More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2049 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2049  diaminopimelate aminotransferase  100 
 
 		 409 aa  834    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1865  diaminopimelate aminotransferase  53.81 
 
 		 406 aa  443  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.363137  normal  0.0244826 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1333  diaminopimelate aminotransferase  50.99 
 
 		 407 aa  443  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546409  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0550  diaminopimelate aminotransferase  52.71 
 
 		 409 aa  435  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000714346 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1810  diaminopimelate aminotransferase  50.5 
 
 		 410 aa  426  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1933  diaminopimelate aminotransferase  46.44 
 
 		 413 aa  382  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0068  diaminopimelate aminotransferase  44.09 
 
 		 411 aa  356  3.9999999999999996e-97  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0234  diaminopimelate aminotransferase  40.2 
 
 		 411 aa  347  3e-94  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00102405  normal  0.710692 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0113  diaminopimelate aminotransferase  41 
 
 		 413 aa  330  3e-89  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.239854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  42.86 
 
 		 396 aa  315  7e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  42.03 
 
 		 396 aa  310  4e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0641  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  42.75 
 
 		 411 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  36.19 
 
 		 407 aa  300  4e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1103  diaminopimelate aminotransferase  35.96 
 
 		 407 aa  298  1e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  40.87 
 
 		 421 aa  293  3e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0643  diaminopimelate aminotransferase  34.7 
 
 		 415 aa  286  5.999999999999999e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.166626  hitchhiker  0.00154424 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1275  diaminopimelate aminotransferase  35.42 
 
 		 415 aa  285  8e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000199982  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1441  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.71 
 
 		 404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  34.86 
 
 		 415 aa  281  1e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0709  diaminopimelate aminotransferase  33.49 
 
 		 415 aa  280  2e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.123026  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0836  diaminopimelate aminotransferase  32.62 
 
 		 423 aa  271  1e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000246987  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.41 
 
 		 399 aa  119  7e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.7 
 
 		 395 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.6 
 
 		 398 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6541  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.87 
 
 		 389 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.660078 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0094  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.84 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0144  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.69 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.131428  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.42 
 
 		 399 aa  105  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  29.01 
 
 		 379 aa  102  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0775  hypothetical protein  25.93 
 
 		 409 aa  101  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0167319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  26.87 
 
 		 403 aa  102  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  28.61 
 
 		 386 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0364  acetylornithine deacetylase  28.46 
 
 		 388 aa  98.2  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1109  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.76 
 
 		 409 aa  98.6  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4976  acetylornithine deacetylase  27.84 
 
 		 376 aa  97.1  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0778383 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  28.29 
 
 		 391 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  28.29 
 
 		 386 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.17 
 
 		 410 aa  96.3  8e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  28.42 
 
 		 374 aa  95.5  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  30.53 
 
 		 389 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  26.91 
 
 		 421 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7452  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.43 
 
 		 397 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248803  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  30.45 
 
 		 412 aa  94.4  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0439  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.91 
 
 		 391 aa  94  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1114  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.69 
 
 		 429 aa  94.4  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1098  peptidase dimerisation domain-containing protein  27.57 
 
 		 411 aa  94  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.975986 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  30.25 
 
 		 416 aa  93.6  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3929  peptidase M20  26.2 
 
 		 411 aa  93.2  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.856117  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3650  acetylornithine deacetylase  28.53 
 
 		 380 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  28.36 
 
 		 428 aa  92.8  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  27.73 
 
 		 386 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0389  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.02 
 
 		 395 aa  91.7  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.45697  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  30.45 
 
 		 389 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  30.45 
 
 		 389 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3894  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.02 
 
 		 433 aa  91.3  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4390  peptidase M20  27.2 
 
 		 413 aa  91.3  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  30.45 
 
 		 405 aa  90.9  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  30.45 
 
 		 405 aa  90.9  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  30.45 
 
 		 405 aa  90.9  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1445  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.5 
 
 		 365 aa  90.9  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0181667  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  31.61 
 
 		 586 aa  90.9  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1035  peptidase dimerisation domain protein  29.38 
 
 		 424 aa  90.9  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  30.45 
 
 		 405 aa  90.9  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  28.68 
 
 		 384 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0404  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.25 
 
 		 423 aa  90.1  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0948  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.41 
 
 		 377 aa  90.1  6e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1040  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.37 
 
 		 392 aa  90.1  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1646  peptidase  27.87 
 
 		 401 aa  89.4  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.017723 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  29.81 
 
 		 405 aa  89  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0166  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.92 
 
 		 407 aa  89  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0369  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.04 
 
 		 391 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3442  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.38 
 
 		 422 aa  89.4  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0847  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.46 
 
 		 413 aa  89  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.359888  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0918  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.07 
 
 		 377 aa  88.2  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  27.14 
 
 		 389 aa  88.6  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1758  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.29 
 
 		 439 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0401  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.04 
 
 		 391 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  28.18 
 
 		 384 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2108  peptidase dimerisation domain-containing protein  26.93 
 
 		 430 aa  88.6  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0921136 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  29.75 
 
 		 404 aa  87.8  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1147  acetylornithine deacetylase  28.29 
 
 		 386 aa  87.8  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299531  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  28.32 
 
 		 385 aa  87.8  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1152  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.06 
 
 		 366 aa  87.4  4e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135979  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1162  peptidase M20  27.09 
 
 		 414 aa  87.4  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.988314  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0420  putative acetylornithine deacetylase  22.2 
 
 		 382 aa  87  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  28.57 
 
 		 387 aa  87  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  25.73 
 
 		 392 aa  86.7  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1326  acetylornithine deacetylase  28.36 
 
 		 406 aa  86.3  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000659455  hitchhiker  0.00151978 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  28.57 
 
 		 387 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1422  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.15 
 
 		 423 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  28.11 
 
 		 387 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  26.51 
 
 		 376 aa  85.5  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  27.81 
 
 		 411 aa  85.9  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0353  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.57 
 
 		 410 aa  86.3  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117081  hitchhiker  0.0085825 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25 
 
 		 433 aa  85.5  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2784  peptidase M20  31.09 
 
 		 394 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  28.3 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  25.98 
 
 		 452 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0991  acetylornithine deacetylase  23.54 
 
 		 402 aa  85.1  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>