267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1520 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1520  peptidase M20  100 
 
 
488 aa  1006    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.305754 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1868  peptidase M20  44.81 
 
 
508 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00940892  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4034  peptidase dimerisation domain protein  34.06 
 
 
544 aa  289  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.957672  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3920  peptidase dimerisation domain protein  34.28 
 
 
497 aa  285  9e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.49046  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1258  peptidase dimerisation domain-containing protein  36.73 
 
 
513 aa  281  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2605  peptidase dimerization domain protein  35.05 
 
 
514 aa  267  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3993  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2325  peptidase dimerisation domain protein  33.91 
 
 
514 aa  261  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  34.49 
 
 
455 aa  222  9.999999999999999e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  33.48 
 
 
459 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  31.04 
 
 
452 aa  219  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  33.77 
 
 
453 aa  218  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  32.38 
 
 
496 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  32.47 
 
 
453 aa  207  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  31.74 
 
 
451 aa  207  5e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  29.59 
 
 
458 aa  206  6e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  31.33 
 
 
456 aa  206  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  31.03 
 
 
453 aa  201  3e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1728  peptidase dimerisation domain protein  29.61 
 
 
530 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189678  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  31.38 
 
 
456 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  29.59 
 
 
463 aa  197  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  30.89 
 
 
456 aa  197  5.000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  31.09 
 
 
469 aa  197  5.000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  30.87 
 
 
460 aa  194  3e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1760  peptidase dimerisation domain protein  29.18 
 
 
520 aa  194  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  31.41 
 
 
457 aa  192  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  31.64 
 
 
440 aa  191  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.53 
 
 
456 aa  192  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.03 
 
 
463 aa  189  8e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  30.65 
 
 
465 aa  189  9e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.02 
 
 
475 aa  189  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  30.33 
 
 
471 aa  188  2e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  30.97 
 
 
464 aa  187  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  31.7 
 
 
459 aa  186  8e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  31.67 
 
 
461 aa  185  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  31.17 
 
 
462 aa  183  6e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  33.26 
 
 
462 aa  183  7e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  29.98 
 
 
458 aa  182  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1840  peptidase M20  29.61 
 
 
448 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  31.64 
 
 
457 aa  182  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  29.74 
 
 
448 aa  179  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1931  hypothetical protein  29.95 
 
 
458 aa  179  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  30.82 
 
 
468 aa  179  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  26.91 
 
 
458 aa  177  3e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  31.53 
 
 
469 aa  177  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  31.29 
 
 
465 aa  177  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  31.06 
 
 
467 aa  176  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  30.91 
 
 
451 aa  176  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  29.42 
 
 
479 aa  176  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  30.7 
 
 
470 aa  174  5e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  31.91 
 
 
464 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  30.43 
 
 
470 aa  173  6.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  31.37 
 
 
465 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  29.8 
 
 
462 aa  172  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  30.75 
 
 
460 aa  171  2e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  30.7 
 
 
457 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  31.37 
 
 
465 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  31.37 
 
 
465 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  28.95 
 
 
455 aa  171  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  30.52 
 
 
468 aa  171  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  30.63 
 
 
461 aa  170  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  29.34 
 
 
485 aa  170  4e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  28.95 
 
 
484 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1484  hypothetical protein  31.35 
 
 
418 aa  169  1e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.555419  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  30.84 
 
 
471 aa  168  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  30.84 
 
 
471 aa  168  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  29.93 
 
 
463 aa  167  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0692  peptidase M20  30.55 
 
 
450 aa  167  4e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  30.74 
 
 
452 aa  167  5.9999999999999996e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  35.98 
 
 
467 aa  166  9e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  30.22 
 
 
488 aa  166  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  29.39 
 
 
468 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  30.02 
 
 
474 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  27.87 
 
 
472 aa  163  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2697  peptidase M20  29.87 
 
 
451 aa  162  9e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.922328 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  28.57 
 
 
468 aa  162  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  30.85 
 
 
465 aa  162  1e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  29.27 
 
 
437 aa  160  5e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3528  hypothetical protein  31.05 
 
 
468 aa  159  8e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  29.19 
 
 
460 aa  159  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  29.88 
 
 
468 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  29.04 
 
 
461 aa  158  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  30.36 
 
 
468 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  28.82 
 
 
462 aa  157  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0859  hypothetical protein  28.54 
 
 
463 aa  156  7e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  29.31 
 
 
459 aa  155  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  28.6 
 
 
468 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  29.49 
 
 
462 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3030  hypothetical protein  29.68 
 
 
467 aa  154  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  28.32 
 
 
461 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  30.32 
 
 
460 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  29.16 
 
 
456 aa  150  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1937  hypothetical protein  28.99 
 
 
468 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.293644  normal  0.311555 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03459  glutamate carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05450)  29.02 
 
 
535 aa  150  5e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00014033 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  28.79 
 
 
460 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  29 
 
 
481 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  27.43 
 
 
461 aa  145  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  27.43 
 
 
461 aa  145  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2145  peptidase M20  26.77 
 
 
470 aa  142  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0790004  normal  0.0404303 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01640  glutamate carboxypeptidase protein, putative  25.89 
 
 
476 aa  140  4.999999999999999e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.182836  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  28.45 
 
 
484 aa  139  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>