More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2929 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3119  hypothetical protein  82.17 
 
 
475 aa  808    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2529  hypothetical protein  67.74 
 
 
468 aa  647    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2929  hypothetical protein  100 
 
 
475 aa  973    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2217  hypothetical protein  65.81 
 
 
472 aa  641    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1647  hypothetical protein  61.62 
 
 
477 aa  565  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1506  hypothetical protein  60.31 
 
 
473 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1486  hypothetical protein  59.87 
 
 
473 aa  555  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.664586  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1567  hypothetical protein  59.65 
 
 
473 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1590  hypothetical protein  59.43 
 
 
473 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242767  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1764  hypothetical protein  59.52 
 
 
467 aa  550  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.278132  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4728  hypothetical protein  58.35 
 
 
473 aa  549  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515691  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1110  hypothetical protein  58.57 
 
 
473 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3123  hypothetical protein  57.02 
 
 
475 aa  542  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2571  peptidase, M20/M25/M40 family  54.06 
 
 
475 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2519  hypothetical protein  56.48 
 
 
472 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1265  hypothetical protein  56.48 
 
 
472 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662381  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4729  hypothetical protein  54.83 
 
 
476 aa  526  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3819  hypothetical protein  56.6 
 
 
471 aa  527  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1341  hypothetical protein  56.48 
 
 
472 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4378  hypothetical protein  55.84 
 
 
473 aa  523  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1159  hypothetical protein  55.67 
 
 
473 aa  524  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3502  hypothetical protein  56.29 
 
 
472 aa  521  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.67786  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2262  hypothetical protein  53.21 
 
 
475 aa  518  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1675  hypothetical protein  54.78 
 
 
473 aa  520  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1721  hypothetical protein  56.33 
 
 
468 aa  520  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3656  hypothetical protein  54.51 
 
 
490 aa  508  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.989996  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5121  hypothetical protein  53.02 
 
 
475 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2971  hypothetical protein  55.02 
 
 
478 aa  503  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.65839  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3625  hypothetical protein  53.6 
 
 
472 aa  479  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1646  hypothetical protein  51.75 
 
 
460 aa  474  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3415  hypothetical protein  50.88 
 
 
476 aa  449  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4152  hypothetical protein  49.89 
 
 
467 aa  450  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3597  hypothetical protein  47.84 
 
 
463 aa  420  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5704  hypothetical protein  47.3 
 
 
459 aa  417  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0680852  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2332  hypothetical protein  47.88 
 
 
471 aa  352  1e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0625849  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  31.33 
 
 
455 aa  158  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  30.56 
 
 
456 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  29.23 
 
 
452 aa  149  7e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  27.86 
 
 
451 aa  142  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  32.95 
 
 
452 aa  137  6.0000000000000005e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  31.73 
 
 
440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  28.76 
 
 
456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  26.52 
 
 
465 aa  132  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  29.64 
 
 
451 aa  131  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  26.87 
 
 
465 aa  126  8.000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  28.47 
 
 
460 aa  126  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  29.47 
 
 
453 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  29.47 
 
 
453 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0429  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.2 
 
 
445 aa  125  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  29.47 
 
 
453 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  29.13 
 
 
453 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.95 
 
 
406 aa  123  8e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  27.74 
 
 
479 aa  122  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  28.31 
 
 
496 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  29.08 
 
 
469 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  29.48 
 
 
456 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  26.56 
 
 
462 aa  119  7.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1868  peptidase M20  25.2 
 
 
508 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00940892  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  28.07 
 
 
463 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  28.43 
 
 
465 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  28.47 
 
 
467 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  28.46 
 
 
458 aa  117  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  28.18 
 
 
456 aa  116  7.999999999999999e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  26.25 
 
 
456 aa  116  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1258  peptidase dimerisation domain-containing protein  25.69 
 
 
513 aa  116  7.999999999999999e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  27.68 
 
 
465 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  27.68 
 
 
465 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  29.4 
 
 
453 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  27.78 
 
 
460 aa  113  7.000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1640  hypothetical protein  24.35 
 
 
458 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  25.98 
 
 
459 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  26.32 
 
 
475 aa  111  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  25.32 
 
 
458 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  28.33 
 
 
448 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2697  peptidase M20  28.77 
 
 
451 aa  108  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.922328 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  28.65 
 
 
457 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  29.24 
 
 
462 aa  107  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  30.07 
 
 
453 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  25.19 
 
 
459 aa  107  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2325  peptidase dimerisation domain protein  24.65 
 
 
514 aa  106  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  28.22 
 
 
448 aa  106  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  28.5 
 
 
471 aa  105  1e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  27.78 
 
 
485 aa  105  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  30.51 
 
 
468 aa  105  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1719  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  25.68 
 
 
448 aa  105  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2605  peptidase dimerization domain protein  24.89 
 
 
514 aa  104  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3993  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  27.76 
 
 
455 aa  104  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  25.44 
 
 
463 aa  104  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0824  hypothetical protein  26.2 
 
 
455 aa  104  4e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  28.21 
 
 
453 aa  103  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1840  peptidase M20  28.77 
 
 
448 aa  103  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  29.14 
 
 
467 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  29.08 
 
 
452 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3920  peptidase dimerisation domain protein  25.57 
 
 
497 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.49046  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3301  hypothetical protein  40.54 
 
 
449 aa  102  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653299  normal  0.0124999 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0408  peptidase dimerization domain protein  30.42 
 
 
455 aa  101  2e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0692  peptidase M20  23.14 
 
 
450 aa  101  4e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4034  peptidase dimerisation domain protein  25.57 
 
 
544 aa  101  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.957672  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  26.48 
 
 
458 aa  100  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0916  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.45 
 
 
521 aa  99.8  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>