More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0836 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0836  diaminopimelate aminotransferase  100 
 
 
423 aa  843    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000246987  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1275  diaminopimelate aminotransferase  63.01 
 
 
415 aa  537  1e-151  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000199982  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  62.53 
 
 
415 aa  530  1e-149  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0643  diaminopimelate aminotransferase  61.81 
 
 
415 aa  526  1e-148  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.166626  hitchhiker  0.00154424 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0709  diaminopimelate aminotransferase  62.62 
 
 
415 aa  524  1e-147  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.123026  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  44.42 
 
 
407 aa  320  3e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  38.07 
 
 
396 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  38.07 
 
 
396 aa  302  6.000000000000001e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  39.19 
 
 
421 aa  301  1e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1103  diaminopimelate aminotransferase  40.38 
 
 
407 aa  298  2e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1441  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.28 
 
 
404 aa  286  7e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0068  diaminopimelate aminotransferase  41.3 
 
 
411 aa  281  2e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0113  diaminopimelate aminotransferase  37.16 
 
 
413 aa  279  6e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.239854  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2049  diaminopimelate aminotransferase  32.62 
 
 
409 aa  271  1e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1810  diaminopimelate aminotransferase  34.61 
 
 
410 aa  269  8.999999999999999e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1865  diaminopimelate aminotransferase  35.32 
 
 
406 aa  269  8.999999999999999e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.363137  normal  0.0244826 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0550  diaminopimelate aminotransferase  34.36 
 
 
409 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000714346 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1933  diaminopimelate aminotransferase  33.33 
 
 
413 aa  268  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0234  diaminopimelate aminotransferase  36.67 
 
 
411 aa  262  8e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00102405  normal  0.710692 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1333  diaminopimelate aminotransferase  33.73 
 
 
407 aa  259  7e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546409  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0641  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  32.61 
 
 
411 aa  252  8.000000000000001e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.91 
 
 
398 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.31 
 
 
395 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.53 
 
 
399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.59 
 
 
399 aa  125  1e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2793  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.21 
 
 
377 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.368215 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.74 
 
 
413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1152  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.85 
 
 
366 aa  114  3e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135979  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0788  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.3 
 
 
398 aa  114  3e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.770498  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2967  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.34 
 
 
375 aa  114  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.546622 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1868  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  21.43 
 
 
375 aa  114  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02089  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.56 
 
 
390 aa  113  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.569859  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.47 
 
 
377 aa  113  6e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  24.14 
 
 
419 aa  111  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2627  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.82 
 
 
375 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2676  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.12 
 
 
375 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2716  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.12 
 
 
375 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0930351 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2849  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.12 
 
 
375 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2742  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.12 
 
 
375 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3693  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.52 
 
 
375 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2843  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.52 
 
 
375 aa  107  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02363  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.52 
 
 
375 aa  107  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1198  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.52 
 
 
375 aa  107  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02325  hypothetical protein  24.52 
 
 
375 aa  107  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2751  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.52 
 
 
375 aa  107  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1205  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.52 
 
 
375 aa  107  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.270871  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2618  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.52 
 
 
375 aa  107  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2602  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.52 
 
 
375 aa  107  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.64 
 
 
370 aa  106  7e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0240606  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2796  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25 
 
 
397 aa  106  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.884075 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0240  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.59 
 
 
367 aa  105  1e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0353  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.59 
 
 
410 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117081  hitchhiker  0.0085825 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3162  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.4 
 
 
375 aa  105  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000827739  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0561  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.18 
 
 
407 aa  105  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0676  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.02 
 
 
374 aa  105  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.438306  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0781  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.02 
 
 
374 aa  105  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.946099  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3141  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.58 
 
 
375 aa  104  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1471  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  21.38 
 
 
378 aa  104  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1098  peptidase dimerisation domain-containing protein  25.77 
 
 
411 aa  104  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.975986 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1372  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.58 
 
 
375 aa  104  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1169  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.68 
 
 
375 aa  103  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0085644  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0549  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.76 
 
 
407 aa  103  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.306298 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3614  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  21.55 
 
 
386 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  normal  0.0448181 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1255  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.58 
 
 
375 aa  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0246  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.18 
 
 
363 aa  102  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0420  putative acetylornithine deacetylase  26.01 
 
 
382 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.71 
 
 
387 aa  101  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  25.36 
 
 
389 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0775  hypothetical protein  23.91 
 
 
409 aa  99.8  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0167319  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  23.42 
 
 
390 aa  99.4  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2278  acetylornithine deacetylase  26.39 
 
 
422 aa  99  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3045  acetylornithine deacetylase  26.46 
 
 
422 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3501  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.78 
 
 
375 aa  99.4  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0316  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.86 
 
 
402 aa  99.4  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1724  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.94 
 
 
377 aa  98.2  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  25.69 
 
 
379 aa  98.2  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0166  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.81 
 
 
407 aa  98.2  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2475  acetylornithine deacetylase  24.05 
 
 
420 aa  98.6  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0713768  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0990  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.04 
 
 
365 aa  98.6  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1271  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.47 
 
 
392 aa  98.2  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1338  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.41 
 
 
390 aa  97.8  3e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1459  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.11 
 
 
383 aa  97.8  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1685  acetylornithine deacetylase  25.7 
 
 
422 aa  97.8  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.56308  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01145  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  21.96 
 
 
376 aa  97.8  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0346694  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0389  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.17 
 
 
395 aa  97.8  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.45697  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1819  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.14 
 
 
382 aa  97.4  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.578155  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0233  peptidase M20  23.65 
 
 
420 aa  97.4  4e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.571831  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1496  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.14 
 
 
382 aa  97.4  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3037  hypothetical protein  23.68 
 
 
451 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1069  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.72 
 
 
365 aa  97.4  4e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.765563  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0076  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.22 
 
 
404 aa  97.4  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2976  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  21.69 
 
 
375 aa  97.4  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0234315  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.83 
 
 
442 aa  97.1  5e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2321  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  21.61 
 
 
424 aa  96.7  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.0430362 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27 
 
 
410 aa  96.3  8e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.25 
 
 
395 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  23.41 
 
 
421 aa  96.3  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2331  acetylornithine deacetylase  25.53 
 
 
422 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.055832  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1031  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.04 
 
 
395 aa  95.9  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  25.46 
 
 
422 aa  96.3  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>