262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0978 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02249  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  84.91 
 
 		 497 aa  891    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0978  peptidase M20  100 
 
 		 497 aa  1024    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.131029  normal  0.0607563 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5005  peptidase M20  61.02 
 
 		 480 aa  619  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.579178 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0871  hypothetical protein  58.66 
 
 		 471 aa  587  1e-166  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0842  hypothetical protein  58.66 
 
 		 471 aa  586  1e-166  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0192  M20/M25/M40 family peptidase  56.08 
 
 		 480 aa  583  1.0000000000000001e-165  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2003  peptidase, M20A family  56.29 
 
 		 480 aa  582  1.0000000000000001e-165  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1737  peptidase M20  58.23 
 
 		 474 aa  579  1e-164  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353972 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4868  peptidase M20  53.72 
 
 		 500 aa  534  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0324  peptidase M20  54.41 
 
 		 497 aa  530  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4342  peptidase M20  56.66 
 
 		 484 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  hitchhiker  0.000513432 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3578  putative peptidase  54.85 
 
 		 502 aa  530  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4859  peptidase M20  56.66 
 
 		 484 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.928163  normal  0.0105361 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2218  M20/M25/M40 family peptidase  56.99 
 
 		 483 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0255073  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1150  putative peptidase  55.87 
 
 		 487 aa  525  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3703  peptidase M20  56.03 
 
 		 484 aa  526  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.239322  normal  0.638266 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5457  peptidase M20  55.05 
 
 		 486 aa  528  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.448917  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5282  peptidase M20  53.8 
 
 		 503 aa  526  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5276  peptidase dimerisation domain-containing protein  54.33 
 
 		 494 aa  528  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222416  normal  0.090428 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0967  M20/M25/M40 family peptidase  56.99 
 
 		 483 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.294192  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0875  M20/M25/M40 family peptidase  57.2 
 
 		 483 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0836  M20/M25/M40 family peptidase  56.99 
 
 		 483 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1759  M20/M25/M40 family peptidase  57.2 
 
 		 479 aa  523  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0058  M20/M25/M40 family peptidase  56.99 
 
 		 483 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.317752  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1562  M20/M25/M40 family peptidase  56.99 
 
 		 483 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.102974  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0782  peptidase M20  55.81 
 
 		 484 aa  521  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14582  normal  0.0758417 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0403  peptidase M20  52.23 
 
 		 511 aa  519  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3455  peptidase M20  56.03 
 
 		 484 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.163338  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4911  peptidase M20  56.03 
 
 		 484 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.697572 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4083  peptidase M20  54.41 
 
 		 491 aa  520  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5375  peptidase M20  56.03 
 
 		 484 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.277005  normal  0.0563751 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3479  peptidase M20  52.79 
 
 		 487 aa  514  1e-144  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.282817  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4121  peptidase M20  52.79 
 
 		 487 aa  513  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4771  peptidase M20  52.26 
 
 		 492 aa  510  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1202  peptidase M20  52.38 
 
 		 500 aa  509  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6039  peptidase M20  52.79 
 
 		 508 aa  504  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0908  peptidase M20  50.54 
 
 		 471 aa  493  9.999999999999999e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.333631  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38850  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  51.29 
 
 		 475 aa  488  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.507727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6984  peptidase M20  47.97 
 
 		 469 aa  460  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0233  peptidase M20  39.14 
 
 		 469 aa  322  7e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.159664  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16280  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  34.28 
 
 		 456 aa  174  3.9999999999999995e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.78366 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  33.49 
 
 		 453 aa  172  9e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  34.47 
 
 		 448 aa  169  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2021  peptidase M20  32.46 
 
 		 469 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.89722  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4666  Beta-Ala-His dipeptidase  31.99 
 
 		 455 aa  157  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  hitchhiker  0.00791318 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2219  peptidase M20  30.41 
 
 		 476 aa  156  9e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342655  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3262  peptidase M20  32.01 
 
 		 472 aa  154  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4319  hypothetical protein  32.83 
 
 		 445 aa  153  7e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.899733  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  33.5 
 
 		 470 aa  153  8e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1881  peptidase M20  31.74 
 
 		 464 aa  150  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676993 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14090  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  31.62 
 
 		 469 aa  150  5e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  32.9 
 
 		 453 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  32.9 
 
 		 453 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  32.9 
 
 		 453 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  30.39 
 
 		 445 aa  149  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2089  peptidase M20  32.45 
 
 		 464 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2156  hypothetical protein  32.93 
 
 		 460 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366159  normal  0.0201539 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  32.88 
 
 		 484 aa  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0820  peptidase M20  28.1 
 
 		 446 aa  147  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  31.94 
 
 		 460 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0824  hypothetical protein  32.97 
 
 		 455 aa  145  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  32.2 
 
 		 452 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  31.41 
 
 		 467 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  30.87 
 
 		 465 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0408  peptidase dimerization domain protein  31.61 
 
 		 455 aa  140  7e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  30.66 
 
 		 465 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  30.66 
 
 		 465 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15560  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  32.98 
 
 		 447 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12240  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  34.58 
 
 		 488 aa  136  9e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  28.02 
 
 		 465 aa  132  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  29.06 
 
 		 455 aa  124  4e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0261  peptidase M20  29.16 
 
 		 467 aa  124  4e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  29.02 
 
 		 456 aa  124  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  26.82 
 
 		 460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0480  Beta-Ala-His dipeptidase  28.64 
 
 		 453 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  28.33 
 
 		 456 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  27.71 
 
 		 467 aa  114  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6602  hypothetical protein  30.53 
 
 		 449 aa  114  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  27.98 
 
 		 453 aa  113  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  27.54 
 
 		 462 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  25.47 
 
 		 457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  26.43 
 
 		 457 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  25.28 
 
 		 463 aa  111  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  29.6 
 
 		 462 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1518  peptidase M20  26.46 
 
 		 448 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0128232  decreased coverage  0.000123266 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  29.89 
 
 		 462 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  25.97 
 
 		 460 aa  110  7.000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  25.16 
 
 		 469 aa  110  8.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  27.15 
 
 		 440 aa  109  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  26.1 
 
 		 455 aa  109  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  26.91 
 
 		 456 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  29.03 
 
 		 462 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  26.59 
 
 		 475 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  26.3 
 
 		 453 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  28.17 
 
 		 456 aa  107  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  27.5 
 
 		 464 aa  106  8e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3301  hypothetical protein  29.23 
 
 		 449 aa  106  9e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653299  normal  0.0124999 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  26.82 
 
 		 474 aa  106  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  26.98 
 
 		 465 aa  106  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  26 
 
 		 472 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>