225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1258 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1258  peptidase dimerisation domain-containing protein  100 
 
 
513 aa  1040    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4034  peptidase dimerisation domain protein  55.17 
 
 
544 aa  557  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.957672  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3920  peptidase dimerisation domain protein  54.87 
 
 
497 aa  551  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.49046  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2605  peptidase dimerization domain protein  50.1 
 
 
514 aa  489  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3993  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2325  peptidase dimerisation domain protein  49.6 
 
 
514 aa  488  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1728  peptidase dimerisation domain protein  43.04 
 
 
530 aa  402  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189678  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1760  peptidase dimerisation domain protein  42.26 
 
 
520 aa  394  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1520  peptidase M20  36.49 
 
 
488 aa  284  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.305754 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1868  peptidase M20  34.51 
 
 
508 aa  271  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00940892  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  26.6 
 
 
456 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  31.4 
 
 
496 aa  184  4.0000000000000006e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  28.09 
 
 
455 aa  184  5.0000000000000004e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  29.22 
 
 
452 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  28.48 
 
 
440 aa  176  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  29.3 
 
 
462 aa  176  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  27.29 
 
 
465 aa  174  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  27.03 
 
 
484 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  28.92 
 
 
463 aa  172  9e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  28.92 
 
 
462 aa  172  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  26.57 
 
 
470 aa  171  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  27.63 
 
 
474 aa  171  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  26.12 
 
 
459 aa  171  4e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  25.95 
 
 
453 aa  169  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  27.25 
 
 
469 aa  169  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  28.66 
 
 
479 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  27.88 
 
 
475 aa  168  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  27.69 
 
 
456 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  25.44 
 
 
471 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  24.17 
 
 
452 aa  164  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  26.54 
 
 
460 aa  163  9e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  29.01 
 
 
451 aa  162  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  27.78 
 
 
456 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  26.43 
 
 
462 aa  160  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  26.81 
 
 
459 aa  159  8e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  27.39 
 
 
468 aa  159  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  27.81 
 
 
458 aa  157  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  27.4 
 
 
458 aa  157  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  26.71 
 
 
460 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  24.84 
 
 
463 aa  156  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  27.17 
 
 
470 aa  156  9e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  25.99 
 
 
461 aa  156  9e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  26.46 
 
 
456 aa  155  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  26.19 
 
 
465 aa  156  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  25.05 
 
 
461 aa  156  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  26.73 
 
 
467 aa  155  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  26.83 
 
 
472 aa  153  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  27.62 
 
 
465 aa  153  5.9999999999999996e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  27.42 
 
 
464 aa  152  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  26.79 
 
 
457 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  25 
 
 
453 aa  152  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  27.1 
 
 
460 aa  152  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  25.42 
 
 
453 aa  152  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  27.39 
 
 
457 aa  152  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  26.83 
 
 
455 aa  152  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  26.37 
 
 
485 aa  151  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  29.58 
 
 
481 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  26.11 
 
 
457 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  26.38 
 
 
460 aa  145  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  24.15 
 
 
463 aa  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  25.91 
 
 
462 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  24.43 
 
 
437 aa  144  3e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  26.8 
 
 
488 aa  144  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2697  peptidase M20  28.88 
 
 
451 aa  144  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.922328 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  26.72 
 
 
468 aa  143  8e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  24.07 
 
 
468 aa  140  7e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  25.95 
 
 
461 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  25.16 
 
 
469 aa  139  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  24.68 
 
 
471 aa  139  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  24.68 
 
 
471 aa  139  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  25.74 
 
 
461 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  25.53 
 
 
461 aa  137  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  26.11 
 
 
448 aa  137  7.000000000000001e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  25.62 
 
 
461 aa  136  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  25.51 
 
 
512 aa  136  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  26.62 
 
 
459 aa  136  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  24.64 
 
 
462 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1840  peptidase M20  25.8 
 
 
448 aa  133  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0859  hypothetical protein  23.78 
 
 
463 aa  133  6.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  25.15 
 
 
458 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  27.9 
 
 
452 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  25.84 
 
 
451 aa  132  2.0000000000000002e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  27.65 
 
 
460 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  27.54 
 
 
470 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  27.01 
 
 
464 aa  131  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0692  peptidase M20  25.75 
 
 
450 aa  130  6e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03459  glutamate carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05450)  25.47 
 
 
535 aa  130  8.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00014033 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1931  hypothetical protein  25.62 
 
 
458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  26.13 
 
 
456 aa  127  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  27.87 
 
 
453 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  27.87 
 
 
453 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  27.87 
 
 
453 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  25.56 
 
 
467 aa  127  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1721  hypothetical protein  27.06 
 
 
468 aa  126  9e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3656  hypothetical protein  27 
 
 
490 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.989996  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78234  Glutamate carboxypeptidase-like protein  24.14 
 
 
481 aa  123  8e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2929  hypothetical protein  25.98 
 
 
475 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  26.28 
 
 
448 aa  123  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  25.28 
 
 
468 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  24.26 
 
 
468 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  23.77 
 
 
468 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>