  hypothetical protein  58.71 
 
 
472 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1265  hypothetical protein  58.71 
 
 
472 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662381  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2571  peptidase, M20/M25/M40 family  57.46 
 
 
475 aa  523  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2529  hypothetical protein  57.46 
 
 
468 aa  520  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3502  hypothetical protein  58.26 
 
 
472 aa  520  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.67786  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2217  hypothetical protein  57.02 
 
 
472 aa  518  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2262  hypothetical protein  56.26 
 
 
475 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2971  hypothetical protein  60.57 
 
 
478 aa  512  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.65839  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4378  hypothetical protein  57.39 
 
 
473 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1646  hypothetical protein  55.48 
 
 
460 aa  506  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3625  hypothetical protein  56.71 
 
 
472 aa  491  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4152  hypothetical protein  52.42 
 
 
467 aa  481  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3597  hypothetical protein  52.48 
 
 
463 aa  466  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3415  hypothetical protein  49.89 
 
 
476 aa  443  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5704  hypothetical protein  48.16 
 
 
459 aa  430  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0680852  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2332  hypothetical protein  49.08 
 
 
471 aa  357  1.9999999999999998e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0625849  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  32.94 
 
 
455 aa  159  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  32.18 
 
 
456 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  30.23 
 
 
465 aa  155  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  30.53 
 
 
462 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  28.44 
 
 
451 aa  146  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  33.16 
 
 
496 aa  142  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  33.15 
 
 
406 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.39 
 
 
475 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  30.32 
 
 
456 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  32.2 
 
 
452 aa  133  6.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  31.22 
 
 
453 aa  133  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.91 
 
 
456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  24.56 
 
 
452 aa  131  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  30.56 
 
 
440 aa  130  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  29.29 
 
 
456 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  28.53 
 
 
451 aa  129  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  28.1 
 
 
465 aa  126  8.000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  29.47 
 
 
453 aa  126  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  29.55 
 
 
465 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  29.09 
 
 
455 aa  123  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  29.24 
 
 
467 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  31.64 
 
 
468 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  29.12 
 
 
465 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2605  peptidase dimerization domain protein  27.68 
 
 
514 aa  121  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3993  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0429  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.55 
 
 
445 aa  121  3e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  29.12 
 
 
465 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2325  peptidase dimerisation domain protein  28.02 
 
 
514 aa  121  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1868  peptidase M20  26.7 
 
 
508 aa  120  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00940892  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  28.33 
 
 
469 aa  120  7e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  29.84 
 
 
459 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  28.27 
 
 
460 aa  118  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  27.25 
 
 
460 aa  117  3e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  31.3 
 
 
456 aa  117  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  28.46 
 
 
485 aa  117  6.9999999999999995e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  29.12 
 
 
463 aa  116  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  30.48 
 
 
479 aa  116  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  30.15 
 
 
458 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  30.57 
 
 
484 aa  114  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1640  hypothetical protein  28.12 
 
 
458 aa  114  5e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  26.84 
 
 
512 aa  112  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  27.92 
 
 
472 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  31.43 
 
 
464 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3920  peptidase dimerisation domain protein  27.36 
 
 
497 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.49046  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4034  peptidase dimerisation domain protein  27.36 
 
 
544 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.957672  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  31.13 
 
 
457 aa  110  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0692  peptidase M20  25.4 
 
 
450 aa  110  6e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  26.91 
 
 
453 aa  110  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  29.32 
 
 
468 aa  110  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  28.12 
 
 
458 aa  110  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  26.85 
 
 
463 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  30.44 
 
 
448 aa  108  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2219  peptidase M20  36.63 
 
 
476 aa  107  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342655  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1719  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  26.26 
 
 
448 aa  106  7e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4319  hypothetical protein  31.41 
 
 
445 aa  107  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.899733  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  28.2 
 
 
459 aa  106  8e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  30.81 
 
 
467 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  26.84 
 
 
458 aa  104  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1258  peptidase dimerisation domain-containing protein  26.98 
 
 
513 aa  104  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1840  peptidase M20  31.59 
 
 
448 aa  104  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2145  peptidase M20  33.06 
 
 
470 aa  104  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0790004  normal  0.0404303 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2089  peptidase M20  31.01 
 
 
464 aa  103  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  30.4 
 
 
470 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  29.43 
 
 
453 aa  103  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  29.43 
 
 
453 aa  103  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  29.43 
 
 
453 aa  103  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0188215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>