283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4868 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5276  peptidase dimerisation domain-containing protein  66.95 
 
 		 494 aa  663    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222416  normal  0.090428 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0967  M20/M25/M40 family peptidase  67.24 
 
 		 483 aa  650    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.294192  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0836  M20/M25/M40 family peptidase  67.02 
 
 		 483 aa  648    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0324  peptidase M20  66.8 
 
 		 497 aa  679    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5375  peptidase M20  65.15 
 
 		 484 aa  644    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.277005  normal  0.0563751 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0058  M20/M25/M40 family peptidase  67.02 
 
 		 483 aa  648    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.317752  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2218  M20/M25/M40 family peptidase  67.24 
 
 		 483 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0255073  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0782  peptidase M20  65.57 
 
 		 484 aa  651    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14582  normal  0.0758417 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0875  M20/M25/M40 family peptidase  67.24 
 
 		 483 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1759  M20/M25/M40 family peptidase  66.81 
 
 		 479 aa  644    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6039  peptidase M20  75.97 
 
 		 508 aa  770    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0403  peptidase M20  76.97 
 
 		 511 aa  802    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3703  peptidase M20  65.77 
 
 		 484 aa  655    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.239322  normal  0.638266 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4868  peptidase M20  100 
 
 		 500 aa  1031    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1150  putative peptidase  66.81 
 
 		 487 aa  646    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3479  peptidase M20  77.82 
 
 		 487 aa  779    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.282817  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3455  peptidase M20  65.15 
 
 		 484 aa  644    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.163338  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4342  peptidase M20  65.98 
 
 		 484 aa  652    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  hitchhiker  0.000513432 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3578  putative peptidase  66.21 
 
 		 502 aa  677    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4859  peptidase M20  65.98 
 
 		 484 aa  652    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.928163  normal  0.0105361 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5457  peptidase M20  65.34 
 
 		 486 aa  644    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.448917  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5282  peptidase M20  82.83 
 
 		 503 aa  856    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4911  peptidase M20  65.15 
 
 		 484 aa  644    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.697572 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4771  peptidase M20  76.57 
 
 		 492 aa  798    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4083  peptidase M20  84.8 
 
 		 491 aa  870    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1562  M20/M25/M40 family peptidase  67.02 
 
 		 483 aa  648    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.102974  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4121  peptidase M20  78.03 
 
 		 487 aa  781    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1202  peptidase M20  75.5 
 
 		 500 aa  786    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0978  peptidase M20  53.72 
 
 		 497 aa  534  1e-150  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.131029  normal  0.0607563 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02249  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  53.21 
 
 		 497 aa  528  1e-149  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0871  hypothetical protein  51.05 
 
 		 471 aa  523  1e-147  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0842  hypothetical protein  50.84 
 
 		 471 aa  520  1e-146  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5005  peptidase M20  51.87 
 
 		 480 aa  514  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.579178 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1737  peptidase M20  52.85 
 
 		 474 aa  495  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353972 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2003  peptidase, M20A family  48.65 
 
 		 480 aa  480  1e-134  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0192  M20/M25/M40 family peptidase  48.65 
 
 		 480 aa  481  1e-134  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38850  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  48.23 
 
 		 475 aa  455  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.507727 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0908  peptidase M20  48.23 
 
 		 471 aa  449  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.333631  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6984  peptidase M20  45.03 
 
 		 469 aa  420  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0233  peptidase M20  37.87 
 
 		 469 aa  303  6.000000000000001e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.159664  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0824  hypothetical protein  32.63 
 
 		 455 aa  160  6e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14090  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  30.23 
 
 		 469 aa  159  8e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0408  peptidase dimerization domain protein  31.45 
 
 		 455 aa  149  9e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  32.55 
 
 		 448 aa  146  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  28.48 
 
 		 453 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  28.48 
 
 		 453 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  28.48 
 
 		 453 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  32.26 
 
 		 453 aa  143  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2219  peptidase M20  32.09 
 
 		 476 aa  141  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342655  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0820  peptidase M20  29.17 
 
 		 446 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2156  hypothetical protein  31.81 
 
 		 460 aa  139  8.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366159  normal  0.0201539 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  28.29 
 
 		 484 aa  139  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4319  hypothetical protein  31.08 
 
 		 445 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.899733  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1881  peptidase M20  29.89 
 
 		 464 aa  138  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676993 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16280  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  28.78 
 
 		 456 aa  137  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.78366 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  29.03 
 
 		 460 aa  133  7.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3262  peptidase M20  31.15 
 
 		 472 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0261  peptidase M20  29.44 
 
 		 467 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2089  peptidase M20  31.45 
 
 		 464 aa  131  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4666  Beta-Ala-His dipeptidase  29.07 
 
 		 455 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  hitchhiker  0.00791318 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2021  peptidase M20  31.2 
 
 		 469 aa  128  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.89722  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3301  hypothetical protein  30.53 
 
 		 449 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653299  normal  0.0124999 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  28.12 
 
 		 470 aa  125  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12240  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  28.98 
 
 		 488 aa  123  7e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  29.93 
 
 		 452 aa  123  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  27.96 
 
 		 445 aa  122  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  27.27 
 
 		 465 aa  122  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  26.9 
 
 		 465 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  26.5 
 
 		 465 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  26.5 
 
 		 465 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0480  Beta-Ala-His dipeptidase  30.29 
 
 		 453 aa  119  9e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15560  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  30.18 
 
 		 447 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  25.9 
 
 		 467 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6602  hypothetical protein  27.66 
 
 		 449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1518  peptidase M20  28.02 
 
 		 448 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0128232  decreased coverage  0.000123266 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  26.92 
 
 		 488 aa  109  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  25.56 
 
 		 457 aa  105  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  25.72 
 
 		 458 aa  103  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  26.91 
 
 		 467 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  25.73 
 
 		 462 aa  102  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  27.74 
 
 		 474 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  26.31 
 
 		 469 aa  102  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1438  peptidase M20  28.57 
 
 		 457 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  27.97 
 
 		 464 aa  99.8  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  28.61 
 
 		 512 aa  98.6  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  29 
 
 		 456 aa  97.8  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  27.59 
 
 		 470 aa  97.1  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  23.8 
 
 		 463 aa  97.1  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  24.95 
 
 		 452 aa  97.1  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  27.04 
 
 		 440 aa  96.3  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  25.74 
 
 		 459 aa  95.5  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  27.36 
 
 		 457 aa  95.5  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  25.65 
 
 		 460 aa  95.1  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  28.84 
 
 		 456 aa  94.4  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  24.79 
 
 		 456 aa  94.4  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  26.97 
 
 		 457 aa  93.6  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  24.74 
 
 		 468 aa  92.8  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  25.31 
 
 		 475 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  25.94 
 
 		 455 aa  92.8  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  26.65 
 
 		 471 aa  92  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>