More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1737 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1737  peptidase M20  100 
 
 
474 aa  952    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.353972 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0978  peptidase M20  58.23 
 
 
497 aa  579  1e-164  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.131029  normal  0.0607563 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02249  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  58.21 
 
 
497 aa  569  1e-161  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5005  peptidase M20  55.89 
 
 
480 aa  556  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.579178 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0871  hypothetical protein  53.02 
 
 
471 aa  534  1e-150  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0842  hypothetical protein  53.02 
 
 
471 aa  533  1e-150  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0908  peptidase M20  58.42 
 
 
471 aa  531  1e-150  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.333631  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4859  peptidase M20  56.05 
 
 
484 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.928163  normal  0.0105361 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4342  peptidase M20  56.05 
 
 
484 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  hitchhiker  0.000513432 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3703  peptidase M20  55.63 
 
 
484 aa  521  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.239322  normal  0.638266 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2003  peptidase, M20A family  51.51 
 
 
480 aa  518  1e-146  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0782  peptidase M20  55.41 
 
 
484 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14582  normal  0.0758417 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5375  peptidase M20  55.63 
 
 
484 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.277005  normal  0.0563751 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3455  peptidase M20  55.63 
 
 
484 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.163338  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0192  M20/M25/M40 family peptidase  51.29 
 
 
480 aa  518  1.0000000000000001e-145  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4911  peptidase M20  55.63 
 
 
484 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.697572 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5457  peptidase M20  52.16 
 
 
486 aa  501  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.448917  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2218  M20/M25/M40 family peptidase  55.7 
 
 
483 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0255073  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1150  putative peptidase  52.37 
 
 
487 aa  498  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0875  M20/M25/M40 family peptidase  55.92 
 
 
483 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5276  peptidase dimerisation domain-containing protein  52.02 
 
 
494 aa  499  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222416  normal  0.090428 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0967  M20/M25/M40 family peptidase  55.7 
 
 
483 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.294192  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0836  M20/M25/M40 family peptidase  55.7 
 
 
483 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0058  M20/M25/M40 family peptidase  55.7 
 
 
483 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.317752  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1759  M20/M25/M40 family peptidase  55.48 
 
 
479 aa  496  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4868  peptidase M20  52.85 
 
 
500 aa  495  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1562  M20/M25/M40 family peptidase  55.7 
 
 
483 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.102974  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5282  peptidase M20  52.37 
 
 
503 aa  494  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0403  peptidase M20  51.61 
 
 
511 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3479  peptidase M20  52.04 
 
 
487 aa  491  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.282817  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4121  peptidase M20  52.26 
 
 
487 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1202  peptidase M20  52.34 
 
 
500 aa  491  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4771  peptidase M20  52.17 
 
 
492 aa  489  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4083  peptidase M20  53.88 
 
 
491 aa  490  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0324  peptidase M20  53.8 
 
 
497 aa  485  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6039  peptidase M20  52.16 
 
 
508 aa  484  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3578  putative peptidase  52.27 
 
 
502 aa  480  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38850  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  52.89 
 
 
475 aa  478  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.507727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6984  peptidase M20  49.36 
 
 
469 aa  432  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0233  peptidase M20  42.4 
 
 
469 aa  325  1e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.159664  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  36.27 
 
 
453 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  36.27 
 
 
453 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  36.27 
 
 
453 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0408  peptidase dimerization domain protein  31.37 
 
 
455 aa  152  1e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14090  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  35.25 
 
 
469 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2219  peptidase M20  31.52 
 
 
476 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342655  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  35.26 
 
 
484 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  32.76 
 
 
453 aa  146  6e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0824  hypothetical protein  34.16 
 
 
455 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  33.48 
 
 
448 aa  146  8.000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  32.18 
 
 
445 aa  144  5e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16280  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  33.12 
 
 
456 aa  143  8e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.78366 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3262  peptidase M20  33.59 
 
 
472 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2021  peptidase M20  32.2 
 
 
469 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.89722  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  34.63 
 
 
460 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  34.23 
 
 
470 aa  139  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4666  Beta-Ala-His dipeptidase  31.42 
 
 
455 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  hitchhiker  0.00791318 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2089  peptidase M20  33.41 
 
 
464 aa  138  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1881  peptidase M20  35.14 
 
 
464 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676993 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0820  peptidase M20  30.33 
 
 
446 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193713  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  31.18 
 
 
465 aa  137  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4319  hypothetical protein  32.83 
 
 
445 aa  133  6.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.899733  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15560  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  33.42 
 
 
447 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471223  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2156  hypothetical protein  35.75 
 
 
460 aa  131  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366159  normal  0.0201539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  35.28 
 
 
452 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0261  peptidase M20  30.97 
 
 
467 aa  125  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12240  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  33.17 
 
 
488 aa  122  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  30.07 
 
 
465 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  29.7 
 
 
467 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  29.04 
 
 
465 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1518  peptidase M20  29.06 
 
 
448 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0128232  decreased coverage  0.000123266 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  29.04 
 
 
465 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  26.87 
 
 
468 aa  114  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  25.49 
 
 
463 aa  113  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  29.11 
 
 
455 aa  110  6e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  28.38 
 
 
456 aa  110  8.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6602  hypothetical protein  30.6 
 
 
449 aa  109  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3301  hypothetical protein  30.9 
 
 
449 aa  107  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653299  normal  0.0124999 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  25.9 
 
 
463 aa  106  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0480  Beta-Ala-His dipeptidase  27.43 
 
 
453 aa  105  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  23.62 
 
 
460 aa  104  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  28.21 
 
 
440 aa  103  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  27.91 
 
 
469 aa  103  8e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  29.43 
 
 
461 aa  101  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  26.46 
 
 
457 aa  100  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  29.07 
 
 
462 aa  100  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  28.06 
 
 
461 aa  100  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  28.08 
 
 
458 aa  100  8e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1438  peptidase M20  30.96 
 
 
457 aa  99  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368913  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  28.69 
 
 
462 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  28.73 
 
 
474 aa  99  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  24.3 
 
 
456 aa  97.4  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  28.02 
 
 
462 aa  97.1  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  26.98 
 
 
455 aa  96.7  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  27.67 
 
 
467 aa  96.7  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  27.76 
 
 
461 aa  96.3  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  28.57 
 
 
461 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  28.03 
 
 
461 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  26.54 
 
 
465 aa  95.9  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  30.69 
 
 
468 aa  95.5  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>