277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1764 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1764  hypothetical protein  100 
 
 
467 aa  942    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.278132  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1506  hypothetical protein  78.43 
 
 
473 aa  744    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1159  hypothetical protein  69.26 
 
 
473 aa  656    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1567  hypothetical protein  78.65 
 
 
473 aa  745    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4728  hypothetical protein  79.3 
 
 
473 aa  752    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515691  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1647  hypothetical protein  78 
 
 
477 aa  738    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1110  hypothetical protein  78.43 
 
 
473 aa  743    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1486  hypothetical protein  78.87 
 
 
473 aa  746    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.664586  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1590  hypothetical protein  78.65 
 
 
473 aa  745    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242767  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5121  hypothetical protein  66.89 
 
 
475 aa  633  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3656  hypothetical protein  66.38 
 
 
490 aa  627  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.989996  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2519  hypothetical protein  67.04 
 
 
472 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1341  hypothetical protein  67.04 
 
 
472 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1265  hypothetical protein  67.04 
 
 
472 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662381  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2262  hypothetical protein  63.99 
 
 
475 aa  609  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2571  peptidase, M20/M25/M40 family  63.56 
 
 
475 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4378  hypothetical protein  64.79 
 
 
473 aa  600  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3819  hypothetical protein  62.47 
 
 
471 aa  593  1e-168  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2971  hypothetical protein  64.18 
 
 
478 aa  590  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.65839  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4729  hypothetical protein  59.62 
 
 
476 aa  585  1e-166  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1675  hypothetical protein  61.62 
 
 
473 aa  575  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1721  hypothetical protein  60.75 
 
 
468 aa  572  1.0000000000000001e-162  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3123  hypothetical protein  60.04 
 
 
475 aa  567  1e-160  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2929  hypothetical protein  59.52 
 
 
475 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3119  hypothetical protein  58.64 
 
 
475 aa  556  1e-157  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3502  hypothetical protein  58.28 
 
 
472 aa  551  1e-156  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.67786  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2217  hypothetical protein  57.99 
 
 
472 aa  545  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2529  hypothetical protein  58.21 
 
 
468 aa  543  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1646  hypothetical protein  56.8 
 
 
460 aa  529  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3625  hypothetical protein  58.64 
 
 
472 aa  525  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4152  hypothetical protein  52.4 
 
 
467 aa  484  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3597  hypothetical protein  54.66 
 
 
463 aa  476  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3415  hypothetical protein  52.06 
 
 
476 aa  463  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5704  hypothetical protein  50.21 
 
 
459 aa  442  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0680852  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2332  hypothetical protein  49.42 
 
 
471 aa  376  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0625849  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  30.99 
 
 
455 aa  155  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  32.74 
 
 
496 aa  150  5e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  30.98 
 
 
462 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  30 
 
 
451 aa  145  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  30.32 
 
 
456 aa  144  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  30.13 
 
 
456 aa  143  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  28.32 
 
 
465 aa  142  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  30.55 
 
 
469 aa  137  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  26.77 
 
 
452 aa  137  5e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  28.02 
 
 
451 aa  135  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  31.07 
 
 
452 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  27.32 
 
 
465 aa  130  6e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.84 
 
 
456 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  30.83 
 
 
479 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.31 
 
 
475 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  29.04 
 
 
453 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0429  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.3 
 
 
445 aa  127  5e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  30.47 
 
 
458 aa  127  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3920  peptidase dimerisation domain protein  28.84 
 
 
497 aa  126  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.49046  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4034  peptidase dimerisation domain protein  28.84 
 
 
544 aa  126  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.957672  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  28.3 
 
 
456 aa  126  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  30.53 
 
 
467 aa  123  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2325  peptidase dimerisation domain protein  25.91 
 
 
514 aa  123  9e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0692  peptidase M20  26.42 
 
 
450 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  30.22 
 
 
461 aa  122  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  28.91 
 
 
467 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.81 
 
 
406 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  28.04 
 
 
453 aa  120  7e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  31.39 
 
 
464 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  28.98 
 
 
463 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  29.22 
 
 
440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  28.72 
 
 
485 aa  118  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2605  peptidase dimerization domain protein  26.62 
 
 
514 aa  117  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3993  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  27.29 
 
 
465 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  28.97 
 
 
459 aa  117  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  27.29 
 
 
465 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  29.46 
 
 
453 aa  116  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  26.67 
 
 
460 aa  115  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1520  peptidase M20  27.95 
 
 
488 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.305754 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  26.63 
 
 
459 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  28.57 
 
 
460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  27.46 
 
 
465 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12240  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  33.45 
 
 
488 aa  112  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  29.15 
 
 
457 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  30.53 
 
 
448 aa  111  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  29.9 
 
 
453 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  29.9 
 
 
453 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  27.32 
 
 
455 aa  111  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  29.9 
 
 
453 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1868  peptidase M20  26.1 
 
 
508 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00940892  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  26.7 
 
 
472 aa  109  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  30.05 
 
 
456 aa  109  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  27.99 
 
 
462 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  26.21 
 
 
458 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  26.7 
 
 
463 aa  107  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  29.65 
 
 
448 aa  107  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  28.08 
 
 
468 aa  107  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  29 
 
 
470 aa  106  7e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  29.24 
 
 
462 aa  107  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  28.22 
 
 
437 aa  106  8e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1840  peptidase M20  28.04 
 
 
448 aa  106  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  29.6 
 
 
452 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  30 
 
 
468 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  25.69 
 
 
458 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  28.21 
 
 
481 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>