266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5005 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5005  peptidase M20  100 
 
 
480 aa  991    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.579178 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0978  peptidase M20  61.02 
 
 
497 aa  619  1e-176  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.131029  normal  0.0607563 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02249  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  60.55 
 
 
497 aa  604  1.0000000000000001e-171  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0871  hypothetical protein  58.87 
 
 
471 aa  577  1.0000000000000001e-163  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0842  hypothetical protein  58.87 
 
 
471 aa  577  1.0000000000000001e-163  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1737  peptidase M20  55.89 
 
 
474 aa  556  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.353972 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0192  M20/M25/M40 family peptidase  54.09 
 
 
480 aa  555  1e-157  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2003  peptidase, M20A family  54.09 
 
 
480 aa  553  1e-156  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0403  peptidase M20  53.14 
 
 
511 aa  532  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3703  peptidase M20  55.6 
 
 
484 aa  528  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.239322  normal  0.638266 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0782  peptidase M20  56.14 
 
 
484 aa  527  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14582  normal  0.0758417 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4859  peptidase M20  56.36 
 
 
484 aa  528  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.928163  normal  0.0105361 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4342  peptidase M20  56.36 
 
 
484 aa  528  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  hitchhiker  0.000513432 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3479  peptidase M20  52.89 
 
 
487 aa  521  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.282817  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5375  peptidase M20  56.14 
 
 
484 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.277005  normal  0.0563751 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3455  peptidase M20  56.14 
 
 
484 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.163338  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4911  peptidase M20  56.14 
 
 
484 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.697572 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4121  peptidase M20  52.89 
 
 
487 aa  521  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1150  putative peptidase  54.51 
 
 
487 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0875  M20/M25/M40 family peptidase  56.03 
 
 
483 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2218  M20/M25/M40 family peptidase  55.82 
 
 
483 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0255073  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1759  M20/M25/M40 family peptidase  56.03 
 
 
479 aa  512  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4868  peptidase M20  51.87 
 
 
500 aa  514  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5282  peptidase M20  51.59 
 
 
503 aa  513  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5457  peptidase M20  52.88 
 
 
486 aa  513  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.448917  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3578  putative peptidase  53.81 
 
 
502 aa  513  1e-144  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0967  M20/M25/M40 family peptidase  55.82 
 
 
483 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.294192  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5276  peptidase dimerisation domain-containing protein  53.42 
 
 
494 aa  510  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222416  normal  0.090428 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0836  M20/M25/M40 family peptidase  55.82 
 
 
483 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1562  M20/M25/M40 family peptidase  55.82 
 
 
483 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.102974  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0058  M20/M25/M40 family peptidase  55.82 
 
 
483 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.317752  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4771  peptidase M20  50.21 
 
 
492 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4083  peptidase M20  53.8 
 
 
491 aa  503  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1202  peptidase M20  51.82 
 
 
500 aa  503  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0324  peptidase M20  53.56 
 
 
497 aa  504  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6039  peptidase M20  49.07 
 
 
508 aa  497  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0908  peptidase M20  49.04 
 
 
471 aa  468  9.999999999999999e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.333631  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38850  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  49.68 
 
 
475 aa  460  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.507727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6984  peptidase M20  48.83 
 
 
469 aa  449  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0233  peptidase M20  38.84 
 
 
469 aa  315  8e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.159664  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2021  peptidase M20  32.3 
 
 
469 aa  164  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.89722  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  34.38 
 
 
448 aa  159  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0408  peptidase dimerization domain protein  32.58 
 
 
455 aa  159  1e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  34.46 
 
 
453 aa  157  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0824  hypothetical protein  33.57 
 
 
455 aa  154  4e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4319  hypothetical protein  32.45 
 
 
445 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.899733  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16280  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  31.72 
 
 
456 aa  147  4.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.78366 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  29.94 
 
 
445 aa  146  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  32.09 
 
 
453 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  32.09 
 
 
453 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  32.09 
 
 
453 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14090  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  30.38 
 
 
469 aa  144  5e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2219  peptidase M20  30.89 
 
 
476 aa  143  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342655  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  31.18 
 
 
470 aa  143  6e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12240  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  31.25 
 
 
488 aa  143  6e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0820  peptidase M20  31.16 
 
 
446 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193713  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  30.37 
 
 
484 aa  139  8.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4666  Beta-Ala-His dipeptidase  31.17 
 
 
455 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  hitchhiker  0.00791318 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  32.13 
 
 
460 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3262  peptidase M20  29.45 
 
 
472 aa  134  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1881  peptidase M20  30.41 
 
 
464 aa  133  7.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676993 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  32.26 
 
 
452 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2089  peptidase M20  33.06 
 
 
464 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2156  hypothetical protein  32.38 
 
 
460 aa  130  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366159  normal  0.0201539 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15560  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  31.94 
 
 
447 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471223  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  29.02 
 
 
465 aa  126  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1518  peptidase M20  29.03 
 
 
448 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0128232  decreased coverage  0.000123266 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6602  hypothetical protein  28.24 
 
 
449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  28.44 
 
 
467 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0261  peptidase M20  29.57 
 
 
467 aa  114  6e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3301  hypothetical protein  29.95 
 
 
449 aa  113  9e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653299  normal  0.0124999 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  27.35 
 
 
461 aa  103  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  27.03 
 
 
460 aa  102  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  26.11 
 
 
457 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0480  Beta-Ala-His dipeptidase  27.32 
 
 
453 aa  101  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  27.42 
 
 
456 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  27.35 
 
 
461 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  26.18 
 
 
472 aa  99  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  26.95 
 
 
474 aa  99  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  28.1 
 
 
465 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  27.64 
 
 
465 aa  98.2  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  27.64 
 
 
465 aa  98.2  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  27.35 
 
 
461 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  27.73 
 
 
440 aa  97.8  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  27.71 
 
 
461 aa  97.4  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  25.84 
 
 
456 aa  97.4  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  28.79 
 
 
464 aa  97.1  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  24.83 
 
 
465 aa  96.7  8e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  25.55 
 
 
458 aa  95.1  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  25.88 
 
 
463 aa  94.4  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  26.5 
 
 
468 aa  94.4  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  29.18 
 
 
462 aa  94.4  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  27.58 
 
 
467 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  26.68 
 
 
470 aa  92  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  27.08 
 
 
461 aa  91.7  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  26.54 
 
 
461 aa  91.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  27.67 
 
 
488 aa  92.4  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  27.22 
 
 
462 aa  91.7  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  25.67 
 
 
455 aa  91.7  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  28.88 
 
 
462 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>