285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1159 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1567  hypothetical protein  68.79 
 
 
473 aa  646    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1647  hypothetical protein  67.47 
 
 
477 aa  634    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4728  hypothetical protein  69.23 
 
 
473 aa  649    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515691  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1506  hypothetical protein  69.01 
 
 
473 aa  653    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1159  hypothetical protein  100 
 
 
473 aa  954    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1110  hypothetical protein  68.57 
 
 
473 aa  643    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1486  hypothetical protein  69.01 
 
 
473 aa  653    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.664586  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1590  hypothetical protein  68.79 
 
 
473 aa  646    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242767  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1764  hypothetical protein  69.26 
 
 
467 aa  642    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.278132  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5121  hypothetical protein  63.42 
 
 
475 aa  600  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2519  hypothetical protein  63 
 
 
472 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1265  hypothetical protein  63 
 
 
472 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662381  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1341  hypothetical protein  63 
 
 
472 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3656  hypothetical protein  63.02 
 
 
490 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.989996  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4378  hypothetical protein  62.96 
 
 
473 aa  579  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2262  hypothetical protein  62.06 
 
 
475 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1675  hypothetical protein  61.32 
 
 
473 aa  568  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1721  hypothetical protein  60.66 
 
 
468 aa  565  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2571  peptidase, M20/M25/M40 family  61.4 
 
 
475 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2971  hypothetical protein  63.02 
 
 
478 aa  560  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.65839  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3819  hypothetical protein  59.78 
 
 
471 aa  555  1e-157  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3123  hypothetical protein  59.2 
 
 
475 aa  558  1e-157  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4729  hypothetical protein  57.08 
 
 
476 aa  555  1e-157  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2217  hypothetical protein  58.68 
 
 
472 aa  545  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3119  hypothetical protein  56.21 
 
 
475 aa  538  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2529  hypothetical protein  57.17 
 
 
468 aa  530  1e-149  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3502  hypothetical protein  59 
 
 
472 aa  529  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.67786  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1646  hypothetical protein  57.58 
 
 
460 aa  521  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2929  hypothetical protein  55.67 
 
 
475 aa  524  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3625  hypothetical protein  58.24 
 
 
472 aa  513  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3415  hypothetical protein  52.25 
 
 
476 aa  470  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3597  hypothetical protein  52.51 
 
 
463 aa  461  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4152  hypothetical protein  49.01 
 
 
467 aa  456  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5704  hypothetical protein  48.48 
 
 
459 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0680852  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2332  hypothetical protein  48.39 
 
 
471 aa  385  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0625849  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  32.18 
 
 
496 aa  157  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  30.43 
 
 
451 aa  145  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  24.84 
 
 
452 aa  144  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  29.78 
 
 
462 aa  142  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  30.7 
 
 
455 aa  140  3.9999999999999997e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  28.48 
 
 
456 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  30.41 
 
 
469 aa  138  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3920  peptidase dimerisation domain protein  29.6 
 
 
497 aa  137  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.49046  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4034  peptidase dimerisation domain protein  29.6 
 
 
544 aa  137  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.957672  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  29.52 
 
 
456 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  27.84 
 
 
451 aa  131  2.0000000000000002e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  28.33 
 
 
465 aa  132  2.0000000000000002e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  31.55 
 
 
452 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  26.12 
 
 
465 aa  125  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  28.4 
 
 
445 aa  122  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  27.25 
 
 
456 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.05 
 
 
475 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.49 
 
 
456 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  27.78 
 
 
460 aa  121  3e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  29.14 
 
 
463 aa  120  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2325  peptidase dimerisation domain protein  26.55 
 
 
514 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  29.77 
 
 
472 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1868  peptidase M20  26.93 
 
 
508 aa  119  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00940892  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  28.92 
 
 
440 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  31.02 
 
 
452 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2605  peptidase dimerization domain protein  27.15 
 
 
514 aa  117  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3993  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  29.75 
 
 
453 aa  117  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  29.75 
 
 
453 aa  117  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  29.75 
 
 
453 aa  117  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  30.65 
 
 
460 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  28.22 
 
 
437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  30.36 
 
 
464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  27.2 
 
 
465 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  27.47 
 
 
453 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  27.07 
 
 
463 aa  114  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  29.18 
 
 
470 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1520  peptidase M20  28.6 
 
 
488 aa  113  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.305754 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  32.39 
 
 
456 aa  113  8.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  26.99 
 
 
465 aa  113  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  26.99 
 
 
465 aa  113  9e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  27.27 
 
 
485 aa  112  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  27.75 
 
 
457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  26.84 
 
 
459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  30.1 
 
 
479 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  28.74 
 
 
448 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  27.6 
 
 
467 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  29.86 
 
 
455 aa  111  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1258  peptidase dimerisation domain-containing protein  26.17 
 
 
513 aa  110  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1840  peptidase M20  28.96 
 
 
448 aa  110  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0692  peptidase M20  25.92 
 
 
450 aa  109  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  28.84 
 
 
461 aa  109  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0824  hypothetical protein  27.96 
 
 
455 aa  108  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  28.5 
 
 
474 aa  108  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  37.04 
 
 
453 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  28.87 
 
 
484 aa  107  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4319  hypothetical protein  30.37 
 
 
445 aa  106  9e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.899733  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2145  peptidase M20  29.98 
 
 
470 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0790004  normal  0.0404303 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  27.27 
 
 
458 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  28.85 
 
 
459 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  28.53 
 
 
460 aa  105  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.24 
 
 
406 aa  105  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  28.04 
 
 
459 aa  105  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  29.57 
 
 
467 aa  104  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  28.03 
 
 
448 aa  103  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12240  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  28.31 
 
 
488 aa  103  7e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>