277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5121 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5121  hypothetical protein  100 
 
 
475 aa  976    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1506  hypothetical protein  65.58 
 
 
473 aa  632  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1486  hypothetical protein  65.15 
 
 
473 aa  630  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.664586  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4728  hypothetical protein  64.5 
 
 
473 aa  625  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515691  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1110  hypothetical protein  64.29 
 
 
473 aa  621  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1590  hypothetical protein  64.5 
 
 
473 aa  624  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242767  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1567  hypothetical protein  64.5 
 
 
473 aa  624  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1764  hypothetical protein  66.89 
 
 
467 aa  620  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.278132  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1647  hypothetical protein  64.91 
 
 
477 aa  614  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1159  hypothetical protein  63.42 
 
 
473 aa  600  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4729  hypothetical protein  60.73 
 
 
476 aa  597  1e-169  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3656  hypothetical protein  62.61 
 
 
490 aa  590  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.989996  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2571  peptidase, M20/M25/M40 family  58.9 
 
 
475 aa  578  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3819  hypothetical protein  60.93 
 
 
471 aa  580  1e-164  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4378  hypothetical protein  61.41 
 
 
473 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2262  hypothetical protein  58.35 
 
 
475 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2519  hypothetical protein  59.27 
 
 
472 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1265  hypothetical protein  59.27 
 
 
472 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662381  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1341  hypothetical protein  59.57 
 
 
472 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1675  hypothetical protein  58.95 
 
 
473 aa  558  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2971  hypothetical protein  61.03 
 
 
478 aa  559  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.65839  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1721  hypothetical protein  57.48 
 
 
468 aa  555  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3123  hypothetical protein  59.52 
 
 
475 aa  557  1e-157  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3502  hypothetical protein  57.2 
 
 
472 aa  549  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.67786  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2529  hypothetical protein  56.84 
 
 
468 aa  531  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3119  hypothetical protein  56.22 
 
 
475 aa  530  1e-149  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3625  hypothetical protein  56.96 
 
 
472 aa  529  1e-149  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2217  hypothetical protein  56.01 
 
 
472 aa  525  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2929  hypothetical protein  53.02 
 
 
475 aa  506  9.999999999999999e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1646  hypothetical protein  51.54 
 
 
460 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3597  hypothetical protein  51.95 
 
 
463 aa  473  1e-132  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3415  hypothetical protein  50.77 
 
 
476 aa  466  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5704  hypothetical protein  49.89 
 
 
459 aa  451  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0680852  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4152  hypothetical protein  47.14 
 
 
467 aa  430  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2332  hypothetical protein  44.8 
 
 
471 aa  350  4e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0625849  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  28.64 
 
 
451 aa  154  4e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  30.82 
 
 
455 aa  152  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  27.27 
 
 
452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  31.43 
 
 
496 aa  143  9e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  30.61 
 
 
456 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  32.45 
 
 
453 aa  140  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.82 
 
 
456 aa  140  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  29.32 
 
 
451 aa  139  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  28.97 
 
 
460 aa  136  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.68 
 
 
475 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  32.45 
 
 
453 aa  133  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  30.05 
 
 
456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  30 
 
 
456 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  30.3 
 
 
440 aa  130  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  32.33 
 
 
452 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  30.24 
 
 
459 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  29.52 
 
 
462 aa  125  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.02 
 
 
406 aa  124  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  28.39 
 
 
455 aa  123  7e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  28.81 
 
 
463 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  27.06 
 
 
465 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  28 
 
 
465 aa  120  7.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  28.12 
 
 
465 aa  120  7.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  26.68 
 
 
465 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  26.68 
 
 
465 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  28.68 
 
 
460 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  27.68 
 
 
469 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2325  peptidase dimerisation domain protein  25 
 
 
514 aa  118  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  28.72 
 
 
445 aa  117  5e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  26.53 
 
 
458 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  26.89 
 
 
467 aa  116  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  27.82 
 
 
459 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2605  peptidase dimerization domain protein  25.69 
 
 
514 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3993  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  28.92 
 
 
457 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  27.31 
 
 
453 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  30.05 
 
 
485 aa  114  5e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  29.74 
 
 
437 aa  113  6e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14090  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  29.44 
 
 
469 aa  113  7.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1868  peptidase M20  24.95 
 
 
508 aa  113  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00940892  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  29.53 
 
 
452 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  28.79 
 
 
453 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  28.79 
 
 
453 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  28.79 
 
 
453 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3920  peptidase dimerisation domain protein  26.36 
 
 
497 aa  111  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.49046  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4034  peptidase dimerisation domain protein  26.36 
 
 
544 aa  111  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.957672  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  28.02 
 
 
470 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  30.41 
 
 
460 aa  110  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4319  hypothetical protein  27.6 
 
 
445 aa  109  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.899733  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12240  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  30.82 
 
 
488 aa  107  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1640  hypothetical protein  24.53 
 
 
458 aa  107  4e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  25.47 
 
 
472 aa  107  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  28 
 
 
469 aa  106  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2021  peptidase M20  31.39 
 
 
469 aa  106  9e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.89722  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0429  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.06 
 
 
445 aa  105  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2219  peptidase M20  29.66 
 
 
476 aa  105  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342655  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  27.03 
 
 
448 aa  104  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2089  peptidase M20  31.16 
 
 
464 aa  105  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1258  peptidase dimerisation domain-containing protein  24.04 
 
 
513 aa  104  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  28.96 
 
 
471 aa  101  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  28.96 
 
 
471 aa  101  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  27.96 
 
 
462 aa  102  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  33.16 
 
 
484 aa  101  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  27.63 
 
 
463 aa  100  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  27.02 
 
 
479 aa  100  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  27.5 
 
 
471 aa  100  7e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>