More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2605 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2605  peptidase dimerization domain protein  100 
 
 
514 aa  1053    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3993  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2325  peptidase dimerisation domain protein  93.96 
 
 
514 aa  995    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1728  peptidase dimerisation domain protein  54.94 
 
 
530 aa  589  1e-167  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189678  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1760  peptidase dimerisation domain protein  54 
 
 
520 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3920  peptidase dimerisation domain protein  50.82 
 
 
497 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.49046  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4034  peptidase dimerisation domain protein  50.82 
 
 
544 aa  510  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.957672  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1258  peptidase dimerisation domain-containing protein  50.52 
 
 
513 aa  471  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1868  peptidase M20  35.74 
 
 
508 aa  260  4e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00940892  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1520  peptidase M20  35.05 
 
 
488 aa  252  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.305754 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  30.51 
 
 
455 aa  187  5e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  30.57 
 
 
460 aa  184  4.0000000000000006e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  29.23 
 
 
440 aa  183  5.0000000000000004e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  33.5 
 
 
496 aa  183  7e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  29.55 
 
 
458 aa  182  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  26.5 
 
 
456 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  31.11 
 
 
453 aa  179  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  27.89 
 
 
452 aa  176  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  29.13 
 
 
453 aa  176  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  27.85 
 
 
471 aa  176  9e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  29.28 
 
 
462 aa  176  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  29.73 
 
 
459 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  32.35 
 
 
463 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  28.05 
 
 
467 aa  174  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  27.07 
 
 
453 aa  173  5.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  28.75 
 
 
468 aa  173  6.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  28.39 
 
 
452 aa  171  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.54 
 
 
463 aa  169  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  27.82 
 
 
456 aa  166  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.14 
 
 
475 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  26.95 
 
 
463 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  27.65 
 
 
462 aa  163  7e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  27.33 
 
 
461 aa  162  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  26.23 
 
 
461 aa  160  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  28.22 
 
 
474 aa  160  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  28.09 
 
 
457 aa  160  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  27.25 
 
 
456 aa  159  9e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  27.27 
 
 
451 aa  159  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  26.54 
 
 
469 aa  159  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  29.55 
 
 
485 aa  157  6e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  28.1 
 
 
460 aa  156  9e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2697  peptidase M20  29.3 
 
 
451 aa  155  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.922328 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  28.07 
 
 
448 aa  154  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  31.94 
 
 
481 aa  153  8.999999999999999e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  28.93 
 
 
457 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  26.11 
 
 
461 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  29.32 
 
 
455 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  26.54 
 
 
479 aa  150  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  28.05 
 
 
458 aa  150  6e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  28.03 
 
 
460 aa  150  7e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  27.25 
 
 
451 aa  149  1.0000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  28.85 
 
 
456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  29.92 
 
 
472 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0859  hypothetical protein  27.04 
 
 
463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  27.22 
 
 
458 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  27.52 
 
 
460 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  27.48 
 
 
456 aa  147  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  27.33 
 
 
461 aa  147  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  26.51 
 
 
462 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  27.03 
 
 
468 aa  147  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  26.2 
 
 
462 aa  147  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0692  peptidase M20  26.15 
 
 
450 aa  147  5e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  26.64 
 
 
462 aa  147  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  31.27 
 
 
464 aa  147  6e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  25.61 
 
 
484 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  25.81 
 
 
437 aa  144  3e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  27.27 
 
 
470 aa  145  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  26.51 
 
 
465 aa  144  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  26.92 
 
 
461 aa  144  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  25.37 
 
 
471 aa  144  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  25.37 
 
 
471 aa  144  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  26.79 
 
 
465 aa  143  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1840  peptidase M20  28.12 
 
 
448 aa  143  8e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  26.95 
 
 
470 aa  142  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  27.35 
 
 
461 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1484  hypothetical protein  26.76 
 
 
418 aa  141  3e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.555419  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  27.05 
 
 
457 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  28.65 
 
 
460 aa  140  4.999999999999999e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  25.32 
 
 
469 aa  140  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  29.74 
 
 
464 aa  138  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  28.93 
 
 
465 aa  139  2e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  26.13 
 
 
465 aa  136  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  25.3 
 
 
468 aa  137  7.000000000000001e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  26.3 
 
 
468 aa  136  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  24.89 
 
 
459 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  26.63 
 
 
467 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  26.13 
 
 
465 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  26.13 
 
 
465 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  28.84 
 
 
468 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  26.39 
 
 
459 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  27.91 
 
 
488 aa  130  6e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  28.38 
 
 
468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03459  glutamate carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05450)  26.45 
 
 
535 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00014033 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1931  hypothetical protein  24.95 
 
 
458 aa  127  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3030  hypothetical protein  26.37 
 
 
467 aa  127  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1646  hypothetical protein  27.4 
 
 
460 aa  127  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2519  hypothetical protein  26.04 
 
 
472 aa  127  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1265  hypothetical protein  26.04 
 
 
472 aa  127  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662381  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3656  hypothetical protein  26.34 
 
 
490 aa  126  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.989996  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1341  hypothetical protein  26.04 
 
 
472 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1506  hypothetical protein  27.58 
 
 
473 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>