More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0327 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0327  Acetylornithine deacetylase/Succinyl- diaminopimelate desuccinylase and related deacylase-like protein  100 
 
 
434 aa  864    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2473  peptidase M20  63.01 
 
 
356 aa  412  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1025  peptidase M20  34.13 
 
 
362 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  36.21 
 
 
369 aa  176  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4949  peptidase M20  32.14 
 
 
365 aa  169  8e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  35.59 
 
 
364 aa  168  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  33.44 
 
 
378 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1186  M20/M25/M40 family peptidase  29.38 
 
 
363 aa  134  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000390537  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0672  peptidase M20  30.61 
 
 
366 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1019  peptidase dimerisation domain protein  31.33 
 
 
411 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.675627 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1635  peptidase M20  32.92 
 
 
400 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.419911  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.4 
 
 
433 aa  96.3  9e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.22 
 
 
413 aa  87.8  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0770776 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05749  putative acetylornithine deacetylase (Eurofung)  29.79 
 
 
424 aa  85.9  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0187608 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2196  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.95 
 
 
385 aa  85.5  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  29.95 
 
 
419 aa  81.3  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0316  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.18 
 
 
402 aa  80.9  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.84 
 
 
398 aa  79.3  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3336  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.99 
 
 
383 aa  77.4  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0627884 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0990  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.25 
 
 
365 aa  77.4  0.0000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0350  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.57 
 
 
385 aa  77  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.306111  normal  0.0744523 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3162  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.2 
 
 
375 aa  76.6  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000827739  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1471  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.39 
 
 
378 aa  76.6  0.0000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1169  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.2 
 
 
375 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0085644  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0573  acetylornithine deacetylase  27.74 
 
 
386 aa  76.3  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.280832  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.85 
 
 
399 aa  75.9  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.98 
 
 
442 aa  75.9  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2580  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  31.05 
 
 
357 aa  75.5  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0401  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.08 
 
 
391 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309762  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  31.01 
 
 
384 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0474  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.18 
 
 
404 aa  74.3  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.987794  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  31.01 
 
 
384 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1152  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.14 
 
 
366 aa  73.9  0.000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135979  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0364  acetylornithine deacetylase  28.86 
 
 
388 aa  73.9  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.51 
 
 
399 aa  73.6  0.000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  23.08 
 
 
384 aa  73.2  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  27.95 
 
 
416 aa  73.2  0.000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2069  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.02 
 
 
391 aa  73.2  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370348  normal  0.325609 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0411  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.49 
 
 
437 aa  73.2  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0439  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.34 
 
 
391 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  30.3 
 
 
397 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0967  peptidase dimerization domain protein  27.56 
 
 
385 aa  72.4  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1093  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.27 
 
 
356 aa  72  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1255  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0631  peptidase M20  39.55 
 
 
433 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3116  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.85 
 
 
395 aa  71.6  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.210379  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0171  peptidase M20  23.21 
 
 
341 aa  72.4  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.19921  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.48 
 
 
395 aa  71.2  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6551  peptidase M20  27.78 
 
 
354 aa  71.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0369  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.27 
 
 
391 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2967  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.36 
 
 
375 aa  70.9  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.546622 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2019  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.27 
 
 
377 aa  70.9  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00489333 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0072  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.38 
 
 
354 aa  70.9  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  28.44 
 
 
389 aa  71.2  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2126  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.56 
 
 
376 aa  70.9  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.521922  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0012  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.77 
 
 
379 aa  70.9  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  25.61 
 
 
406 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  25.86 
 
 
406 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  25.61 
 
 
406 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1892  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.86 
 
 
391 aa  70.5  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1868  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.53 
 
 
375 aa  70.5  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4515  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.63 
 
 
354 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.113007  normal  0.287636 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  27.04 
 
 
412 aa  70.1  0.00000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3480  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.5 
 
 
404 aa  70.1  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5256  acetylornithine deacetylase  26.17 
 
 
406 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000221107  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4562  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.72 
 
 
388 aa  69.7  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1351  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.76 
 
 
379 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.42322 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  31.6 
 
 
404 aa  69.7  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  22.77 
 
 
384 aa  69.7  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  25.86 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3695  acetylornithine deacetylase  30.04 
 
 
364 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1969  acetylornithine deacetylase  25.86 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.850845  normal  0.0303442 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2469  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.63 
 
 
379 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167643  hitchhiker  0.0000634543 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3430  peptidase M20  29.34 
 
 
364 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1668  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.56 
 
 
401 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154111  normal  0.0474135 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4012  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.97 
 
 
366 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75558  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4242  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.97 
 
 
366 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156168 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4086  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.97 
 
 
366 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.875683  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1326  acetylornithine deacetylase  25.86 
 
 
406 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000659455  hitchhiker  0.00151978 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5339  peptidase dimerisation domain protein  27.87 
 
 
377 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538527  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3693  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.36 
 
 
375 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4369  glutamate carboxypeptidase  27.68 
 
 
424 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407974  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0095  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.7 
 
 
429 aa  67.8  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276055  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2717  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.57 
 
 
391 aa  67.8  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11396  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  33.68 
 
 
368 aa  67.8  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4870  glutamate carboxypeptidase  26.34 
 
 
417 aa  68.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120273  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  26.69 
 
 
387 aa  67.8  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02363  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.36 
 
 
375 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1198  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.36 
 
 
375 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2618  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.36 
 
 
375 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2843  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.36 
 
 
375 aa  67.8  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02325  hypothetical protein  25.36 
 
 
375 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2180  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.92 
 
 
354 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136819  normal  0.30884 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1205  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.36 
 
 
375 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.270871  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2602  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.36 
 
 
375 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2751  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.36 
 
 
375 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.77 
 
 
377 aa  67.4  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1819  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.52 
 
 
382 aa  67  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.578155  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1496  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.52 
 
 
382 aa  67  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0266  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.33 
 
 
395 aa  67  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3894  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.6 
 
 
433 aa  67  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>