291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2529 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_2217  hypothetical protein  91.01 
 
 
472 aa  855    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2529  hypothetical protein  100 
 
 
468 aa  961    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2929  hypothetical protein  67.74 
 
 
475 aa  666    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3119  hypothetical protein  69.53 
 
 
475 aa  678    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1506  hypothetical protein  59.21 
 
 
473 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1647  hypothetical protein  59.08 
 
 
477 aa  555  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1486  hypothetical protein  58.55 
 
 
473 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.664586  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1590  hypothetical protein  58.42 
 
 
473 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242767  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1567  hypothetical protein  58.64 
 
 
473 aa  554  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4728  hypothetical protein  57.99 
 
 
473 aa  550  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515691  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3656  hypothetical protein  58 
 
 
490 aa  548  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.989996  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1110  hypothetical protein  58.21 
 
 
473 aa  551  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1159  hypothetical protein  57.8 
 
 
473 aa  545  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1764  hypothetical protein  58.21 
 
 
467 aa  546  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.278132  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4729  hypothetical protein  56.99 
 
 
476 aa  546  1e-154  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3819  hypothetical protein  57.63 
 
 
471 aa  540  9.999999999999999e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3123  hypothetical protein  56.83 
 
 
475 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5121  hypothetical protein  56.84 
 
 
475 aa  537  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2571  peptidase, M20/M25/M40 family  55.82 
 
 
475 aa  532  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1265  hypothetical protein  55.85 
 
 
472 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662381  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2519  hypothetical protein  55.85 
 
 
472 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1721  hypothetical protein  56.77 
 
 
468 aa  525  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3502  hypothetical protein  56.26 
 
 
472 aa  523  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.67786  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2262  hypothetical protein  54.31 
 
 
475 aa  522  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1341  hypothetical protein  55.78 
 
 
472 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1675  hypothetical protein  56.33 
 
 
473 aa  522  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4378  hypothetical protein  56.36 
 
 
473 aa  520  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2971  hypothetical protein  56.01 
 
 
478 aa  511  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.65839  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3625  hypothetical protein  55.22 
 
 
472 aa  497  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1646  hypothetical protein  51.54 
 
 
460 aa  485  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3415  hypothetical protein  51.1 
 
 
476 aa  456  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4152  hypothetical protein  47.89 
 
 
467 aa  438  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3597  hypothetical protein  47.96 
 
 
463 aa  433  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5704  hypothetical protein  48.38 
 
 
459 aa  417  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0680852  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2332  hypothetical protein  45.37 
 
 
471 aa  362  1e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0625849  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  31.72 
 
 
456 aa  156  7e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  28.4 
 
 
452 aa  155  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  30.31 
 
 
455 aa  150  5e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  32.11 
 
 
496 aa  142  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  31.3 
 
 
451 aa  138  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.4 
 
 
456 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  29.19 
 
 
451 aa  136  6.0000000000000005e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  27.62 
 
 
469 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  32.16 
 
 
452 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  28.93 
 
 
455 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  27.45 
 
 
465 aa  130  4.0000000000000003e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  28.86 
 
 
456 aa  130  6e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  29.92 
 
 
453 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.13 
 
 
475 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  27.64 
 
 
462 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  26.97 
 
 
465 aa  128  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  27.44 
 
 
479 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  29.23 
 
 
467 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  27.94 
 
 
465 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  28.46 
 
 
456 aa  121  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1868  peptidase M20  26.83 
 
 
508 aa  119  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00940892  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  28.15 
 
 
460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  27.66 
 
 
465 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  27.66 
 
 
465 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  27.68 
 
 
459 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  35.96 
 
 
406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  28.12 
 
 
457 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  29.07 
 
 
468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  29.07 
 
 
457 aa  114  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  29.44 
 
 
463 aa  114  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  31.34 
 
 
453 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  27.64 
 
 
453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  27.14 
 
 
458 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  27.64 
 
 
453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  27.64 
 
 
453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  27.34 
 
 
440 aa  111  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  27.78 
 
 
460 aa  111  3e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2325  peptidase dimerisation domain protein  24.94 
 
 
514 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2605  peptidase dimerization domain protein  24.8 
 
 
514 aa  110  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3993  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4034  peptidase dimerisation domain protein  25.32 
 
 
544 aa  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.957672  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3920  peptidase dimerisation domain protein  25.32 
 
 
497 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.49046  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0429  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24 
 
 
445 aa  108  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  26.65 
 
 
458 aa  107  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  27.6 
 
 
448 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  27.54 
 
 
459 aa  107  6e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  27.37 
 
 
470 aa  107  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  29.66 
 
 
456 aa  106  8e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  28.68 
 
 
481 aa  106  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  28.07 
 
 
484 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  24.42 
 
 
512 aa  105  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0824  hypothetical protein  31.4 
 
 
455 aa  105  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78234  Glutamate carboxypeptidase-like protein  25.76 
 
 
481 aa  104  3e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  25.79 
 
 
463 aa  104  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  27.38 
 
 
468 aa  103  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  27.27 
 
 
452 aa  103  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  29.08 
 
 
464 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  29.37 
 
 
485 aa  102  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1520  peptidase M20  25.06 
 
 
488 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.305754 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  29.69 
 
 
460 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0692  peptidase M20  24.66 
 
 
450 aa  101  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1719  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  25.45 
 
 
448 aa  100  5e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  25.8 
 
 
458 aa  100  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2145  peptidase M20  26.8 
 
 
470 aa  100  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0790004  normal  0.0404303 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  27.65 
 
 
437 aa  99.8  9e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  26.85 
 
 
453 aa  99  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>