More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0193 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  100 
 
 		 421 aa  845    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  48.54 
 
 		 407 aa  387  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1103  diaminopimelate aminotransferase  46.6 
 
 		 407 aa  377  1e-103  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  49.03 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  48.91 
 
 		 396 aa  360  3e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1441  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  45.06 
 
 		 404 aa  354  1e-96  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0234  diaminopimelate aminotransferase  41.93 
 
 		 411 aa  354  2e-96  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00102405  normal  0.710692 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0068  diaminopimelate aminotransferase  46.33 
 
 		 411 aa  343  2.9999999999999997e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0641  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  44.06 
 
 		 411 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0113  diaminopimelate aminotransferase  42.72 
 
 		 413 aa  317  3e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.239854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0836  diaminopimelate aminotransferase  39.19 
 
 		 423 aa  301  1e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000246987  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1275  diaminopimelate aminotransferase  41.97 
 
 		 415 aa  300  5e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000199982  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0709  diaminopimelate aminotransferase  39.28 
 
 		 415 aa  298  1e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.123026  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0550  diaminopimelate aminotransferase  41.06 
 
 		 409 aa  298  2e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000714346 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2049  diaminopimelate aminotransferase  40.87 
 
 		 409 aa  293  3e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1333  diaminopimelate aminotransferase  40.38 
 
 		 407 aa  291  1e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546409  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0643  diaminopimelate aminotransferase  40.77 
 
 		 415 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.166626  hitchhiker  0.00154424 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  40.05 
 
 		 415 aa  289  7e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1865  diaminopimelate aminotransferase  41.52 
 
 		 406 aa  288  9e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.363137  normal  0.0244826 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1810  diaminopimelate aminotransferase  40.73 
 
 		 410 aa  286  4e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1933  diaminopimelate aminotransferase  39.49 
 
 		 413 aa  282  9e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.45 
 
 		 398 aa  141  3e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.31 
 
 		 399 aa  139  7e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.91 
 
 		 395 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.45 
 
 		 399 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3489  hypothetical protein  28.97 
 
 		 430 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.919761 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1868  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.88 
 
 		 375 aa  117  5e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3037  hypothetical protein  27.82 
 
 		 451 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2607  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.45 
 
 		 382 aa  113  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.09 
 
 		 410 aa  113  7.000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.15 
 
 		 413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2433  peptidase M20  27.93 
 
 		 448 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00897679  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  27.15 
 
 		 442 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0353  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.52 
 
 		 410 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117081  hitchhiker  0.0085825 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12171  hypothetical protein  27.81 
 
 		 450 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.744068 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1278  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.92 
 
 		 375 aa  105  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.645839 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  28.49 
 
 		 433 aa  104  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2313  hypothetical protein  27.11 
 
 		 442 aa  104  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1459  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.76 
 
 		 383 aa  104  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03550  hypothetical protein  28.77 
 
 		 451 aa  103  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0095  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.19 
 
 		 377 aa  103  5e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1150  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.94 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2128  peptidase M20  28.74 
 
 		 446 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02089  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.02 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.569859  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  28.03 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4547  peptidase M20  34.39 
 
 		 440 aa  102  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  27.86 
 
 		 411 aa  102  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19930  hypothetical protein  27.65 
 
 		 434 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000770232  decreased coverage  0.0000700572 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  28.86 
 
 		 405 aa  101  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17060  hypothetical protein  27.88 
 
 		 439 aa  100  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3226  hypothetical protein  27.68 
 
 		 444 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.236057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3164  hypothetical protein  27.68 
 
 		 444 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258961  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  27.76 
 
 		 440 aa  100  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0499  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.06 
 
 		 383 aa  100  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1338  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.77 
 
 		 390 aa  99.8  8e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6207  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.54 
 
 		 419 aa  99.8  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3176  hypothetical protein  27.68 
 
 		 444 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6376  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.54 
 
 		 419 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01145  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.98 
 
 		 376 aa  99  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0346694  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6609  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.54 
 
 		 419 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0785768 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0316  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.54 
 
 		 402 aa  99  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4882  hypothetical protein  28.93 
 
 		 443 aa  98.6  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  28.57 
 
 		 405 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  28.57 
 
 		 389 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  28.57 
 
 		 405 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  29.78 
 
 		 387 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1852  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.87 
 
 		 378 aa  98.2  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.751172  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  27.14 
 
 		 452 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  28.57 
 
 		 405 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  28.07 
 
 		 428 aa  98.6  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  28.57 
 
 		 405 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  28.57 
 
 		 389 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2768  hypothetical protein  26.1 
 
 		 449 aa  98.6  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000530587  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  28.57 
 
 		 586 aa  98.2  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  29.94 
 
 		 397 aa  97.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  29.66 
 
 		 397 aa  97.1  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1152  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.99 
 
 		 366 aa  97.1  6e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135979  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  29.68 
 
 		 387 aa  96.7  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.05 
 
 		 377 aa  96.3  9e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0350  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.07 
 
 		 385 aa  96.3  9e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.306111  normal  0.0744523 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0030  acetylornithine deacetylase  26.91 
 
 		 446 aa  96.3  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1471  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.83 
 
 		 378 aa  96.3  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0081  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.74 
 
 		 377 aa  96.3  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3894  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.94 
 
 		 433 aa  95.9  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4903  hypothetical protein  26.78 
 
 		 462 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308008  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2126  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.15 
 
 		 376 aa  95.1  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.521922  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2647  peptidase M20  27.64 
 
 		 442 aa  94.7  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490872  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.62 
 
 		 442 aa  95.1  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2793  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.52 
 
 		 377 aa  94.7  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.368215 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  28.66 
 
 		 412 aa  94.4  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2196  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.23 
 
 		 385 aa  94  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.22 
 
 		 400 aa  94.4  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0561  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.81 
 
 		 407 aa  93.6  6e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1819  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.39 
 
 		 382 aa  93.6  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.578155  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1496  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.39 
 
 		 382 aa  93.6  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11770  hypothetical protein  26.67 
 
 		 441 aa  93.2  8e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.235527  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1109  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.76 
 
 		 409 aa  92.4  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  28.78 
 
 		 404 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2278  acetylornithine deacetylase  24.64 
 
 		 422 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  29.11 
 
 		 390 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>