More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1865 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1865  diaminopimelate aminotransferase  100 
 
 		 406 aa  832    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.363137  normal  0.0244826 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1810  diaminopimelate aminotransferase  55.86 
 
 		 410 aa  462  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0550  diaminopimelate aminotransferase  53.81 
 
 		 409 aa  448  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000714346 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2049  diaminopimelate aminotransferase  53.81 
 
 		 409 aa  443  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1333  diaminopimelate aminotransferase  52.83 
 
 		 407 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546409  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1933  diaminopimelate aminotransferase  48.51 
 
 		 413 aa  397  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0068  diaminopimelate aminotransferase  48.13 
 
 		 411 aa  392  1e-108  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0113  diaminopimelate aminotransferase  43.56 
 
 		 413 aa  353  2.9999999999999997e-96  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.239854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0234  diaminopimelate aminotransferase  40.65 
 
 		 411 aa  349  4e-95  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00102405  normal  0.710692 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1103  diaminopimelate aminotransferase  39.66 
 
 		 407 aa  332  6e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  40.39 
 
 		 407 aa  330  4e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  42.28 
 
 		 396 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0641  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  40.69 
 
 		 411 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  41.52 
 
 		 396 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1441  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.1 
 
 		 404 aa  296  5e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0709  diaminopimelate aminotransferase  37.38 
 
 		 415 aa  289  6e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.123026  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  41.52 
 
 		 421 aa  288  9e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  36.8 
 
 		 415 aa  276  5e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0643  diaminopimelate aminotransferase  37.05 
 
 		 415 aa  271  2e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.166626  hitchhiker  0.00154424 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0836  diaminopimelate aminotransferase  35.32 
 
 		 423 aa  269  8.999999999999999e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000246987  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1275  diaminopimelate aminotransferase  36.71 
 
 		 415 aa  268  1e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000199982  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.97 
 
 		 395 aa  130  3e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.16 
 
 		 398 aa  129  8.000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.68 
 
 		 399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.85 
 
 		 399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.33 
 
 		 442 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  29.26 
 
 		 428 aa  109  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1758  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.21 
 
 		 439 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0404  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.98 
 
 		 423 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2494  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.82 
 
 		 423 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6541  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.48 
 
 		 389 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.660078 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1496  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.5 
 
 		 382 aa  98.6  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1819  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.5 
 
 		 382 aa  98.6  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.578155  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7452  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.07 
 
 		 397 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248803  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  27.53 
 
 		 374 aa  97.4  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1474  peptidase M20  28.77 
 
 		 438 aa  95.9  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.739931  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  29.6 
 
 		 397 aa  94.4  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2314  acetylornithine deacetylase  28.1 
 
 		 416 aa  93.6  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  28.32 
 
 		 389 aa  93.2  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  29.45 
 
 		 586 aa  93.2  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  28.32 
 
 		 389 aa  93.2  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  28.32 
 
 		 405 aa  93.2  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  28.32 
 
 		 405 aa  93.2  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  28.32 
 
 		 405 aa  93.2  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  28.32 
 
 		 405 aa  93.2  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  28.03 
 
 		 405 aa  92.8  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0354  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.49 
 
 		 388 aa  92.4  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  31.23 
 
 		 416 aa  92.4  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  27.37 
 
 		 376 aa  92.8  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  27.9 
 
 		 404 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2717  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.64 
 
 		 391 aa  91.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11396  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  29.07 
 
 		 397 aa  92  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  25.7 
 
 		 452 aa  91.3  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  29.33 
 
 		 412 aa  91.3  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2996  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.48 
 
 		 381 aa  90.9  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.343819 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0449  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.85 
 
 		 390 aa  91.3  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.408478 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0246  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.61 
 
 		 363 aa  91.3  3e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.61 
 
 		 400 aa  90.5  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1471  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.81 
 
 		 378 aa  90.5  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2784  peptidase M20  31.32 
 
 		 394 aa  90.9  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0847  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.29 
 
 		 413 aa  90.5  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.359888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.12 
 
 		 433 aa  90.5  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0166  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.44 
 
 		 407 aa  90.5  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2044  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.52 
 
 		 391 aa  90.5  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.398089  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.27 
 
 		 395 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1445  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.35 
 
 		 365 aa  89.7  8e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0181667  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4903  hypothetical protein  28.18 
 
 		 462 aa  89.7  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308008  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  28.84 
 
 		 374 aa  89.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  26.7 
 
 		 419 aa  89  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.48 
 
 		 392 aa  89.4  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0788  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.22 
 
 		 398 aa  88.6  2e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.770498  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  29.84 
 
 		 452 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0783  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.67 
 
 		 435 aa  88.2  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2475  acetylornithine deacetylase  27.76 
 
 		 420 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0713768  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  28.22 
 
 		 385 aa  88.2  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  30.97 
 
 		 440 aa  88.2  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3116  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.91 
 
 		 395 aa  87.8  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.210379  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.84 
 
 		 410 aa  87.4  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  25.93 
 
 		 403 aa  87.4  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3929  peptidase M20  28.7 
 
 		 411 aa  87  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.856117  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  27.99 
 
 		 411 aa  86.7  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2069  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.14 
 
 		 391 aa  86.7  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370348  normal  0.325609 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3894  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.48 
 
 		 433 aa  87  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  23.53 
 
 		 422 aa  86.7  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0995  acetylornithine deacetylase  28.7 
 
 		 419 aa  86.3  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0078  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.82 
 
 		 397 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  27.18 
 
 		 374 aa  85.9  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1372  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25 
 
 		 375 aa  85.9  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3141  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25 
 
 		 375 aa  85.9  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  28.01 
 
 		 406 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1326  acetylornithine deacetylase  26.88 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000659455  hitchhiker  0.00151978 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  28.01 
 
 		 406 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  28.78 
 
 		 397 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  27.14 
 
 		 404 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2278  acetylornithine deacetylase  23.04 
 
 		 422 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  26.2 
 
 		 406 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0676  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.22 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.438306  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0781  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.22 
 
 		 374 aa  85.5  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.946099  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1685  acetylornithine deacetylase  21 
 
 		 422 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.56308  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0775  hypothetical protein  26.43 
 
 		 409 aa  85.5  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0167319  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>