285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1486 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1506  hypothetical protein  98.73 
 
 		 473 aa  927    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1764  hypothetical protein  78.04 
 
 		 467 aa  733    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.278132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1647  hypothetical protein  91.79 
 
 		 477 aa  847    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1567  hypothetical protein  94.17 
 
 		 473 aa  870    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4728  hypothetical protein  93.52 
 
 		 473 aa  870    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1159  hypothetical protein  69.01 
 
 		 473 aa  654    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1110  hypothetical protein  93.52 
 
 		 473 aa  864    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1486  hypothetical protein  100 
 
 		 473 aa  937    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.664586  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1590  hypothetical protein  93.74 
 
 		 473 aa  867    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242767  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5121  hypothetical protein  65.15 
 
 		 475 aa  632  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3656  hypothetical protein  67.82 
 
 		 490 aa  629  1e-179  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.989996  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1265  hypothetical protein  67.04 
 
 		 472 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662381  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2519  hypothetical protein  67.04 
 
 		 472 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1341  hypothetical protein  67.04 
 
 		 472 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2971  hypothetical protein  67.8 
 
 		 478 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.65839  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4378  hypothetical protein  65.31 
 
 		 473 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4729  hypothetical protein  62.39 
 
 		 476 aa  600  1e-170  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3819  hypothetical protein  62.18 
 
 		 471 aa  593  1e-168  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2262  hypothetical protein  62.5 
 
 		 475 aa  588  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1675  hypothetical protein  65.13 
 
 		 473 aa  589  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2571  peptidase, M20/M25/M40 family  62.28 
 
 		 475 aa  587  1e-166  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1721  hypothetical protein  61.46 
 
 		 468 aa  578  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3123  hypothetical protein  63.54 
 
 		 475 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3119  hypothetical protein  60.09 
 
 		 475 aa  556  1e-157  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2929  hypothetical protein  59.87 
 
 		 475 aa  556  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3502  hypothetical protein  60.69 
 
 		 472 aa  557  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.67786  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2217  hypothetical protein  58.99 
 
 		 472 aa  548  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2529  hypothetical protein  58.55 
 
 		 468 aa  540  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3625  hypothetical protein  60.26 
 
 		 472 aa  531  1e-149  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1646  hypothetical protein  54.45 
 
 		 460 aa  505  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4152  hypothetical protein  51.31 
 
 		 467 aa  477  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3597  hypothetical protein  53.12 
 
 		 463 aa  466  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3415  hypothetical protein  51.96 
 
 		 476 aa  452  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5704  hypothetical protein  49.14 
 
 		 459 aa  442  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0680852  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2332  hypothetical protein  51.5 
 
 		 471 aa  394  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0625849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  34.11 
 
 		 496 aa  161  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  31.35 
 
 		 455 aa  152  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  31.25 
 
 		 462 aa  152  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  30.42 
 
 		 456 aa  149  9e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  32.9 
 
 		 469 aa  145  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  28.21 
 
 		 456 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  28.1 
 
 		 451 aa  142  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  30.46 
 
 		 451 aa  140  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  30 
 
 		 455 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  26.01 
 
 		 452 aa  136  7.000000000000001e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  27.71 
 
 		 456 aa  135  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.66 
 
 		 475 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.53 
 
 		 456 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  28.46 
 
 		 453 aa  134  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  27.25 
 
 		 465 aa  130  5.0000000000000004e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2325  peptidase dimerisation domain protein  26.98 
 
 		 514 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  31.98 
 
 		 468 aa  127  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  29.98 
 
 		 452 aa  127  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  30.91 
 
 		 465 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  30.91 
 
 		 465 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  30.91 
 
 		 465 aa  126  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4034  peptidase dimerisation domain protein  28.74 
 
 		 544 aa  126  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.957672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  27.32 
 
 		 465 aa  126  9e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3920  peptidase dimerisation domain protein  28.74 
 
 		 497 aa  126  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.49046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  29.19 
 
 		 485 aa  125  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2605  peptidase dimerization domain protein  27.46 
 
 		 514 aa  125  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3993  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  32.54 
 
 		 445 aa  124  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.12 
 
 		 406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  27.23 
 
 		 460 aa  121  3e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  29.55 
 
 		 458 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  29.13 
 
 		 459 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  28.17 
 
 		 472 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  29.17 
 
 		 467 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  29.7 
 
 		 440 aa  120  7.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  31.36 
 
 		 448 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  30.63 
 
 		 467 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  28.77 
 
 		 468 aa  119  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0429  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.33 
 
 		 445 aa  116  7.999999999999999e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  27.99 
 
 		 463 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  27.68 
 
 		 453 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  31.99 
 
 		 452 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  32.32 
 
 		 470 aa  113  6e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  29.72 
 
 		 461 aa  113  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  28.95 
 
 		 457 aa  113  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  27.21 
 
 		 463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  31.35 
 
 		 464 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1840  peptidase M20  31.5 
 
 		 448 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  29.44 
 
 		 456 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  29.41 
 
 		 479 aa  111  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  27.51 
 
 		 459 aa  111  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  28.57 
 
 		 481 aa  111  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2697  peptidase M20  31.46 
 
 		 451 aa  111  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.922328 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  31.31 
 
 		 453 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  31.31 
 
 		 453 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  31.31 
 
 		 453 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  27.54 
 
 		 437 aa  108  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  27.92 
 
 		 453 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  32.17 
 
 		 460 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1520  peptidase M20  26.84 
 
 		 488 aa  108  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.305754 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  29.17 
 
 		 462 aa  107  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1868  peptidase M20  26.97 
 
 		 508 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00940892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  26.45 
 
 		 460 aa  107  4e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2089  peptidase M20  32.55 
 
 		 464 aa  107  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  28.54 
 
 		 462 aa  107  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12240  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  31.86 
 
 		 488 aa  107  7e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>