278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2217 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2217  hypothetical protein  100 
 
 		 472 aa  969    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2529  hypothetical protein  91.01 
 
 		 468 aa  853    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3119  hypothetical protein  67.95 
 
 		 475 aa  670    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2929  hypothetical protein  65.81 
 
 		 475 aa  657    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1506  hypothetical protein  59.65 
 
 		 473 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1647  hypothetical protein  59.52 
 
 		 477 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1590  hypothetical protein  58.86 
 
 		 473 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242767  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1567  hypothetical protein  59.08 
 
 		 473 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4728  hypothetical protein  58.42 
 
 		 473 aa  560  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1110  hypothetical protein  58.64 
 
 		 473 aa  561  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1159  hypothetical protein  58.68 
 
 		 473 aa  558  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1486  hypothetical protein  58.99 
 
 		 473 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.664586  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1764  hypothetical protein  57.99 
 
 		 467 aa  547  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.278132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3656  hypothetical protein  58 
 
 		 490 aa  545  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.989996  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4729  hypothetical protein  57.02 
 
 		 476 aa  542  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1265  hypothetical protein  57.02 
 
 		 472 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662381  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2519  hypothetical protein  57.02 
 
 		 472 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3123  hypothetical protein  57.02 
 
 		 475 aa  535  1e-151  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5121  hypothetical protein  56.01 
 
 		 475 aa  531  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1341  hypothetical protein  57.02 
 
 		 472 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2571  peptidase, M20/M25/M40 family  55.63 
 
 		 475 aa  529  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3819  hypothetical protein  56.29 
 
 		 471 aa  525  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4378  hypothetical protein  56.66 
 
 		 473 aa  527  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3502  hypothetical protein  56.29 
 
 		 472 aa  522  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.67786  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1721  hypothetical protein  57.08 
 
 		 468 aa  524  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2262  hypothetical protein  54.55 
 
 		 475 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1675  hypothetical protein  55.87 
 
 		 473 aa  521  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2971  hypothetical protein  56.68 
 
 		 478 aa  511  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.65839  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3625  hypothetical protein  55.22 
 
 		 472 aa  495  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1646  hypothetical protein  51.32 
 
 		 460 aa  486  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3415  hypothetical protein  51 
 
 		 476 aa  453  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4152  hypothetical protein  48.34 
 
 		 467 aa  442  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3597  hypothetical protein  47.96 
 
 		 463 aa  432  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5704  hypothetical protein  49.03 
 
 		 459 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0680852  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2332  hypothetical protein  45.09 
 
 		 471 aa  359  5e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0625849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  31.32 
 
 		 455 aa  156  9e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  28.47 
 
 		 452 aa  152  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  31.23 
 
 		 456 aa  150  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  32.31 
 
 		 496 aa  139  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.88 
 
 		 456 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  29.79 
 
 		 465 aa  136  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  28.4 
 
 		 469 aa  136  9e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  30.59 
 
 		 451 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  29.64 
 
 		 451 aa  133  5e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  30 
 
 		 455 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  32.49 
 
 		 452 aa  131  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  29.1 
 
 		 465 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  29.1 
 
 		 465 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  30.05 
 
 		 467 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  28.23 
 
 		 465 aa  127  3e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.5 
 
 		 475 aa  127  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  29.13 
 
 		 456 aa  127  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  27.49 
 
 		 462 aa  125  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  28.24 
 
 		 479 aa  124  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  27.97 
 
 		 465 aa  123  7e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  29.63 
 
 		 453 aa  121  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2325  peptidase dimerisation domain protein  26.88 
 
 		 514 aa  121  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1868  peptidase M20  26.71 
 
 		 508 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00940892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  36.49 
 
 		 453 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  29.02 
 
 		 460 aa  117  5e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  28.87 
 
 		 456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  29.26 
 
 		 457 aa  114  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  29.32 
 
 		 440 aa  113  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0429  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.89 
 
 		 445 aa  113  7.000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4034  peptidase dimerisation domain protein  25.27 
 
 		 544 aa  113  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.957672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3920  peptidase dimerisation domain protein  25.27 
 
 		 497 aa  113  9e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.49046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  27.38 
 
 		 512 aa  112  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  27.41 
 
 		 459 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0692  peptidase M20  25.78 
 
 		 450 aa  111  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  26.64 
 
 		 458 aa  111  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  27.54 
 
 		 453 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  29.04 
 
 		 463 aa  111  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  27.54 
 
 		 453 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  27.54 
 
 		 453 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2605  peptidase dimerization domain protein  25.77 
 
 		 514 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3993  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  27.07 
 
 		 458 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  28.06 
 
 		 448 aa  110  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  36.98 
 
 		 406 aa  109  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  29.35 
 
 		 456 aa  106  9e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  27.63 
 
 		 457 aa  106  9e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2145  peptidase M20  27.62 
 
 		 470 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0790004  normal  0.0404303 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  27.36 
 
 		 453 aa  105  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  28.07 
 
 		 460 aa  105  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  27.47 
 
 		 467 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  27.96 
 
 		 460 aa  104  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  28.65 
 
 		 452 aa  104  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  27.72 
 
 		 468 aa  103  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  28.54 
 
 		 459 aa  103  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  27.72 
 
 		 481 aa  103  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  27.91 
 
 		 468 aa  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  29.14 
 
 		 469 aa  103  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  26.95 
 
 		 484 aa  103  9e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  26.83 
 
 		 453 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  26.65 
 
 		 472 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  29.46 
 
 		 462 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  28.92 
 
 		 471 aa  102  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14090  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  28.53 
 
 		 469 aa  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.16 
 
 		 463 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  28.92 
 
 		 471 aa  102  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  29.61 
 
 		 485 aa  101  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>