More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1762 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  100 
 
 		 411 aa  825    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2796  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.81 
 
 		 397 aa  169  6e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.884075 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.71 
 
 		 396 aa  155  9e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  33.54 
 
 		 402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0076  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.54 
 
 		 404 aa  154  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.53 
 
 		 387 aa  150  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.34 
 
 		 400 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.58 
 
 		 413 aa  146  6e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0256  acetylornithine deacetylase  31.25 
 
 		 385 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  30.75 
 
 		 397 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  31.82 
 
 		 384 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  31.65 
 
 		 397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.75 
 
 		 400 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  30.19 
 
 		 385 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  30.48 
 
 		 397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  33.33 
 
 		 384 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  31.77 
 
 		 586 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  31.77 
 
 		 405 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  31.77 
 
 		 405 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  31.77 
 
 		 405 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.11 
 
 		 393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  31.77 
 
 		 389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  31.77 
 
 		 405 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  31.77 
 
 		 389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  32.91 
 
 		 386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  30.09 
 
 		 390 aa  137  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  28.79 
 
 		 403 aa  136  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  32.59 
 
 		 391 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.56 
 
 		 400 aa  135  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3625  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  31.25 
 
 		 417 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.209482  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  32.27 
 
 		 386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1969  acetylornithine deacetylase  31.47 
 
 		 406 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.850845  normal  0.0303442 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5256  acetylornithine deacetylase  31.47 
 
 		 406 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000221107  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2321  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  30.77 
 
 		 424 aa  134  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  31.18 
 
 		 406 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  31.18 
 
 		 406 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  27.55 
 
 		 422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  31 
 
 		 382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1484  peptidase M20  30.6 
 
 		 391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  30.9 
 
 		 406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2918  peptidase M20  31.46 
 
 		 389 aa  131  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  30.94 
 
 		 405 aa  131  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  28.53 
 
 		 411 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2475  acetylornithine deacetylase  32.3 
 
 		 420 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0713768  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002311  acetylornithine deacetylase  29.82 
 
 		 378 aa  130  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2118  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  28.82 
 
 		 422 aa  130  5.0000000000000004e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00044  acetylornithine deacetylase  29.82 
 
 		 378 aa  130  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  30.9 
 
 		 406 aa  130  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  31.56 
 
 		 387 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  31.21 
 
 		 389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  33.12 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4522  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.13 
 
 		 428 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2278  acetylornithine deacetylase  28.03 
 
 		 422 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  32.5 
 
 		 387 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1326  acetylornithine deacetylase  29.5 
 
 		 406 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000659455  hitchhiker  0.00151978 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3045  acetylornithine deacetylase  28.77 
 
 		 422 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  31.95 
 
 		 386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2314  acetylornithine deacetylase  30.03 
 
 		 416 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306432  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  30.22 
 
 		 392 aa  127  5e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3265  acetylornithine deacetylase  28.54 
 
 		 416 aa  126  6e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.366543 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0995  acetylornithine deacetylase  28.73 
 
 		 419 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  29.82 
 
 		 404 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  32.19 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2318  peptidase M20  31.69 
 
 		 449 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00838569  decreased coverage  0.00000161577 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  31.25 
 
 		 388 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  33.75 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.14 
 
 		 388 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  29.73 
 
 		 404 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0710  peptidase  31.72 
 
 		 394 aa  125  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00268178  normal  0.0281992 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  29.21 
 
 		 398 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  25.87 
 
 		 391 aa  125  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  31.55 
 
 		 387 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  31.18 
 
 		 374 aa  124  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  29.95 
 
 		 412 aa  123  6e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1685  acetylornithine deacetylase  27.32 
 
 		 422 aa  123  7e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.56308  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01583  acetylornithine deacetylase, hypothetical (Eurofung)  29.64 
 
 		 393 aa  122  8e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  30.67 
 
 		 390 aa  122  9e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1869  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.22 
 
 		 375 aa  122  9e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  28.34 
 
 		 381 aa  122  9e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  31.15 
 
 		 380 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  31.66 
 
 		 416 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.78 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1500  peptidase  26.65 
 
 		 394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0406  acetylornithine deacetylase  27.1 
 
 		 424 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0424  M20/DapE family protein YgeY  33.13 
 
 		 413 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  30.91 
 
 		 385 aa  120  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6207  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.9 
 
 		 419 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134371  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  26.36 
 
 		 384 aa  119  7e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4782  acetylornithine deacetylase  28.53 
 
 		 381 aa  119  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0467  acetylornithine deacetylase  27.32 
 
 		 426 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0493  acetylornithine deacetylase  27.32 
 
 		 426 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2405  acetylornithine deacetylase  27.73 
 
 		 422 aa  119  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.741155  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  31.07 
 
 		 387 aa  119  9e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2364  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.65 
 
 		 405 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  31.65 
 
 		 404 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  25.76 
 
 		 384 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0548  acetylornithine deacetylase  27.32 
 
 		 424 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000707223  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.7 
 
 		 395 aa  118  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0190  acetylornithine deacetylase  29.87 
 
 		 383 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00904916  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0126  acetylornithine deacetylase  28.57 
 
 		 389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>