More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1109 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_3929  peptidase M20  83.37 
 
 
411 aa  695    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.856117  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4390  peptidase M20  80.05 
 
 
413 aa  669    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0775  hypothetical protein  74.82 
 
 
409 aa  644    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0167319  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1114  peptidase dimerisation domain-containing protein  80.38 
 
 
429 aa  667    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1422  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  81.53 
 
 
423 aa  682    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1035  peptidase dimerisation domain protein  80.62 
 
 
424 aa  668    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2108  peptidase dimerisation domain-containing protein  80.48 
 
 
430 aa  692    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0921136 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1109  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 
409 aa  831    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330284  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1098  peptidase dimerisation domain-containing protein  75.43 
 
 
411 aa  629  1e-179  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.975986 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0353  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  74.81 
 
 
410 aa  617  1e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117081  hitchhiker  0.0085825 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0166  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  71.29 
 
 
407 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3295  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.28 
 
 
409 aa  460  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1162  peptidase M20  56.86 
 
 
414 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.988314  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6207  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.42 
 
 
419 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134371  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3442  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  53.01 
 
 
422 aa  439  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6376  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.92 
 
 
419 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6609  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.92 
 
 
419 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0785768 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3470  peptidase M20  54.74 
 
 
424 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3277  peptidase M20:peptidase dimerisation  53.01 
 
 
422 aa  432  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3143  peptidase M20  54.5 
 
 
424 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.138788  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3273  hypothetical protein  54.46 
 
 
424 aa  414  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.425351  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5606  peptidase M20  52.62 
 
 
422 aa  414  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0916  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  51.91 
 
 
423 aa  400  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0720  peptidase M20  52.87 
 
 
424 aa  396  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.611917  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1106  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  98.91 
 
 
184 aa  366  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0802488  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.12 
 
 
395 aa  160  5e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.39 
 
 
398 aa  159  6e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.92 
 
 
399 aa  158  2e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.9 
 
 
399 aa  152  1e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.09 
 
 
442 aa  149  8e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.5 
 
 
410 aa  147  3e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3020  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.24 
 
 
431 aa  133  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.425319 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3894  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.44 
 
 
433 aa  130  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0783  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.82 
 
 
435 aa  127  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.82 
 
 
387 aa  126  6e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0404  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.27 
 
 
423 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1758  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.27 
 
 
439 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01583  acetylornithine deacetylase, hypothetical (Eurofung)  30.61 
 
 
393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2494  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.92 
 
 
423 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0847  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.19 
 
 
413 aa  120  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.359888  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.97 
 
 
400 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0611  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.87 
 
 
389 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261056  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.78 
 
 
389 aa  111  3e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.04 
 
 
413 aa  108  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1036  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.41 
 
 
426 aa  107  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.98683  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  28.65 
 
 
412 aa  106  8e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1915  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.54 
 
 
388 aa  106  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.121037 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2769  peptidase M20  30.25 
 
 
399 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2664  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.84 
 
 
427 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.18198 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  28.72 
 
 
389 aa  104  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1291  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.16 
 
 
378 aa  104  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0030  acetylornithine deacetylase  26.38 
 
 
446 aa  103  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3480  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.79 
 
 
404 aa  102  9e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.5 
 
 
396 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  26.65 
 
 
411 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  25.47 
 
 
422 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4285  acetylornithine deacetylase  27 
 
 
432 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0115964 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1633  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.04 
 
 
403 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.73321  normal  0.191724 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.79 
 
 
433 aa  101  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1441  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.77 
 
 
404 aa  100  4e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  26.12 
 
 
379 aa  100  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1601  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.79 
 
 
387 aa  100  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0549352 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.73 
 
 
400 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2806  peptidase M20  29.7 
 
 
425 aa  100  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2321  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  28.1 
 
 
424 aa  99.8  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0350  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.03 
 
 
385 aa  99.8  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.306111  normal  0.0744523 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  27.57 
 
 
416 aa  99.8  9e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  27.54 
 
 
396 aa  99  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1031  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.89 
 
 
395 aa  99.4  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1635  peptidase M20  30.46 
 
 
400 aa  99.4  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.419911  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.81 
 
 
400 aa  99.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.43 
 
 
388 aa  99.4  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0972  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.89 
 
 
395 aa  99.4  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2049  diaminopimelate aminotransferase  27.76 
 
 
409 aa  98.6  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  26.41 
 
 
380 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  31.25 
 
 
386 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0061  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.54 
 
 
397 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.03403 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  29.92 
 
 
384 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.07 
 
 
388 aa  97.4  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  29.78 
 
 
384 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.37 
 
 
395 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0094  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.48 
 
 
433 aa  95.9  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.713156  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  36.23 
 
 
387 aa  95.9  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0411  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.17 
 
 
437 aa  96.3  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  27.81 
 
 
404 aa  95.5  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  31.46 
 
 
368 aa  95.5  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2918  peptidase M20  29.03 
 
 
389 aa  95.5  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0061  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.78 
 
 
426 aa  94.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.250429  normal  0.531249 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  29.48 
 
 
390 aa  94.4  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  25.39 
 
 
434 aa  94  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  30.93 
 
 
391 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  30.93 
 
 
386 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0095  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.01 
 
 
429 aa  93.6  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276055  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  23.08 
 
 
407 aa  93.2  7e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2569  acetylornithine deacetylase  24.29 
 
 
432 aa  93.2  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.999576  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  28.77 
 
 
369 aa  92.8  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  26.44 
 
 
397 aa  92.8  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0561  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.41 
 
 
407 aa  92.8  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  24.76 
 
 
421 aa  92.4  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.83 
 
 
392 aa  91.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>