More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0720 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012792  Vapar_5606  peptidase M20  92.22 
 
 
422 aa  791    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0720  peptidase M20  100 
 
 
424 aa  860    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.611917  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3295  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  64.53 
 
 
409 aa  522  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6207  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  61.08 
 
 
419 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134371  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6376  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  61.33 
 
 
419 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6609  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  61.33 
 
 
419 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0785768 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1162  peptidase M20  56.9 
 
 
414 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.988314  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0775  hypothetical protein  54.68 
 
 
409 aa  449  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0167319  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3929  peptidase M20  53.92 
 
 
411 aa  440  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.856117  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0166  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  52.97 
 
 
407 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1098  peptidase dimerisation domain-containing protein  55.53 
 
 
411 aa  434  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.975986 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0353  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  52.76 
 
 
410 aa  433  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117081  hitchhiker  0.0085825 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0916  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.99 
 
 
423 aa  434  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3442  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  53.06 
 
 
422 aa  428  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3470  peptidase M20  54.17 
 
 
424 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1422  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  51.6 
 
 
423 aa  423  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4390  peptidase M20  53.2 
 
 
413 aa  422  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3143  peptidase M20  53.92 
 
 
424 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.138788  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3277  peptidase M20:peptidase dimerisation  52.08 
 
 
422 aa  418  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1109  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  52.87 
 
 
409 aa  412  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330284  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3273  hypothetical protein  55 
 
 
424 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.425351  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2108  peptidase dimerisation domain-containing protein  48.5 
 
 
430 aa  402  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0921136 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1035  peptidase dimerisation domain protein  50.72 
 
 
424 aa  393  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1114  peptidase dimerisation domain-containing protein  50.48 
 
 
429 aa  390  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1106  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  47.51 
 
 
184 aa  158  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0802488  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.78 
 
 
395 aa  146  6e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.96 
 
 
398 aa  146  8.000000000000001e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.32 
 
 
399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.29 
 
 
442 aa  137  5e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.22 
 
 
399 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01583  acetylornithine deacetylase, hypothetical (Eurofung)  31.21 
 
 
393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0352078 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.89 
 
 
410 aa  127  5e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0847  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.59 
 
 
413 aa  124  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.359888  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3020  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.66 
 
 
431 aa  116  8.999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.425319 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1152  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.81 
 
 
366 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135979  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3492  acetylornithine deacetylase  27.96 
 
 
432 aa  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152448  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0783  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.11 
 
 
435 aa  113  7.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0404  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.12 
 
 
423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1758  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.85 
 
 
439 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.29 
 
 
370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0240606  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  28.57 
 
 
411 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4285  acetylornithine deacetylase  28.97 
 
 
432 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0115964 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3135  acetylornithine deacetylase  28.7 
 
 
432 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.03 
 
 
388 aa  110  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2784  peptidase M20  31.37 
 
 
394 aa  110  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.18 
 
 
387 aa  109  8.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.73 
 
 
413 aa  108  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0990  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.27 
 
 
365 aa  107  3e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  29.88 
 
 
404 aa  107  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  29.79 
 
 
412 aa  107  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  30.12 
 
 
416 aa  107  5e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3894  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.33 
 
 
433 aa  107  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2313  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.28 
 
 
389 aa  107  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0897692 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.39 
 
 
389 aa  105  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2321  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  29.02 
 
 
424 aa  103  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  29.22 
 
 
369 aa  103  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2569  acetylornithine deacetylase  27.02 
 
 
432 aa  103  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.999576  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0439  acetylornithine deacetylase (ArgE)  33.23 
 
 
391 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.5 
 
 
395 aa  102  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0627  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.87 
 
 
365 aa  102  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.119075  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2494  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.67 
 
 
423 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0369  acetylornithine deacetylase (ArgE)  33.23 
 
 
391 aa  100  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0246  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.15 
 
 
363 aa  100  7e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  29.85 
 
 
368 aa  99.8  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.85 
 
 
400 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  28.61 
 
 
380 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0268  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.34 
 
 
398 aa  99.4  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1445  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.01 
 
 
365 aa  99.4  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0181667  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  31.03 
 
 
404 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.55 
 
 
400 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  29.75 
 
 
411 aa  98.6  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0255  peptidase M20  28.13 
 
 
402 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3650  acetylornithine deacetylase  30.18 
 
 
380 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0995  acetylornithine deacetylase  29.04 
 
 
419 aa  98.2  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717305  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  27.46 
 
 
390 aa  97.8  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0401  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.52 
 
 
391 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309762  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  30 
 
 
397 aa  97.1  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1069  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.61 
 
 
365 aa  97.1  5e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.765563  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1036  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.33 
 
 
426 aa  97.1  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.98683  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  28.94 
 
 
397 aa  97.1  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1192  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.89 
 
 
365 aa  96.7  6e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.467708  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1014  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.76 
 
 
393 aa  97.1  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00488739 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2769  peptidase M20  29.72 
 
 
399 aa  97.1  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  29.78 
 
 
397 aa  96.7  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0688  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.16 
 
 
365 aa  96.3  9e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  30.03 
 
 
382 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0117  peptidase  26.4 
 
 
401 aa  96.3  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0030  acetylornithine deacetylase  27.11 
 
 
446 aa  95.5  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4949  peptidase M20  27.3 
 
 
365 aa  95.9  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  27.6 
 
 
391 aa  95.1  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3347  acetylornithine deacetylase  29.07 
 
 
436 aa  95.5  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  28.86 
 
 
379 aa  95.1  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  25.88 
 
 
364 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  26.06 
 
 
422 aa  94.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  28.61 
 
 
403 aa  94.7  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.48 
 
 
400 aa  94.7  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2918  peptidase M20  29.88 
 
 
389 aa  94.4  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0611  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.27 
 
 
389 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261056  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.65 
 
 
393 aa  94.4  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2601  acetylornithine deacetylase  29.1 
 
 
389 aa  94  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.265053  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>