More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4949 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4949  peptidase M20  100 
 
 
365 aa  749    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  44.57 
 
 
364 aa  311  2e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  44.1 
 
 
369 aa  308  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1025  peptidase M20  42.54 
 
 
362 aa  281  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0327  Acetylornithine deacetylase/Succinyl- diaminopimelate desuccinylase and related deacylase-like protein  32.14 
 
 
434 aa  172  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2473  peptidase M20  34.09 
 
 
356 aa  146  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  31.71 
 
 
378 aa  142  8e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.93 
 
 
413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.47 
 
 
399 aa  124  3e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.85 
 
 
398 aa  123  6e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1186  M20/M25/M40 family peptidase  27.93 
 
 
363 aa  122  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000390537  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.64 
 
 
395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  32.05 
 
 
384 aa  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  31.78 
 
 
384 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10333  metallopeptidase, putative (JCVI)  28.8 
 
 
753 aa  117  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.85 
 
 
399 aa  116  6e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1635  peptidase M20  30.64 
 
 
400 aa  116  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.419911  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.92 
 
 
433 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.28 
 
 
388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1036  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.09 
 
 
426 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.98683  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01583  acetylornithine deacetylase, hypothetical (Eurofung)  29.39 
 
 
393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  31.21 
 
 
386 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2083  acetylornithine deacetylase  30.05 
 
 
388 aa  110  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151989  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  30.42 
 
 
368 aa  109  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4782  acetylornithine deacetylase  28.91 
 
 
381 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  28.84 
 
 
386 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0094  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.91 
 
 
433 aa  108  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.713156  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  30.03 
 
 
382 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1093  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.02 
 
 
356 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1255  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  29.51 
 
 
428 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  30.94 
 
 
386 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  32.03 
 
 
411 aa  107  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  28.22 
 
 
381 aa  106  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  30.26 
 
 
387 aa  106  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  30.57 
 
 
391 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3865  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.95 
 
 
433 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.838236  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  30.94 
 
 
405 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0095  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.35 
 
 
429 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276055  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  28.3 
 
 
389 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  29.91 
 
 
419 aa  103  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  28.99 
 
 
388 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  29.74 
 
 
404 aa  102  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0874  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.78 
 
 
376 aa  102  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.254055  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  29.28 
 
 
398 aa  103  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0672  peptidase M20  28.7 
 
 
366 aa  102  7e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  28.57 
 
 
387 aa  103  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11226  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.27 
 
 
354 aa  102  9e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  27.64 
 
 
390 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.98 
 
 
387 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  30.31 
 
 
405 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  30.34 
 
 
586 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  30.31 
 
 
405 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  27.74 
 
 
384 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  30.31 
 
 
405 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  30.31 
 
 
405 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  30.31 
 
 
389 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  30.31 
 
 
389 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.81 
 
 
374 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0351363  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.78 
 
 
396 aa  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4012  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.03 
 
 
366 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75558  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4242  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.03 
 
 
366 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156168 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4086  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.03 
 
 
366 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.875683  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3755  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.25 
 
 
431 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0601129  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  29.11 
 
 
387 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4252  acetylornithine deacetylase  27.35 
 
 
383 aa  100  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.84 
 
 
400 aa  99.8  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25960  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.47 
 
 
359 aa  100  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129356  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4061  acetylornithine deacetylase  27.35 
 
 
383 aa  99.4  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  28.44 
 
 
397 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  27.39 
 
 
384 aa  99  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0194  acetylornithine deacetylase  31.94 
 
 
382 aa  98.6  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.13 
 
 
410 aa  98.2  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  27.99 
 
 
406 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3295  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.67 
 
 
409 aa  98.2  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  28.8 
 
 
387 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  27.99 
 
 
406 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  29.7 
 
 
387 aa  98.6  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  28.48 
 
 
390 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06290  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.91 
 
 
358 aa  97.8  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  29.9 
 
 
387 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4515  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.88 
 
 
354 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.113007  normal  0.287636 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  27.44 
 
 
397 aa  97.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2525  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.65 
 
 
378 aa  97.1  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.36 
 
 
371 aa  97.4  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.390833 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0573  acetylornithine deacetylase  27.75 
 
 
386 aa  97.1  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.280832  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4029  acetylornithine deacetylase  29.08 
 
 
383 aa  97.1  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.885326  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  27.99 
 
 
406 aa  97.1  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1969  acetylornithine deacetylase  27.67 
 
 
406 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.850845  normal  0.0303442 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  28.34 
 
 
404 aa  96.7  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  27.02 
 
 
383 aa  96.3  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.268381 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1200  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.72 
 
 
354 aa  96.3  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03842  acetylornithine deacetylase  27.02 
 
 
383 aa  96.3  8e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0420  putative acetylornithine deacetylase  23.61 
 
 
382 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1291  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.86 
 
 
378 aa  96.3  8e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03791  hypothetical protein  27.02 
 
 
383 aa  96.3  8e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3492  acetylornithine deacetylase  26.21 
 
 
432 aa  96.3  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152448  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3411  acetylornithine deacetylase  28.61 
 
 
406 aa  96.3  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11210  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.57 
 
 
370 aa  96.3  8e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5606  peptidase M20  27.45 
 
 
422 aa  96.3  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  27.02 
 
 
383 aa  96.3  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>