289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0908 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0908  peptidase M20  100 
 
 
471 aa  943    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.333631  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1737  peptidase M20  58.42 
 
 
474 aa  531  1e-150  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.353972 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02249  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  51.42 
 
 
497 aa  496  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0978  peptidase M20  50.54 
 
 
497 aa  493  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.131029  normal  0.0607563 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0871  hypothetical protein  47.73 
 
 
471 aa  479  1e-134  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0842  hypothetical protein  47.52 
 
 
471 aa  478  1e-134  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0192  M20/M25/M40 family peptidase  48.17 
 
 
480 aa  467  9.999999999999999e-131  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2003  peptidase, M20A family  48.39 
 
 
480 aa  468  9.999999999999999e-131  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5282  peptidase M20  50 
 
 
503 aa  466  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5005  peptidase M20  49.04 
 
 
480 aa  468  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.579178 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3578  putative peptidase  51.02 
 
 
502 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4859  peptidase M20  49.56 
 
 
484 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.928163  normal  0.0105361 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6039  peptidase M20  48.72 
 
 
508 aa  448  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0782  peptidase M20  49.56 
 
 
484 aa  451  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14582  normal  0.0758417 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4868  peptidase M20  48.23 
 
 
500 aa  449  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4342  peptidase M20  49.56 
 
 
484 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  hitchhiker  0.000513432 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3703  peptidase M20  49.34 
 
 
484 aa  450  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.239322  normal  0.638266 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4771  peptidase M20  49.46 
 
 
492 aa  449  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2218  M20/M25/M40 family peptidase  49.04 
 
 
483 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0255073  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1759  M20/M25/M40 family peptidase  48.93 
 
 
479 aa  442  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5457  peptidase M20  49.78 
 
 
486 aa  443  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.448917  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1150  putative peptidase  50.33 
 
 
487 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0875  M20/M25/M40 family peptidase  49.04 
 
 
483 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4121  peptidase M20  48.2 
 
 
487 aa  442  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0967  M20/M25/M40 family peptidase  49.04 
 
 
483 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.294192  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0324  peptidase M20  49.79 
 
 
497 aa  439  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0836  M20/M25/M40 family peptidase  48.83 
 
 
483 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1562  M20/M25/M40 family peptidase  48.83 
 
 
483 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.102974  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0403  peptidase M20  47.56 
 
 
511 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5276  peptidase dimerisation domain-containing protein  48.91 
 
 
494 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222416  normal  0.090428 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3479  peptidase M20  47.98 
 
 
487 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.282817  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1202  peptidase M20  48.2 
 
 
500 aa  440  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0058  M20/M25/M40 family peptidase  48.83 
 
 
483 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.317752  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5375  peptidase M20  48.91 
 
 
484 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.277005  normal  0.0563751 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3455  peptidase M20  48.91 
 
 
484 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.163338  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4911  peptidase M20  48.91 
 
 
484 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.697572 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4083  peptidase M20  48.5 
 
 
491 aa  435  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38850  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  46.75 
 
 
475 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.507727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6984  peptidase M20  47.31 
 
 
469 aa  391  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0233  peptidase M20  45.78 
 
 
469 aa  348  1e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.159664  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  33.55 
 
 
453 aa  154  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14090  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  32.89 
 
 
469 aa  152  8.999999999999999e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  31.95 
 
 
453 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  31.95 
 
 
453 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  31.95 
 
 
453 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  34.15 
 
 
470 aa  150  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  33.63 
 
 
448 aa  147  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0820  peptidase M20  30.57 
 
 
446 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193713  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3262  peptidase M20  33.84 
 
 
472 aa  144  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0408  peptidase dimerization domain protein  31.91 
 
 
455 aa  138  2e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2021  peptidase M20  34.2 
 
 
469 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.89722  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0824  hypothetical protein  33.6 
 
 
455 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15560  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  32 
 
 
447 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471223  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2219  peptidase M20  32.6 
 
 
476 aa  137  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342655  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2156  hypothetical protein  35.04 
 
 
460 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366159  normal  0.0201539 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1881  peptidase M20  33.26 
 
 
464 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676993 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  30.67 
 
 
445 aa  134  3.9999999999999996e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16280  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  31.47 
 
 
456 aa  133  7.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.78366 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4319  hypothetical protein  32.31 
 
 
445 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.899733  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  32.11 
 
 
484 aa  131  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  31.85 
 
 
460 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2089  peptidase M20  32.51 
 
 
464 aa  125  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  31.23 
 
 
465 aa  124  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12240  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  31.63 
 
 
488 aa  124  5e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  31.78 
 
 
452 aa  123  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4666  Beta-Ala-His dipeptidase  32.2 
 
 
455 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  hitchhiker  0.00791318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1518  peptidase M20  28.38 
 
 
448 aa  121  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0128232  decreased coverage  0.000123266 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  27.31 
 
 
463 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0261  peptidase M20  29.2 
 
 
467 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  29.05 
 
 
456 aa  117  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6602  hypothetical protein  30.49 
 
 
449 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  28.7 
 
 
465 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  27.23 
 
 
467 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  28.7 
 
 
465 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  28.44 
 
 
465 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0480  Beta-Ala-His dipeptidase  29.12 
 
 
453 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  25.74 
 
 
468 aa  107  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  28.07 
 
 
458 aa  107  7e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  27.69 
 
 
465 aa  105  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  27.23 
 
 
461 aa  103  8e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  29.44 
 
 
456 aa  102  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3301  hypothetical protein  28.97 
 
 
449 aa  100  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653299  normal  0.0124999 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  26.29 
 
 
460 aa  100  6e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  24.74 
 
 
457 aa  100  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  26.59 
 
 
440 aa  100  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1926  peptidase M20  30.75 
 
 
447 aa  97.8  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.21832  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  28.82 
 
 
455 aa  97.4  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  24.79 
 
 
456 aa  97.4  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04170  conserved hypothetical protein  25 
 
 
988 aa  97.1  6e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  26.21 
 
 
459 aa  96.7  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  26.6 
 
 
458 aa  96.3  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  25.26 
 
 
469 aa  93.2  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  29.12 
 
 
461 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  25.34 
 
 
455 aa  92  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  26.52 
 
 
462 aa  92  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  26.64 
 
 
472 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  23.67 
 
 
456 aa  92.4  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  24.66 
 
 
460 aa  91.7  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  25.14 
 
 
453 aa  90.1  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  25.54 
 
 
471 aa  89.7  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>