277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1675 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1675  hypothetical protein  100 
 
 		 473 aa  934    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1721  hypothetical protein  70.35 
 
 		 468 aa  656    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3123  hypothetical protein  77.85 
 
 		 475 aa  714    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1506  hypothetical protein  65.35 
 
 		 473 aa  589  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1486  hypothetical protein  65.13 
 
 		 473 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.664586  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1110  hypothetical protein  64.04 
 
 		 473 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1567  hypothetical protein  64.04 
 
 		 473 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1590  hypothetical protein  64.25 
 
 		 473 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242767  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1647  hypothetical protein  64.47 
 
 		 477 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4728  hypothetical protein  62.94 
 
 		 473 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1159  hypothetical protein  61.32 
 
 		 473 aa  568  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1764  hypothetical protein  61.62 
 
 		 467 aa  565  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.278132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5121  hypothetical protein  58.95 
 
 		 475 aa  558  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4729  hypothetical protein  55.81 
 
 		 476 aa  560  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3656  hypothetical protein  61.47 
 
 		 490 aa  555  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.989996  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3819  hypothetical protein  57.76 
 
 		 471 aa  547  1e-154  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2519  hypothetical protein  61.2 
 
 		 472 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1265  hypothetical protein  61.2 
 
 		 472 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662381  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1341  hypothetical protein  61.2 
 
 		 472 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2971  hypothetical protein  63.42 
 
 		 478 aa  543  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.65839  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3119  hypothetical protein  57.54 
 
 		 475 aa  540  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2571  peptidase, M20/M25/M40 family  56.64 
 
 		 475 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4378  hypothetical protein  59.74 
 
 		 473 aa  526  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3502  hypothetical protein  58.61 
 
 		 472 aa  522  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.67786  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2262  hypothetical protein  55.46 
 
 		 475 aa  521  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2929  hypothetical protein  54.78 
 
 		 475 aa  520  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2217  hypothetical protein  55.87 
 
 		 472 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2529  hypothetical protein  56.33 
 
 		 468 aa  514  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3625  hypothetical protein  57.52 
 
 		 472 aa  495  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1646  hypothetical protein  53.29 
 
 		 460 aa  487  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4152  hypothetical protein  52.52 
 
 		 467 aa  471  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3415  hypothetical protein  52.64 
 
 		 476 aa  451  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3597  hypothetical protein  50.22 
 
 		 463 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5704  hypothetical protein  46.29 
 
 		 459 aa  399  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0680852  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2332  hypothetical protein  48.5 
 
 		 471 aa  359  7e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0625849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  31.39 
 
 		 462 aa  159  9e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  32.94 
 
 		 455 aa  159  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  30.45 
 
 		 456 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  32.63 
 
 		 496 aa  146  7.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  28.29 
 
 		 465 aa  145  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  30.26 
 
 		 451 aa  144  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  29.32 
 
 		 451 aa  143  7e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.03 
 
 		 406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  31.97 
 
 		 452 aa  132  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  29.47 
 
 		 456 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  28.95 
 
 		 453 aa  129  9.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  27.87 
 
 		 465 aa  129  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.36 
 
 		 456 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  28.5 
 
 		 460 aa  127  3e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  30.36 
 
 		 440 aa  127  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.46 
 
 		 475 aa  127  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  29.26 
 
 		 453 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  31.82 
 
 		 465 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  30.2 
 
 		 467 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  25.55 
 
 		 456 aa  124  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  26.28 
 
 		 452 aa  123  9e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  29.34 
 
 		 472 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  31.51 
 
 		 455 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  28.21 
 
 		 485 aa  122  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  31.34 
 
 		 465 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  31.34 
 
 		 465 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  30.28 
 
 		 458 aa  121  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  26.16 
 
 		 459 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  26.97 
 
 		 463 aa  119  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  28.97 
 
 		 479 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  28.17 
 
 		 469 aa  118  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  31.07 
 
 		 464 aa  117  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  29.09 
 
 		 459 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1640  hypothetical protein  28.28 
 
 		 458 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0692  peptidase M20  25.67 
 
 		 450 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  29.62 
 
 		 448 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1868  peptidase M20  26.53 
 
 		 508 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00940892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  31.31 
 
 		 456 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  30.85 
 
 		 468 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  32.14 
 
 		 453 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  32.14 
 
 		 453 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4319  hypothetical protein  32.48 
 
 		 445 aa  110  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.899733  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  32.14 
 
 		 453 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  25.88 
 
 		 460 aa  110  7.000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  32.66 
 
 		 452 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  28.06 
 
 		 463 aa  109  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  28.76 
 
 		 467 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  31.99 
 
 		 470 aa  108  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1258  peptidase dimerisation domain-containing protein  25.81 
 
 		 513 aa  107  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0429  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.39 
 
 		 445 aa  107  4e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  31.7 
 
 		 445 aa  107  5e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  34.01 
 
 		 460 aa  107  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  30.56 
 
 		 448 aa  106  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1719  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  26.09 
 
 		 448 aa  105  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  26.94 
 
 		 458 aa  105  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  28.64 
 
 		 453 aa  104  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  26.24 
 
 		 459 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14090  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  31.28 
 
 		 469 aa  103  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  27.13 
 
 		 453 aa  103  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  28.43 
 
 		 468 aa  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2325  peptidase dimerisation domain protein  24.11 
 
 		 514 aa  103  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2145  peptidase M20  30.31 
 
 		 470 aa  103  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0790004  normal  0.0404303 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  27.78 
 
 		 461 aa  103  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12240  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  32.67 
 
 		 488 aa  103  8e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0824  hypothetical protein  26.54 
 
 		 455 aa  103  9e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>