More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4378 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3656  hypothetical protein  78.86 
 
 		 490 aa  740    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.989996  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2971  hypothetical protein  76.12 
 
 		 478 aa  698    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.65839  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4378  hypothetical protein  100 
 
 		 473 aa  946    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1506  hypothetical protein  65.31 
 
 		 473 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1486  hypothetical protein  65.31 
 
 		 473 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.664586  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1590  hypothetical protein  64.88 
 
 		 473 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242767  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1567  hypothetical protein  64.67 
 
 		 473 aa  601  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1110  hypothetical protein  64.67 
 
 		 473 aa  599  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4728  hypothetical protein  63.81 
 
 		 473 aa  595  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1647  hypothetical protein  64.58 
 
 		 477 aa  593  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2262  hypothetical protein  61.15 
 
 		 475 aa  588  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1764  hypothetical protein  64.79 
 
 		 467 aa  586  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.278132  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2571  peptidase, M20/M25/M40 family  60.72 
 
 		 475 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1159  hypothetical protein  62.96 
 
 		 473 aa  579  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5121  hypothetical protein  61.41 
 
 		 475 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4729  hypothetical protein  60.08 
 
 		 476 aa  574  1.0000000000000001e-162  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3819  hypothetical protein  59.07 
 
 		 471 aa  558  1e-158  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2519  hypothetical protein  61.28 
 
 		 472 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1265  hypothetical protein  61.28 
 
 		 472 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662381  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1341  hypothetical protein  61.51 
 
 		 472 aa  554  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3119  hypothetical protein  58.17 
 
 		 475 aa  538  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1721  hypothetical protein  58.35 
 
 		 468 aa  529  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1675  hypothetical protein  59.74 
 
 		 473 aa  526  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2929  hypothetical protein  55.84 
 
 		 475 aa  523  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2217  hypothetical protein  56.66 
 
 		 472 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1646  hypothetical protein  55.22 
 
 		 460 aa  508  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2529  hypothetical protein  56.36 
 
 		 468 aa  506  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3123  hypothetical protein  57.39 
 
 		 475 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3502  hypothetical protein  53.62 
 
 		 472 aa  487  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.67786  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3625  hypothetical protein  54.47 
 
 		 472 aa  478  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3597  hypothetical protein  51.72 
 
 		 463 aa  456  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5704  hypothetical protein  51.74 
 
 		 459 aa  453  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0680852  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3415  hypothetical protein  50.87 
 
 		 476 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4152  hypothetical protein  47.3 
 
 		 467 aa  426  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2332  hypothetical protein  47.93 
 
 		 471 aa  374  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0625849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  32.44 
 
 		 455 aa  159  9e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.16 
 
 		 456 aa  147  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  32.82 
 
 		 496 aa  147  6e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  30.39 
 
 		 456 aa  146  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  29.1 
 
 		 451 aa  144  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  30.53 
 
 		 455 aa  144  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  30.4 
 
 		 462 aa  144  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  29.2 
 
 		 451 aa  143  5e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  26.67 
 
 		 452 aa  141  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  28.66 
 
 		 469 aa  141  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.05 
 
 		 475 aa  139  8.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  30.9 
 
 		 465 aa  136  8e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  27.49 
 
 		 456 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  31.08 
 
 		 453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  32.35 
 
 		 440 aa  134  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  28.7 
 
 		 465 aa  134  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  28.97 
 
 		 460 aa  133  5e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  30.15 
 
 		 461 aa  129  8.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  33.14 
 
 		 452 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  29.82 
 
 		 459 aa  127  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  29.49 
 
 		 456 aa  126  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  29.5 
 
 		 463 aa  124  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  29.44 
 
 		 453 aa  124  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2325  peptidase dimerisation domain protein  26.09 
 
 		 514 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  27.59 
 
 		 472 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2605  peptidase dimerization domain protein  26.09 
 
 		 514 aa  121  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3993  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  26.81 
 
 		 457 aa  121  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  28.1 
 
 		 467 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  28.07 
 
 		 459 aa  119  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1868  peptidase M20  26.35 
 
 		 508 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00940892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  28.41 
 
 		 458 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4034  peptidase dimerisation domain protein  25.9 
 
 		 544 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.957672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3920  peptidase dimerisation domain protein  25.9 
 
 		 497 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.49046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.85 
 
 		 406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  27.96 
 
 		 460 aa  117  6e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  29.21 
 
 		 485 aa  114  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  27.25 
 
 		 479 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  29.15 
 
 		 484 aa  113  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  27.33 
 
 		 468 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  26.98 
 
 		 445 aa  112  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  28.85 
 
 		 448 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  27.37 
 
 		 474 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1258  peptidase dimerisation domain-containing protein  26.4 
 
 		 513 aa  111  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  28.05 
 
 		 470 aa  111  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0429  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.56 
 
 		 445 aa  110  5e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  30.38 
 
 		 437 aa  110  7.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  29.03 
 
 		 462 aa  110  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  27.82 
 
 		 463 aa  110  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  28.22 
 
 		 453 aa  109  9.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  27.63 
 
 		 465 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  27.63 
 
 		 465 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  27.63 
 
 		 465 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  25.47 
 
 		 459 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  29.16 
 
 		 457 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  30.19 
 
 		 453 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  27.59 
 
 		 458 aa  108  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  30.19 
 
 		 453 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  30.19 
 
 		 453 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  29.4 
 
 		 470 aa  107  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  28.61 
 
 		 469 aa  106  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  28.72 
 
 		 481 aa  106  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  27.82 
 
 		 488 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  25.91 
 
 		 465 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  29.27 
 
 		 468 aa  105  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  28.16 
 
 		 457 aa  104  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>