293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3656 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3656  hypothetical protein  100 
 
 		 490 aa  971    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.989996  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2971  hypothetical protein  86.86 
 
 		 478 aa  800    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.65839  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4378  hypothetical protein  78.86 
 
 		 473 aa  740    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1506  hypothetical protein  68.03 
 
 		 473 aa  627  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1486  hypothetical protein  67.82 
 
 		 473 aa  627  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.664586  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2262  hypothetical protein  62.34 
 
 		 475 aa  611  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1567  hypothetical protein  66.09 
 
 		 473 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1590  hypothetical protein  65.87 
 
 		 473 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242767  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1764  hypothetical protein  66.38 
 
 		 467 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.278132  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2571  peptidase, M20/M25/M40 family  62.34 
 
 		 475 aa  608  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1647  hypothetical protein  65.94 
 
 		 477 aa  609  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1110  hypothetical protein  65.66 
 
 		 473 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4728  hypothetical protein  64.36 
 
 		 473 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1265  hypothetical protein  63 
 
 		 472 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662381  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2519  hypothetical protein  63 
 
 		 472 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1341  hypothetical protein  63.19 
 
 		 472 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4729  hypothetical protein  61.67 
 
 		 476 aa  592  1e-168  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5121  hypothetical protein  62.61 
 
 		 475 aa  590  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1159  hypothetical protein  63.02 
 
 		 473 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3819  hypothetical protein  60.38 
 
 		 471 aa  576  1.0000000000000001e-163  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1675  hypothetical protein  61.47 
 
 		 473 aa  555  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3123  hypothetical protein  60.13 
 
 		 475 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1721  hypothetical protein  58.48 
 
 		 468 aa  535  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2529  hypothetical protein  58 
 
 		 468 aa  535  1e-151  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3119  hypothetical protein  57.91 
 
 		 475 aa  533  1e-150  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2217  hypothetical protein  58 
 
 		 472 aa  534  1e-150  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1646  hypothetical protein  57.21 
 
 		 460 aa  528  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3502  hypothetical protein  56.93 
 
 		 472 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.67786  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2929  hypothetical protein  54.51 
 
 		 475 aa  508  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3625  hypothetical protein  56.72 
 
 		 472 aa  496  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3597  hypothetical protein  53.9 
 
 		 463 aa  482  1e-135  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5704  hypothetical protein  50.76 
 
 		 459 aa  462  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0680852  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3415  hypothetical protein  50.33 
 
 		 476 aa  449  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4152  hypothetical protein  47.83 
 
 		 467 aa  431  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2332  hypothetical protein  52.3 
 
 		 471 aa  406  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0625849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  30.52 
 
 		 455 aa  142  9e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  31.01 
 
 		 496 aa  142  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  29.03 
 
 		 462 aa  137  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  26.4 
 
 		 452 aa  137  5e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  30.02 
 
 		 451 aa  136  7.000000000000001e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  30.71 
 
 		 456 aa  136  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  28.28 
 
 		 451 aa  132  2.0000000000000002e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.39 
 
 		 456 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  30.54 
 
 		 455 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  28.31 
 
 		 456 aa  127  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2605  peptidase dimerization domain protein  26.34 
 
 		 514 aa  126  9e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3993  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2325  peptidase dimerisation domain protein  26.73 
 
 		 514 aa  126  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  29.65 
 
 		 456 aa  126  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.77 
 
 		 475 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  29.26 
 
 		 469 aa  124  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4034  peptidase dimerisation domain protein  26.59 
 
 		 544 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.957672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3920  peptidase dimerisation domain protein  26.36 
 
 		 497 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.49046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  30.19 
 
 		 453 aa  120  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  27.78 
 
 		 465 aa  119  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  30.13 
 
 		 479 aa  119  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1868  peptidase M20  24.76 
 
 		 508 aa  119  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00940892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  28.07 
 
 		 465 aa  117  3.9999999999999997e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  29.11 
 
 		 467 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  28.41 
 
 		 468 aa  116  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  30.77 
 
 		 468 aa  116  8.999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  31.28 
 
 		 452 aa  116  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  29.9 
 
 		 440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  27.84 
 
 		 458 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  28.01 
 
 		 460 aa  116  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1258  peptidase dimerisation domain-containing protein  26.57 
 
 		 513 aa  114  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  27.27 
 
 		 461 aa  113  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0692  peptidase M20  25.22 
 
 		 450 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  26.9 
 
 		 472 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  27.62 
 
 		 457 aa  110  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  27.61 
 
 		 474 aa  110  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  29.02 
 
 		 459 aa  110  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  29.02 
 
 		 453 aa  110  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  29.02 
 
 		 453 aa  110  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  29.02 
 
 		 453 aa  110  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.64 
 
 		 406 aa  109  9.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  29.24 
 
 		 453 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  29.05 
 
 		 467 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  30.03 
 
 		 470 aa  108  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  27.5 
 
 		 463 aa  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  27.03 
 
 		 460 aa  106  8e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  29.76 
 
 		 460 aa  106  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  28.78 
 
 		 437 aa  105  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  31.27 
 
 		 452 aa  105  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  28.01 
 
 		 485 aa  105  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  27.51 
 
 		 463 aa  105  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  28.54 
 
 		 448 aa  104  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  27.51 
 
 		 458 aa  104  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  31.15 
 
 		 461 aa  103  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  27.96 
 
 		 470 aa  103  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  29.96 
 
 		 453 aa  103  9e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  27.9 
 
 		 465 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0429  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.52 
 
 		 445 aa  103  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  27.68 
 
 		 465 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  27.68 
 
 		 465 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  28.95 
 
 		 459 aa  102  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  25.74 
 
 		 458 aa  102  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12240  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  31.16 
 
 		 488 aa  101  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0824  hypothetical protein  26.48 
 
 		 455 aa  101  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  29.45 
 
 		 457 aa  100  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  28.28 
 
 		 484 aa  100  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>