295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3415 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3415  hypothetical protein  100 
 
 
476 aa  954    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1646  hypothetical protein  53.06 
 
 
460 aa  486  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1159  hypothetical protein  52.25 
 
 
473 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2571  peptidase, M20/M25/M40 family  50.76 
 
 
475 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5121  hypothetical protein  50.77 
 
 
475 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2262  hypothetical protein  50.55 
 
 
475 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1764  hypothetical protein  52.06 
 
 
467 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.278132  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1506  hypothetical protein  52.61 
 
 
473 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1567  hypothetical protein  52.61 
 
 
473 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1590  hypothetical protein  52.39 
 
 
473 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242767  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1721  hypothetical protein  52.47 
 
 
468 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1110  hypothetical protein  52.39 
 
 
473 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4729  hypothetical protein  50 
 
 
476 aa  452  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1675  hypothetical protein  52.64 
 
 
473 aa  451  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3656  hypothetical protein  50.33 
 
 
490 aa  449  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.989996  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4728  hypothetical protein  51.54 
 
 
473 aa  450  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515691  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1486  hypothetical protein  51.96 
 
 
473 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.664586  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2929  hypothetical protein  50.88 
 
 
475 aa  449  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4378  hypothetical protein  50.87 
 
 
473 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3119  hypothetical protein  51.11 
 
 
475 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3819  hypothetical protein  50 
 
 
471 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1647  hypothetical protein  52.42 
 
 
477 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2529  hypothetical protein  50.65 
 
 
468 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2217  hypothetical protein  51 
 
 
472 aa  444  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3123  hypothetical protein  49.89 
 
 
475 aa  443  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3502  hypothetical protein  50.88 
 
 
472 aa  439  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.67786  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2971  hypothetical protein  50.98 
 
 
478 aa  437  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.65839  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2519  hypothetical protein  49.1 
 
 
472 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1265  hypothetical protein  49.1 
 
 
472 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662381  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1341  hypothetical protein  49.1 
 
 
472 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3625  hypothetical protein  50.64 
 
 
472 aa  421  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5704  hypothetical protein  45.47 
 
 
459 aa  411  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0680852  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3597  hypothetical protein  44.03 
 
 
463 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4152  hypothetical protein  43.93 
 
 
467 aa  389  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2332  hypothetical protein  45.68 
 
 
471 aa  362  1e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0625849  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  30.95 
 
 
452 aa  176  7e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  30.25 
 
 
451 aa  162  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  31.8 
 
 
455 aa  161  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  31.03 
 
 
465 aa  149  9e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  32 
 
 
496 aa  147  6e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  31.5 
 
 
456 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  30.79 
 
 
462 aa  144  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  30 
 
 
456 aa  142  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  28.64 
 
 
453 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  30.99 
 
 
479 aa  140  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  26.82 
 
 
456 aa  138  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  29.02 
 
 
458 aa  135  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  30.49 
 
 
469 aa  134  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.4 
 
 
406 aa  133  6e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  31.51 
 
 
465 aa  132  2.0000000000000002e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  29.78 
 
 
463 aa  131  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  29.74 
 
 
455 aa  131  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.09 
 
 
475 aa  128  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  27.98 
 
 
458 aa  127  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1868  peptidase M20  26.78 
 
 
508 aa  126  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00940892  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  28.36 
 
 
467 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.15 
 
 
456 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  29.7 
 
 
465 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  30.83 
 
 
440 aa  123  6e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  30.95 
 
 
445 aa  122  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  30.21 
 
 
464 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  33.43 
 
 
452 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  25.55 
 
 
451 aa  121  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  29.17 
 
 
459 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  29.27 
 
 
465 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  29.27 
 
 
465 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  25.87 
 
 
460 aa  121  3e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  30.77 
 
 
448 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0429  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.94 
 
 
445 aa  119  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2605  peptidase dimerization domain protein  26.24 
 
 
514 aa  117  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3993  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  28.61 
 
 
437 aa  116  7.999999999999999e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2325  peptidase dimerisation domain protein  25.74 
 
 
514 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1840  peptidase M20  30.49 
 
 
448 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  28.12 
 
 
453 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  26.54 
 
 
460 aa  114  3e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  28.46 
 
 
459 aa  113  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  30.91 
 
 
484 aa  113  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  26.03 
 
 
459 aa  113  8.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3920  peptidase dimerisation domain protein  24.65 
 
 
497 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.49046  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0692  peptidase M20  24.47 
 
 
450 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  27.65 
 
 
458 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4034  peptidase dimerisation domain protein  24.65 
 
 
544 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.957672  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  28.77 
 
 
448 aa  111  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  26.1 
 
 
453 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2219  peptidase M20  29.82 
 
 
476 aa  110  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342655  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  27.07 
 
 
463 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14090  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  28.4 
 
 
469 aa  109  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  29.58 
 
 
468 aa  109  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  28.4 
 
 
457 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1881  peptidase M20  31.81 
 
 
464 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676993 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  27.42 
 
 
457 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2089  peptidase M20  31.94 
 
 
464 aa  107  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1640  hypothetical protein  25.37 
 
 
458 aa  107  6e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  31.29 
 
 
452 aa  107  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  29.79 
 
 
467 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1520  peptidase M20  26.42 
 
 
488 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.305754 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  28.61 
 
 
461 aa  104  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3262  peptidase M20  30.43 
 
 
472 aa  104  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  27.96 
 
 
457 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  27.96 
 
 
470 aa  103  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>