More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3597 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3597  hypothetical protein  100 
 
 		 463 aa  944    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5704  hypothetical protein  58.41 
 
 		 459 aa  536  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0680852  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4729  hypothetical protein  53.46 
 
 		 476 aa  487  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3656  hypothetical protein  53.9 
 
 		 490 aa  482  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.989996  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1721  hypothetical protein  53.45 
 
 		 468 aa  478  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4728  hypothetical protein  54.57 
 
 		 473 aa  476  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3819  hypothetical protein  51.91 
 
 		 471 aa  475  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5121  hypothetical protein  51.95 
 
 		 475 aa  473  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1567  hypothetical protein  54.19 
 
 		 473 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1590  hypothetical protein  53.98 
 
 		 473 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242767  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1110  hypothetical protein  53.98 
 
 		 473 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1486  hypothetical protein  53.12 
 
 		 473 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.664586  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1506  hypothetical protein  53.12 
 
 		 473 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3123  hypothetical protein  52.48 
 
 		 475 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1764  hypothetical protein  54.66 
 
 		 467 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.278132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1647  hypothetical protein  53.48 
 
 		 477 aa  462  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1159  hypothetical protein  52.51 
 
 		 473 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2571  peptidase, M20/M25/M40 family  50.22 
 
 		 475 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4378  hypothetical protein  51.72 
 
 		 473 aa  456  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2262  hypothetical protein  49.35 
 
 		 475 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2971  hypothetical protein  52.6 
 
 		 478 aa  450  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.65839  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1675  hypothetical protein  50.22 
 
 		 473 aa  447  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3502  hypothetical protein  50.11 
 
 		 472 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.67786  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1646  hypothetical protein  49.57 
 
 		 460 aa  442  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3625  hypothetical protein  51.52 
 
 		 472 aa  434  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1265  hypothetical protein  48.92 
 
 		 472 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662381  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2519  hypothetical protein  48.92 
 
 		 472 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1341  hypothetical protein  48.92 
 
 		 472 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3119  hypothetical protein  49.24 
 
 		 475 aa  429  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2529  hypothetical protein  47.96 
 
 		 468 aa  426  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2217  hypothetical protein  47.96 
 
 		 472 aa  425  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2929  hypothetical protein  47.84 
 
 		 475 aa  420  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4152  hypothetical protein  47.62 
 
 		 467 aa  409  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3415  hypothetical protein  44.03 
 
 		 476 aa  405  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2332  hypothetical protein  49.77 
 
 		 471 aa  377  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0625849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  29.43 
 
 		 455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  27.56 
 
 		 452 aa  147  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  28.04 
 
 		 456 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  27.44 
 
 		 462 aa  138  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  30.77 
 
 		 452 aa  134  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  30.18 
 
 		 451 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1868  peptidase M20  27.17 
 
 		 508 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00940892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  28.13 
 
 		 458 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  29.06 
 
 		 496 aa  127  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  28.93 
 
 		 465 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  28.93 
 
 		 465 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  28.93 
 
 		 465 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  28.45 
 
 		 467 aa  124  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1840  peptidase M20  30.86 
 
 		 448 aa  123  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  30.07 
 
 		 453 aa  123  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  27.48 
 
 		 456 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.64 
 
 		 456 aa  121  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  29.75 
 
 		 440 aa  119  9e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.96 
 
 		 475 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0692  peptidase M20  25.55 
 
 		 450 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  30.7 
 
 		 448 aa  117  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  29.05 
 
 		 453 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  36.41 
 
 		 406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  28.65 
 
 		 455 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  29.5 
 
 		 469 aa  114  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  26.55 
 
 		 460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12240  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  31.38 
 
 		 488 aa  112  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0429  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.25 
 
 		 445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4319  hypothetical protein  29.91 
 
 		 445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.899733  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  26.74 
 
 		 467 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2697  peptidase M20  29.69 
 
 		 451 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.922328 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  24.43 
 
 		 451 aa  110  4.0000000000000004e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2089  peptidase M20  29.02 
 
 		 464 aa  110  6e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  26.43 
 
 		 463 aa  110  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  26.09 
 
 		 456 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  31.65 
 
 		 457 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  25 
 
 		 471 aa  108  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  25 
 
 		 471 aa  108  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  26.04 
 
 		 469 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  26.3 
 
 		 461 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  25.55 
 
 		 457 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  24.35 
 
 		 465 aa  107  6e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  26.58 
 
 		 472 aa  106  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  26.27 
 
 		 474 aa  106  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14090  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  31.15 
 
 		 469 aa  106  9e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2325  peptidase dimerisation domain protein  24.5 
 
 		 514 aa  106  9e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  24.82 
 
 		 458 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  24.36 
 
 		 465 aa  106  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  29.26 
 
 		 460 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  29.8 
 
 		 453 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0824  hypothetical protein  28.48 
 
 		 455 aa  105  3e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  29.54 
 
 		 484 aa  104  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  29.8 
 
 		 453 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  29.8 
 
 		 453 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  24.05 
 
 		 471 aa  104  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  28.33 
 
 		 458 aa  104  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  27.71 
 
 		 453 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1520  peptidase M20  26.41 
 
 		 488 aa  103  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.305754 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  27.38 
 
 		 461 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  28.07 
 
 		 459 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  29.69 
 
 		 459 aa  102  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  23.91 
 
 		 460 aa  102  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3920  peptidase dimerisation domain protein  24.68 
 
 		 497 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.49046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2605  peptidase dimerization domain protein  23.96 
 
 		 514 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3993  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  27.17 
 
 		 462 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>