More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1441 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1441  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 		 404 aa  832    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  54.21 
 
 		 407 aa  437  1e-121  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1103  diaminopimelate aminotransferase  50.12 
 
 		 407 aa  416  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  50.38 
 
 		 396 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  49.75 
 
 		 396 aa  409  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  45.06 
 
 		 421 aa  370  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0113  diaminopimelate aminotransferase  43.46 
 
 		 413 aa  369  1e-101  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.239854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0234  diaminopimelate aminotransferase  43.9 
 
 		 411 aa  348  9e-95  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00102405  normal  0.710692 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1810  diaminopimelate aminotransferase  41.91 
 
 		 410 aa  330  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0068  diaminopimelate aminotransferase  43.97 
 
 		 411 aa  320  1.9999999999999998e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1333  diaminopimelate aminotransferase  43.39 
 
 		 407 aa  320  3e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546409  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0550  diaminopimelate aminotransferase  41.34 
 
 		 409 aa  317  3e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000714346 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1865  diaminopimelate aminotransferase  40.1 
 
 		 406 aa  309  6.999999999999999e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.363137  normal  0.0244826 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0709  diaminopimelate aminotransferase  40 
 
 		 415 aa  306  3e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.123026  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1933  diaminopimelate aminotransferase  39.71 
 
 		 413 aa  298  8e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0836  diaminopimelate aminotransferase  39.28 
 
 		 423 aa  298  1e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000246987  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2049  diaminopimelate aminotransferase  37.71 
 
 		 409 aa  296  6e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1275  diaminopimelate aminotransferase  39.47 
 
 		 415 aa  294  2e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000199982  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0643  diaminopimelate aminotransferase  39.47 
 
 		 415 aa  292  9e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.166626  hitchhiker  0.00154424 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0641  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  37.78 
 
 		 411 aa  291  2e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  38.74 
 
 		 415 aa  289  6e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.62 
 
 		 398 aa  137  4e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.91 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.18 
 
 		 399 aa  131  3e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.25 
 
 		 399 aa  129  7.000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.86 
 
 		 410 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0781  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.8 
 
 		 374 aa  108  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.946099  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0676  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.8 
 
 		 374 aa  109  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.438306  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.06 
 
 		 396 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4547  peptidase M20  26.59 
 
 		 440 aa  107  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1868  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.73 
 
 		 375 aa  107  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3162  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.94 
 
 		 375 aa  107  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000827739  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0775  hypothetical protein  27.49 
 
 		 409 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0167319  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1169  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.12 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0085644  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03550  hypothetical protein  27.41 
 
 		 451 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  28.43 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0316  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.47 
 
 		 402 aa  105  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  28.16 
 
 		 411 aa  104  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  27.98 
 
 		 433 aa  103  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  27.25 
 
 		 442 aa  102  9e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1109  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.62 
 
 		 409 aa  101  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  25.59 
 
 		 419 aa  101  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3501  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.77 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2967  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25 
 
 		 375 aa  100  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.546622 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1152  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.78 
 
 		 366 aa  100  5e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135979  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2742  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.09 
 
 		 375 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2849  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.09 
 
 		 375 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2676  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.09 
 
 		 375 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2716  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.09 
 
 		 375 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0930351 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  27.1 
 
 		 440 aa  100  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0561  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.08 
 
 		 407 aa  99.8  8e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1862  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.87 
 
 		 376 aa  99.8  8e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000241136 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2627  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.35 
 
 		 375 aa  99.4  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1351  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.72 
 
 		 379 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.42322 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  26.8 
 
 		 388 aa  98.6  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9227  peptidase M20  26.42 
 
 		 435 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3625  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  34.22 
 
 		 417 aa  97.8  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.209482  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0578  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.22 
 
 		 377 aa  97.4  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  27.23 
 
 		 432 aa  96.7  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2418  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.4 
 
 		 376 aa  97.1  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.508006  decreased coverage  0.00000131595 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2313  hypothetical protein  26.93 
 
 		 442 aa  96.7  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2188  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.72 
 
 		 376 aa  96.7  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0116098 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2469  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.04 
 
 		 379 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167643  hitchhiker  0.0000634543 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4390  peptidase M20  27.55 
 
 		 413 aa  95.5  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2607  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.08 
 
 		 382 aa  96.3  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1814  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.39 
 
 		 376 aa  95.9  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.93447  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2069  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.57 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370348  normal  0.325609 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1852  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.84 
 
 		 378 aa  95.5  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.751172  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.58 
 
 		 433 aa  95.1  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2083  acetylornithine deacetylase  29.29 
 
 		 388 aa  94.4  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151989  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2843  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.16 
 
 		 375 aa  94.7  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1810  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.67 
 
 		 406 aa  94.7  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.834903 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1892  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.57 
 
 		 391 aa  94.4  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3929  peptidase M20  25 
 
 		 411 aa  94.7  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.856117  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  27.25 
 
 		 434 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02363  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.68 
 
 		 375 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1198  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.68 
 
 		 375 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2618  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.68 
 
 		 375 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1205  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.68 
 
 		 375 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.270871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2602  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.68 
 
 		 375 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0549  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.92 
 
 		 407 aa  94  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.306298 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2751  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.68 
 
 		 375 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02325  hypothetical protein  24.68 
 
 		 375 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3894  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.69 
 
 		 433 aa  94  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0499  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.92 
 
 		 383 aa  93.6  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1994  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.83 
 
 		 425 aa  94  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.209302 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1372  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.36 
 
 		 375 aa  93.6  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3141  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.36 
 
 		 375 aa  93.6  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2554  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.76 
 
 		 376 aa  93.6  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3693  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.08 
 
 		 375 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1422  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.71 
 
 		 423 aa  92.8  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1255  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.36 
 
 		 375 aa  92.8  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03183  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.55 
 
 		 378 aa  92.4  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1271  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.38 
 
 		 392 aa  92.4  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0030  acetylornithine deacetylase  23.82 
 
 		 446 aa  92.4  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02089  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.69 
 
 		 390 aa  92.8  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.569859  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1080  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.62 
 
 		 375 aa  92.8  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0627  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.31 
 
 		 365 aa  92.4  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.119075  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1150  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.66 
 
 		 376 aa  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1668  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.27 
 
 		 401 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154111  normal  0.0474135 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>