More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2971 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4378  hypothetical protein  76.12 
 
 		 473 aa  714    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2971  hypothetical protein  100 
 
 		 478 aa  939    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.65839  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3656  hypothetical protein  86.86 
 
 		 490 aa  820    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.989996  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1506  hypothetical protein  68.25 
 
 		 473 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1486  hypothetical protein  68.03 
 
 		 473 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.664586  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1567  hypothetical protein  67.39 
 
 		 473 aa  624  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1110  hypothetical protein  67.39 
 
 		 473 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1590  hypothetical protein  67.6 
 
 		 473 aa  624  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242767  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4728  hypothetical protein  65.44 
 
 		 473 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1647  hypothetical protein  67.46 
 
 		 477 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2571  peptidase, M20/M25/M40 family  62.09 
 
 		 475 aa  592  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1764  hypothetical protein  64.18 
 
 		 467 aa  594  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.278132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2262  hypothetical protein  61.66 
 
 		 475 aa  589  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1341  hypothetical protein  65.49 
 
 		 472 aa  585  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1265  hypothetical protein  65.42 
 
 		 472 aa  586  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662381  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2519  hypothetical protein  65.42 
 
 		 472 aa  586  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1159  hypothetical protein  63.02 
 
 		 473 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4729  hypothetical protein  59.49 
 
 		 476 aa  576  1.0000000000000001e-163  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5121  hypothetical protein  61.03 
 
 		 475 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1675  hypothetical protein  63.42 
 
 		 473 aa  554  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3819  hypothetical protein  57.63 
 
 		 471 aa  552  1e-156  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3119  hypothetical protein  58.15 
 
 		 475 aa  532  1e-150  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1646  hypothetical protein  57.21 
 
 		 460 aa  525  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3123  hypothetical protein  60.57 
 
 		 475 aa  526  1e-148  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1721  hypothetical protein  58.91 
 
 		 468 aa  524  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2929  hypothetical protein  55.02 
 
 		 475 aa  520  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2529  hypothetical protein  56.01 
 
 		 468 aa  509  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2217  hypothetical protein  56.68 
 
 		 472 aa  510  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3502  hypothetical protein  56.41 
 
 		 472 aa  504  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.67786  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3625  hypothetical protein  57.69 
 
 		 472 aa  501  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3597  hypothetical protein  52.6 
 
 		 463 aa  467  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5704  hypothetical protein  51.08 
 
 		 459 aa  464  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0680852  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3415  hypothetical protein  50.98 
 
 		 476 aa  448  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4152  hypothetical protein  46.74 
 
 		 467 aa  416  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2332  hypothetical protein  51.95 
 
 		 471 aa  395  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0625849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  26.89 
 
 		 452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  30.7 
 
 		 455 aa  147  5e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  32.87 
 
 		 496 aa  142  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  29.88 
 
 		 462 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  29.05 
 
 		 451 aa  141  3e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  30.34 
 
 		 456 aa  140  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  28.03 
 
 		 456 aa  134  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  29.36 
 
 		 451 aa  133  6.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  30.46 
 
 		 456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4034  peptidase dimerisation domain protein  28.87 
 
 		 544 aa  130  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.957672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3920  peptidase dimerisation domain protein  28.66 
 
 		 497 aa  130  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.49046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  29.06 
 
 		 455 aa  127  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2605  peptidase dimerization domain protein  26.93 
 
 		 514 aa  126  7e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3993  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2325  peptidase dimerisation domain protein  26.55 
 
 		 514 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  28.37 
 
 		 465 aa  125  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  31.44 
 
 		 467 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1868  peptidase M20  25.56 
 
 		 508 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00940892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  34.27 
 
 		 452 aa  124  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  27.82 
 
 		 460 aa  123  6e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  29.72 
 
 		 469 aa  123  6e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  28.83 
 
 		 465 aa  121  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  29.5 
 
 		 453 aa  121  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.47 
 
 		 456 aa  121  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  29.34 
 
 		 453 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  30.7 
 
 		 457 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  31.51 
 
 		 468 aa  117  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  31 
 
 		 440 aa  116  7.999999999999999e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  27.99 
 
 		 468 aa  114  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.46 
 
 		 475 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.82 
 
 		 406 aa  114  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1258  peptidase dimerisation domain-containing protein  27.66 
 
 		 513 aa  114  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  27.9 
 
 		 472 aa  113  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  31.08 
 
 		 465 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  28.26 
 
 		 470 aa  112  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  29.57 
 
 		 479 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  29.1 
 
 		 461 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  31.08 
 
 		 465 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  32.53 
 
 		 453 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  29.32 
 
 		 474 aa  111  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  32.53 
 
 		 453 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  27.86 
 
 		 459 aa  111  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2219  peptidase M20  29.4 
 
 		 476 aa  111  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342655  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  32.53 
 
 		 453 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  29.17 
 
 		 485 aa  110  5e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0692  peptidase M20  24.4 
 
 		 450 aa  110  6e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0824  hypothetical protein  27.83 
 
 		 455 aa  110  8.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  30.84 
 
 		 465 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  27.7 
 
 		 460 aa  109  9.000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  30.45 
 
 		 445 aa  109  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0429  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.47 
 
 		 445 aa  109  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  27.07 
 
 		 458 aa  109  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12240  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  33.22 
 
 		 488 aa  108  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  28.81 
 
 		 458 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  27.51 
 
 		 463 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4319  hypothetical protein  29.26 
 
 		 445 aa  108  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.899733  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  29.55 
 
 		 467 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  29.36 
 
 		 484 aa  107  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  30.82 
 
 		 460 aa  107  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  29.1 
 
 		 459 aa  107  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  27.33 
 
 		 457 aa  106  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  27.27 
 
 		 458 aa  106  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  29.75 
 
 		 456 aa  106  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  30.5 
 
 		 470 aa  106  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  29.79 
 
 		 448 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  29.37 
 
 		 471 aa  104  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>