278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1567 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1159  hypothetical protein  68.79 
 
 
473 aa  647    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4728  hypothetical protein  96.76 
 
 
473 aa  897    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515691  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1506  hypothetical protein  93.95 
 
 
473 aa  869    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1567  hypothetical protein  100 
 
 
473 aa  936    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1764  hypothetical protein  77.83 
 
 
467 aa  731    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.278132  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1110  hypothetical protein  98.94 
 
 
473 aa  929    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1486  hypothetical protein  94.17 
 
 
473 aa  870    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.664586  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1590  hypothetical protein  99.15 
 
 
473 aa  932    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242767  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1647  hypothetical protein  93.52 
 
 
477 aa  867    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5121  hypothetical protein  64.5 
 
 
475 aa  625  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3656  hypothetical protein  66.09 
 
 
490 aa  615  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.989996  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2519  hypothetical protein  66.59 
 
 
472 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1265  hypothetical protein  66.59 
 
 
472 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662381  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1341  hypothetical protein  66.59 
 
 
472 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2971  hypothetical protein  67.16 
 
 
478 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.65839  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4378  hypothetical protein  64.27 
 
 
473 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2571  peptidase, M20/M25/M40 family  63.15 
 
 
475 aa  598  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2262  hypothetical protein  62.82 
 
 
475 aa  598  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4729  hypothetical protein  62.05 
 
 
476 aa  600  1e-170  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1721  hypothetical protein  62.31 
 
 
468 aa  583  1.0000000000000001e-165  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1675  hypothetical protein  64.04 
 
 
473 aa  583  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3819  hypothetical protein  61.32 
 
 
471 aa  582  1.0000000000000001e-165  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3123  hypothetical protein  63.54 
 
 
475 aa  580  1e-164  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3502  hypothetical protein  61.56 
 
 
472 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.67786  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3119  hypothetical protein  59.74 
 
 
475 aa  553  1e-156  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2217  hypothetical protein  59.08 
 
 
472 aa  553  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2929  hypothetical protein  58.47 
 
 
475 aa  554  1e-156  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2529  hypothetical protein  58.64 
 
 
468 aa  541  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3625  hypothetical protein  61.56 
 
 
472 aa  540  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1646  hypothetical protein  54.45 
 
 
460 aa  505  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4152  hypothetical protein  50.98 
 
 
467 aa  476  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3597  hypothetical protein  54.19 
 
 
463 aa  475  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5704  hypothetical protein  50.43 
 
 
459 aa  456  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0680852  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3415  hypothetical protein  52.61 
 
 
476 aa  457  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2332  hypothetical protein  51.28 
 
 
471 aa  392  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0625849  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  31.47 
 
 
462 aa  158  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  33.68 
 
 
496 aa  156  7e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  32.3 
 
 
455 aa  154  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  30.92 
 
 
456 aa  153  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  33.68 
 
 
469 aa  150  4e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  28.97 
 
 
456 aa  146  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  31.49 
 
 
451 aa  144  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  27.88 
 
 
451 aa  136  7.000000000000001e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.35 
 
 
456 aa  136  8e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  28.5 
 
 
456 aa  135  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  28.37 
 
 
465 aa  135  9.999999999999999e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  27.07 
 
 
452 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.15 
 
 
475 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  29.03 
 
 
455 aa  134  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  29.41 
 
 
453 aa  134  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  28.82 
 
 
465 aa  131  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  29.7 
 
 
465 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  29.47 
 
 
465 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  29.47 
 
 
465 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3920  peptidase dimerisation domain protein  29.28 
 
 
497 aa  130  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.49046  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  30.87 
 
 
485 aa  130  7.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4034  peptidase dimerisation domain protein  29.15 
 
 
544 aa  130  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.957672  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  29.88 
 
 
452 aa  130  7.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  30.15 
 
 
458 aa  127  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  30.52 
 
 
440 aa  126  8.000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2325  peptidase dimerisation domain protein  27.33 
 
 
514 aa  126  9e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.43 
 
 
406 aa  126  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  28.12 
 
 
460 aa  126  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  32.38 
 
 
467 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  31.5 
 
 
468 aa  124  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  30.37 
 
 
459 aa  124  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  32.25 
 
 
445 aa  123  6e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0429  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.34 
 
 
445 aa  122  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  29.11 
 
 
467 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  30.05 
 
 
461 aa  121  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2605  peptidase dimerization domain protein  27.38 
 
 
514 aa  120  7e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3993  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1868  peptidase M20  26.97 
 
 
508 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00940892  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  31.79 
 
 
464 aa  117  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  30.14 
 
 
457 aa  117  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  28.47 
 
 
468 aa  117  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.91 
 
 
463 aa  117  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  32.1 
 
 
448 aa  116  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  28.85 
 
 
463 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2697  peptidase M20  31.71 
 
 
451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.922328 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  29.93 
 
 
456 aa  114  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  28.35 
 
 
453 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  28.43 
 
 
459 aa  114  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  27.53 
 
 
472 aa  113  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0692  peptidase M20  26.82 
 
 
450 aa  113  8.000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1840  peptidase M20  32.25 
 
 
448 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  29.26 
 
 
481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12240  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  33.87 
 
 
488 aa  112  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4319  hypothetical protein  31.76 
 
 
445 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.899733  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  28.12 
 
 
437 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  30.69 
 
 
474 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2089  peptidase M20  31.58 
 
 
464 aa  110  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2145  peptidase M20  32.71 
 
 
470 aa  110  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0790004  normal  0.0404303 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  29.67 
 
 
479 aa  109  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  32.21 
 
 
452 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0480  Beta-Ala-His dipeptidase  28.86 
 
 
453 aa  107  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  29.85 
 
 
471 aa  107  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  27.2 
 
 
460 aa  107  5e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  29.85 
 
 
471 aa  107  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  31.82 
 
 
470 aa  107  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1520  peptidase M20  26.99 
 
 
488 aa  107  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.305754 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>