245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1868 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1868  peptidase M20  100 
 
 
508 aa  1040    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00940892  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1520  peptidase M20  44.33 
 
 
488 aa  418  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.305754 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4034  peptidase dimerisation domain protein  39.36 
 
 
544 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.957672  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3920  peptidase dimerisation domain protein  39.36 
 
 
497 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.49046  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2325  peptidase dimerisation domain protein  35.12 
 
 
514 aa  263  8e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2605  peptidase dimerization domain protein  35.32 
 
 
514 aa  261  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3993  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1258  peptidase dimerisation domain-containing protein  34.8 
 
 
513 aa  260  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  30.71 
 
 
452 aa  220  6e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1728  peptidase dimerisation domain protein  29.69 
 
 
530 aa  205  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189678  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  31.89 
 
 
460 aa  200  5e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  31.35 
 
 
456 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  32.05 
 
 
456 aa  196  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  31.49 
 
 
455 aa  194  4e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.1 
 
 
475 aa  194  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  29.96 
 
 
456 aa  192  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1760  peptidase dimerisation domain protein  29.53 
 
 
520 aa  192  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  30.51 
 
 
496 aa  190  5e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.15 
 
 
463 aa  190  5e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  30.83 
 
 
459 aa  190  5.999999999999999e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.08 
 
 
456 aa  186  8e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  29.4 
 
 
451 aa  184  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  28.11 
 
 
452 aa  183  7e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  27.92 
 
 
458 aa  182  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  32.12 
 
 
458 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  29.47 
 
 
451 aa  178  3e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  29.58 
 
 
453 aa  176  7e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  29.12 
 
 
469 aa  176  8e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  29.17 
 
 
455 aa  176  8e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  30.99 
 
 
462 aa  176  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  28.54 
 
 
453 aa  173  6.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0692  peptidase M20  28.27 
 
 
450 aa  172  1e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  28.9 
 
 
453 aa  172  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  29.24 
 
 
458 aa  171  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  30.36 
 
 
485 aa  171  3e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  32.45 
 
 
464 aa  170  7e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  28.04 
 
 
459 aa  169  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  28.89 
 
 
465 aa  168  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  26.85 
 
 
448 aa  166  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1840  peptidase M20  26.48 
 
 
448 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  29.64 
 
 
437 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  29.09 
 
 
440 aa  163  5.0000000000000005e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  29.59 
 
 
460 aa  161  3e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  28.6 
 
 
463 aa  160  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  28.31 
 
 
465 aa  159  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  31.3 
 
 
465 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  31.3 
 
 
465 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  28.29 
 
 
472 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  29.88 
 
 
467 aa  155  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1484  hypothetical protein  31.06 
 
 
418 aa  155  2e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.555419  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  28.24 
 
 
457 aa  154  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  30.19 
 
 
465 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  29.21 
 
 
470 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  27.74 
 
 
484 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  28.5 
 
 
467 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2697  peptidase M20  27.72 
 
 
451 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.922328 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  32.26 
 
 
464 aa  152  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  27.52 
 
 
461 aa  150  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0429  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.64 
 
 
445 aa  150  6e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  28.21 
 
 
468 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  28.27 
 
 
460 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  28.33 
 
 
468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  29 
 
 
457 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  29.47 
 
 
457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.75 
 
 
406 aa  147  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  27.02 
 
 
474 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  28.43 
 
 
479 aa  147  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  27.93 
 
 
463 aa  146  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  29.15 
 
 
462 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  27.33 
 
 
468 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  28.75 
 
 
488 aa  144  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1640  hypothetical protein  25.16 
 
 
458 aa  143  7e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  27.18 
 
 
471 aa  143  7e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  27.18 
 
 
471 aa  143  7e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0859  hypothetical protein  27.61 
 
 
463 aa  143  7e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  27.76 
 
 
469 aa  143  9e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1931  hypothetical protein  28.19 
 
 
458 aa  142  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  27.61 
 
 
468 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  29.09 
 
 
462 aa  142  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03459  glutamate carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05450)  27.2 
 
 
535 aa  141  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00014033 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  27.54 
 
 
462 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  27.78 
 
 
462 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01640  glutamate carboxypeptidase protein, putative  26.47 
 
 
476 aa  139  2e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.182836  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  28.92 
 
 
468 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  27.38 
 
 
461 aa  138  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  27.45 
 
 
465 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  27.06 
 
 
468 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  28.6 
 
 
459 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3819  hypothetical protein  27.49 
 
 
471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  27.54 
 
 
461 aa  134  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3030  hypothetical protein  26.45 
 
 
467 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  27.71 
 
 
481 aa  134  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  26.48 
 
 
470 aa  133  6.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1646  hypothetical protein  27.51 
 
 
460 aa  133  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  26.33 
 
 
460 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3597  hypothetical protein  27.17 
 
 
463 aa  131  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  26.1 
 
 
512 aa  130  6e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  26.58 
 
 
461 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14090  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  26.3 
 
 
469 aa  130  7.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2332  hypothetical protein  27.45 
 
 
471 aa  129  9.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0625849  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  28.51 
 
 
468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>