293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1721 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1721  hypothetical protein  100 
 
 		 468 aa  941    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1675  hypothetical protein  70.35 
 
 		 473 aa  656    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3123  hypothetical protein  66.03 
 
 		 475 aa  617  1e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1567  hypothetical protein  62.42 
 
 		 473 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1110  hypothetical protein  62.63 
 
 		 473 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1590  hypothetical protein  62.63 
 
 		 473 aa  581  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242767  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1486  hypothetical protein  61.56 
 
 		 473 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.664586  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1647  hypothetical protein  62.72 
 
 		 477 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1506  hypothetical protein  61.56 
 
 		 473 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4728  hypothetical protein  61.4 
 
 		 473 aa  568  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1159  hypothetical protein  60.66 
 
 		 473 aa  565  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1764  hypothetical protein  60.75 
 
 		 467 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.278132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5121  hypothetical protein  57.48 
 
 		 475 aa  555  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2519  hypothetical protein  59.96 
 
 		 472 aa  551  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1265  hypothetical protein  59.96 
 
 		 472 aa  551  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662381  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4729  hypothetical protein  58.39 
 
 		 476 aa  551  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1341  hypothetical protein  59.96 
 
 		 472 aa  551  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2262  hypothetical protein  57.36 
 
 		 475 aa  543  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3502  hypothetical protein  58.82 
 
 		 472 aa  541  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.67786  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3656  hypothetical protein  58.48 
 
 		 490 aa  535  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.989996  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3119  hypothetical protein  58.08 
 
 		 475 aa  536  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2571  peptidase, M20/M25/M40 family  56.93 
 
 		 475 aa  535  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4378  hypothetical protein  58.35 
 
 		 473 aa  529  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3819  hypothetical protein  56.25 
 
 		 471 aa  525  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2929  hypothetical protein  56.33 
 
 		 475 aa  520  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2217  hypothetical protein  57.08 
 
 		 472 aa  513  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2971  hypothetical protein  58.91 
 
 		 478 aa  512  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.65839  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2529  hypothetical protein  56.77 
 
 		 468 aa  514  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3625  hypothetical protein  57.73 
 
 		 472 aa  508  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4152  hypothetical protein  52.86 
 
 		 467 aa  487  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3597  hypothetical protein  53.45 
 
 		 463 aa  478  1e-134  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1646  hypothetical protein  51.32 
 
 		 460 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3415  hypothetical protein  52.47 
 
 		 476 aa  452  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5704  hypothetical protein  50.87 
 
 		 459 aa  443  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0680852  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2332  hypothetical protein  46.9 
 
 		 471 aa  374  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0625849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  32.09 
 
 		 455 aa  156  8e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  31.38 
 
 		 462 aa  150  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  29.09 
 
 		 456 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  32.29 
 
 		 406 aa  146  8.000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  33.25 
 
 		 496 aa  142  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  28.57 
 
 		 456 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  29.2 
 
 		 451 aa  138  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  27.32 
 
 		 452 aa  137  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  28.06 
 
 		 451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  30.44 
 
 		 465 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  28.95 
 
 		 465 aa  132  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  29.18 
 
 		 467 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  30.14 
 
 		 452 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  28.65 
 
 		 453 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  26.99 
 
 		 465 aa  130  6e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  30.21 
 
 		 465 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  29.19 
 
 		 453 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  31.55 
 
 		 440 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  30.21 
 
 		 465 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  30.09 
 
 		 469 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  30.79 
 
 		 462 aa  127  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  26.92 
 
 		 456 aa  126  9e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4034  peptidase dimerisation domain protein  27.35 
 
 		 544 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.957672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  29.79 
 
 		 471 aa  125  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  29.79 
 
 		 471 aa  125  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  28.83 
 
 		 468 aa  125  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3920  peptidase dimerisation domain protein  27.35 
 
 		 497 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.49046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  26.39 
 
 		 459 aa  125  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  28.94 
 
 		 479 aa  123  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  27.29 
 
 		 460 aa  123  7e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0480  Beta-Ala-His dipeptidase  27.68 
 
 		 453 aa  123  7e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  31.05 
 
 		 484 aa  123  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  32 
 
 		 455 aa  123  9e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  28.06 
 
 		 485 aa  122  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  27.78 
 
 		 463 aa  121  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2219  peptidase M20  30.56 
 
 		 476 aa  122  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342655  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2605  peptidase dimerization domain protein  25.71 
 
 		 514 aa  121  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3993  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  28.99 
 
 		 462 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2325  peptidase dimerisation domain protein  25.14 
 
 		 514 aa  120  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  29.76 
 
 		 467 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  29.26 
 
 		 448 aa  119  9e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.8 
 
 		 456 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  26.88 
 
 		 469 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2145  peptidase M20  32.4 
 
 		 470 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0790004  normal  0.0404303 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  28.28 
 
 		 458 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  27.45 
 
 		 461 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  30.85 
 
 		 452 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  27.05 
 
 		 460 aa  117  3.9999999999999997e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1258  peptidase dimerisation domain-containing protein  26.42 
 
 		 513 aa  117  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14090  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  31.76 
 
 		 469 aa  116  8.999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  29.2 
 
 		 462 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  26.85 
 
 		 459 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  28.26 
 
 		 463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12240  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  32.45 
 
 		 488 aa  114  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  28.3 
 
 		 462 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  31.51 
 
 		 468 aa  114  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  27.27 
 
 		 463 aa  114  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1520  peptidase M20  27.23 
 
 		 488 aa  114  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.305754 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  31.11 
 
 		 456 aa  113  7.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  28.76 
 
 		 445 aa  113  7.000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  27.81 
 
 		 475 aa  113  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  30.52 
 
 		 453 aa  113  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  30.52 
 
 		 453 aa  113  9e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  30.52 
 
 		 453 aa  113  9e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  29.97 
 
 		 460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>